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TMV侵染烟草基因差异表达的cDNA-AFLP分析
被引量：
9
1
作者
陈荣平
刘磊
+5 位作者
万秀清
邱恩建
王春军
宋宝刚
颜培强
杨铁钊
《作物学报》
CAS
CSCD
北大核心
2012年第1期62-70,共9页
以烤烟品种龙江925[高抗烟草普通花叶病(TMV)]接种TMV的叶片为材料,选用240对引物组合的扩增,获得约9500个转录基因片段,经过克隆测序最终获得了12个诱导表达片段,它们与核酸代谢、蛋白质合成与修饰、能量代谢、胁迫响应、细胞内运输、...
以烤烟品种龙江925[高抗烟草普通花叶病(TMV)]接种TMV的叶片为材料,选用240对引物组合的扩增,获得约9500个转录基因片段,经过克隆测序最终获得了12个诱导表达片段,它们与核酸代谢、蛋白质合成与修饰、能量代谢、胁迫响应、细胞内运输、糖代谢等相关。利用荧光定量PCR分析诱导表达片段TIF2在0～72h之间5个时间点(0、12、24、48和72h)的基因差异表达,证实了所获得的基因序列为真实诱导的表达序列。对此序列进行RACE,最终获得全长cDNA序列,全序列857bp,预测的编码区在101～613bp之间,共编码170个氨基酸。经Blastn、Blastp比对分析,在烟草中没有获得其同源序列,确定该基因是在烟草中发现的与抗TMV相关的新基因。
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关键词
烟草
TMV
差异基因表达
CDNA-AFLP
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职称材料
题名
TMV侵染烟草基因差异表达的cDNA-AFLP分析
被引量：
9
1
作者
陈荣平
刘磊
万秀清
邱恩建
王春军
宋宝刚
颜培强
杨铁钊
机构
河南农业大学烟草学院
黑龙江省烟草公司
牡丹江
烟草科学研究所
牡丹江市疾病防控中心
出处
《作物学报》
CAS
CSCD
北大核心
2012年第1期62-70,共9页
基金
中国烟草总公司面上项目(HN200903)资助
文摘
以烤烟品种龙江925[高抗烟草普通花叶病(TMV)]接种TMV的叶片为材料,选用240对引物组合的扩增,获得约9500个转录基因片段,经过克隆测序最终获得了12个诱导表达片段,它们与核酸代谢、蛋白质合成与修饰、能量代谢、胁迫响应、细胞内运输、糖代谢等相关。利用荧光定量PCR分析诱导表达片段TIF2在0～72h之间5个时间点(0、12、24、48和72h)的基因差异表达,证实了所获得的基因序列为真实诱导的表达序列。对此序列进行RACE,最终获得全长cDNA序列,全序列857bp,预测的编码区在101～613bp之间,共编码170个氨基酸。经Blastn、Blastp比对分析,在烟草中没有获得其同源序列,确定该基因是在烟草中发现的与抗TMV相关的新基因。
关键词
烟草
TMV
差异基因表达
CDNA-AFLP
Keywords
Tobacco
TMV
Differentially Expressed Genes
cDNA-AFLP
分类号
S435.72 [农业科学—农业昆虫与害虫防治]
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职称材料
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
TMV侵染烟草基因差异表达的cDNA-AFLP分析
陈荣平
刘磊
万秀清
邱恩建
王春军
宋宝刚
颜培强
杨铁钊
《作物学报》
CAS
CSCD
北大核心
2012
9
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