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利用AFLP进行“甘蔗属复合体”系统演化和亲缘关系研究
被引量:
35
1
作者
蔡青
范源洪
+3 位作者
Aitken K
Piperidis G
McIntyre C L
Jackson P
《作物学报》
CAS
CSCD
北大核心
2005年第5期551-559,共9页
采用AFLP分子标记技术,对“甘蔗属复合体”中4个属16个种的6 9份来自中国和澳大利亚的甘蔗种质资源材料进行系统演化和亲缘关系分析。2对AFLP引物共检测到173个标记,其中172个为多态标记,多态率达99 4 % ;通过计算Jaccard相似性系数,用U...
采用AFLP分子标记技术,对“甘蔗属复合体”中4个属16个种的6 9份来自中国和澳大利亚的甘蔗种质资源材料进行系统演化和亲缘关系分析。2对AFLP引物共检测到173个标记,其中172个为多态标记,多态率达99 4 % ;通过计算Jaccard相似性系数,用UPGMA和PCA法构建了分子系统树和效应图。结果表明:(1)属间亲缘关系中,甘蔗属与芒属较近,与河八王属和蔗茅属较远,而河八王属与蔗茅属较近;(2 )甘蔗属内,细茎野生种与其他种关系较远,其中,栽培品种与热带种关系较近,中国种和印度种关系较近,而大茎野生种自聚为一族,与上述4种分离;(3)蔗茅属内,除蔗茅种和滇蔗茅种外,无论是中国斑茅(云南、海南)还是印度尼西亚斑茅,都与蔗茅属其他种聚在一起,其中与E procerus的关系最近,与E bengalense和E sarpet种次之;由斑茅与这3个种构成的群体与由E elephantinus和E ravennae构成的群体相对分离,形成了明显的2个组群。再次表明斑茅应列入蔗茅属,建议我国甘蔗学者采纳国外分类命名(E arundinaceus) ,以能更好地开展斑茅的研究和杂交育种利用并与国际接轨;(4)蔗茅和滇蔗茅均没有聚类到蔗茅属类群中,而分别独立位于系统树2大枝系上。蔗茅与甘蔗属亲缘关系较近,与芒属亲缘关系次之,与蔗茅属和河八王属关系较远;滇蔗茅与河八王属亲缘关系?
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关键词
甘蔗属复合体
系统演化
AFLP
在线阅读
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职称材料
甘蔗SSR和AFLP分子遗传连锁图谱构建
被引量:
37
2
作者
刘新龙
毛钧
+5 位作者
陆鑫
马丽
Karen Sarah AITKEN
Phillip Andrew JACKSON
蔡青
范源洪
《作物学报》
CAS
CSCD
北大核心
2010年第1期177-183,共7页
采用甘蔗商业品种Co419与野生种割手密Y75/1/2杂交,获得269个单株,组成F1群体,用F102/356与商业品种ROC25回交获得266个单株,组成BC1群体。利用筛选的多态性条带丰富的36对SSR引物和12对AFLP引物,对两个群体进行PCR扩增和分子遗传连锁分...
采用甘蔗商业品种Co419与野生种割手密Y75/1/2杂交,获得269个单株,组成F1群体,用F102/356与商业品种ROC25回交获得266个单株,组成BC1群体。利用筛选的多态性条带丰富的36对SSR引物和12对AFLP引物,对两个群体进行PCR扩增和分子遗传连锁分析,构建甘蔗分子遗传连锁图谱。用F1群体获得630个分离标记,经χ2检测,298个标记为单双剂量标记,占总标记数的47%;用BC1群体获得571个分离标记,有264个标记为单双剂量标记,占总标记数的46%;4个亲本获得单双剂量标记的数量依次为Co419>02/356>Y75/1/2>ROC25。在LOD≥5.0,相邻标记遗传距离≤40cM的条件下,F1群体有134个单双剂量标记被纳入55个连锁群,其中39个连锁群归属8个同源组,16个未列入,总遗传距离为1458.3cM,标记间平均图距为10.9cM;BC1群体有133个单双剂量标记被纳入47个连锁群,其中34个连锁群归属于8个同源组,13个连锁群未列入,总遗传距离为1059.6cM,标记间平均图距为8.0cM。从4个亲本单双剂量标记进入的连锁群数来看,Co419最多,归入34个连锁群,其次为Y75/1/2,归入20个连锁群,第3为02/356和ROC25,归入19个连锁群。研究结果表明,从单双剂量标记比例、形成连锁群数量、总遗传距离来看,F1群体构图质量要优于BC1群体。
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关键词
甘蔗
遗传连锁图谱
SSR
AFLP
群体
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职称材料
题名
利用AFLP进行“甘蔗属复合体”系统演化和亲缘关系研究
被引量:
35
1
作者
蔡青
范源洪
Aitken K
Piperidis G
McIntyre C L
Jackson P
机构
云南省农业
科学
院甘蔗
研究
所
澳大利亚联邦
科学与
工业
研究
组织
(
csiro
)
植物
研究
中心
澳大利亚
甘蔗试验管理局(BSES)
出处
《作物学报》
CAS
CSCD
北大核心
2005年第5期551-559,共9页
基金
云南省自然科学基金资助项目 :甘蔗主要目标性状基因的分子标记(1999COO2 2G)
澳大利亚国际农业研究中心 (ACIAR)资助项目 :甘蔗种质资源的改良和利用研究 (CS1 2 0 0 0 0 3 8)。
文摘
采用AFLP分子标记技术,对“甘蔗属复合体”中4个属16个种的6 9份来自中国和澳大利亚的甘蔗种质资源材料进行系统演化和亲缘关系分析。2对AFLP引物共检测到173个标记,其中172个为多态标记,多态率达99 4 % ;通过计算Jaccard相似性系数,用UPGMA和PCA法构建了分子系统树和效应图。结果表明:(1)属间亲缘关系中,甘蔗属与芒属较近,与河八王属和蔗茅属较远,而河八王属与蔗茅属较近;(2 )甘蔗属内,细茎野生种与其他种关系较远,其中,栽培品种与热带种关系较近,中国种和印度种关系较近,而大茎野生种自聚为一族,与上述4种分离;(3)蔗茅属内,除蔗茅种和滇蔗茅种外,无论是中国斑茅(云南、海南)还是印度尼西亚斑茅,都与蔗茅属其他种聚在一起,其中与E procerus的关系最近,与E bengalense和E sarpet种次之;由斑茅与这3个种构成的群体与由E elephantinus和E ravennae构成的群体相对分离,形成了明显的2个组群。再次表明斑茅应列入蔗茅属,建议我国甘蔗学者采纳国外分类命名(E arundinaceus) ,以能更好地开展斑茅的研究和杂交育种利用并与国际接轨;(4)蔗茅和滇蔗茅均没有聚类到蔗茅属类群中,而分别独立位于系统树2大枝系上。蔗茅与甘蔗属亲缘关系较近,与芒属亲缘关系次之,与蔗茅属和河八王属关系较远;滇蔗茅与河八王属亲缘关系?
关键词
甘蔗属复合体
系统演化
AFLP
Keywords
Saccharum Complex
Phylogenetic Relationships
AFLP
分类号
S566.1 [农业科学—作物学]
在线阅读
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职称材料
题名
甘蔗SSR和AFLP分子遗传连锁图谱构建
被引量:
37
2
作者
刘新龙
毛钧
陆鑫
马丽
Karen Sarah AITKEN
Phillip Andrew JACKSON
蔡青
范源洪
机构
云南省甘蔗遗传改良重点实验室
云南省农业
科学
院甘蔗
研究
所
澳大利亚联邦
科学与
工业
研究
组织
(
csiro
)
植物
研究
中心
云南省农业
科学
院生物技术与种质资源
研究
所
出处
《作物学报》
CAS
CSCD
北大核心
2010年第1期177-183,共7页
基金
中-澳合作项目(CS1/2000/038)
云南省应用基础研究计划重点项目(2006C0013Z)
国家科技基础条件平台工作项目子专题(2007DKA21002-11)资助
文摘
采用甘蔗商业品种Co419与野生种割手密Y75/1/2杂交,获得269个单株,组成F1群体,用F102/356与商业品种ROC25回交获得266个单株,组成BC1群体。利用筛选的多态性条带丰富的36对SSR引物和12对AFLP引物,对两个群体进行PCR扩增和分子遗传连锁分析,构建甘蔗分子遗传连锁图谱。用F1群体获得630个分离标记,经χ2检测,298个标记为单双剂量标记,占总标记数的47%;用BC1群体获得571个分离标记,有264个标记为单双剂量标记,占总标记数的46%;4个亲本获得单双剂量标记的数量依次为Co419>02/356>Y75/1/2>ROC25。在LOD≥5.0,相邻标记遗传距离≤40cM的条件下,F1群体有134个单双剂量标记被纳入55个连锁群,其中39个连锁群归属8个同源组,16个未列入,总遗传距离为1458.3cM,标记间平均图距为10.9cM;BC1群体有133个单双剂量标记被纳入47个连锁群,其中34个连锁群归属于8个同源组,13个连锁群未列入,总遗传距离为1059.6cM,标记间平均图距为8.0cM。从4个亲本单双剂量标记进入的连锁群数来看,Co419最多,归入34个连锁群,其次为Y75/1/2,归入20个连锁群,第3为02/356和ROC25,归入19个连锁群。研究结果表明,从单双剂量标记比例、形成连锁群数量、总遗传距离来看,F1群体构图质量要优于BC1群体。
关键词
甘蔗
遗传连锁图谱
SSR
AFLP
群体
Keywords
Sugarcane
Genetic linkage map
SSR
AFL-P
Population
分类号
S566.1 [农业科学—作物学]
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职称材料
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
利用AFLP进行“甘蔗属复合体”系统演化和亲缘关系研究
蔡青
范源洪
Aitken K
Piperidis G
McIntyre C L
Jackson P
《作物学报》
CAS
CSCD
北大核心
2005
35
在线阅读
下载PDF
职称材料
2
甘蔗SSR和AFLP分子遗传连锁图谱构建
刘新龙
毛钧
陆鑫
马丽
Karen Sarah AITKEN
Phillip Andrew JACKSON
蔡青
范源洪
《作物学报》
CAS
CSCD
北大核心
2010
37
在线阅读
下载PDF
职称材料
已选择
0
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