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青藏高原5种害鼠vkorc1基因的测序分析
被引量:
4
1
作者
赵芳
张同作
+4 位作者
苏建平
慈海鑫
李生庆
李志宁
林恭华
《草业科学》
CAS
CSCD
北大核心
2016年第6期1206-1212,共7页
维生素K环氧化物还原酶复合物1基因(vkorc1)的变异是导致鼠类对抗凝血杀鼠剂产生抗性的主要原因。本研究利用转录组测序的方法,分析青藏高原地区5种主要害鼠——高原鼢鼠(Eospalax baileyi)、高原鼠兔(Ochotona curzoniae)、长尾...
维生素K环氧化物还原酶复合物1基因(vkorc1)的变异是导致鼠类对抗凝血杀鼠剂产生抗性的主要原因。本研究利用转录组测序的方法,分析青藏高原地区5种主要害鼠——高原鼢鼠(Eospalax baileyi)、高原鼠兔(Ochotona curzoniae)、长尾仓鼠(Cricetulus longicaudatus)、青海田鼠(Lasiopodomys fuscus)和喜马拉雅旱獭(Marmota himalayana)的vkorc1基因序列信息。同时,采集5个种群共54只高原鼢鼠,对vkorc1基因全序列进行测序分析。结果显示,从转录组组装结果中成功获得5种动物的vkorc1基因编码区全序列,其中青海田鼠、长尾仓鼠、高原鼢鼠vkorc1基因编码区长度为486bp,喜马拉雅旱獭和高原鼠兔为492bp;在DNA序列水平上,5种高原动物存在143个变异位点,与大鼠的序列相似性为80.1%~90.7%,而与小鼠的序列相似性为79.7%~89.8%。在氨基酸序列水平上,5种高原动物存在37个变异位点,大鼠的序列相似性为84.0%~92.0%,而与小鼠的序列相似性为85.9%~92.0%;未发现与已知抗凝血杀鼠剂抗性相关的氨基酸位点。对5个种群54只高原鼢鼠vkorc1基因全序列的测序分析显示,比对后的全长为1 808bp,共检测到8个变异位点,其中两个为插入缺失位点,全部变异都发生在内含子区。本研究首次以基因序列为分析对象,可以为青藏高原地区的鼠害防治提供关键基础资料。
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关键词
抗凝血杀鼠剂抗药性
VKORC1
序列变异
青藏高原
高原鼢鼠
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题名
青藏高原5种害鼠vkorc1基因的测序分析
被引量:
4
1
作者
赵芳
张同作
苏建平
慈海鑫
李生庆
李志宁
林恭华
机构
中国科学院西北高原生物研究所
中国科学院大学
潍坊滨海开发区管委会
青海省畜牧兽医科学院
出处
《草业科学》
CAS
CSCD
北大核心
2016年第6期1206-1212,共7页
基金
青海省科技支撑计划项目--青藏高原草地鼠害综合防控技术集成与示范(2014-NS-113)
青海省科技项目--贵南县退化草地恢复治理及生态畜牧业关键技术集成与应用(2014-NS-118)
文摘
维生素K环氧化物还原酶复合物1基因(vkorc1)的变异是导致鼠类对抗凝血杀鼠剂产生抗性的主要原因。本研究利用转录组测序的方法,分析青藏高原地区5种主要害鼠——高原鼢鼠(Eospalax baileyi)、高原鼠兔(Ochotona curzoniae)、长尾仓鼠(Cricetulus longicaudatus)、青海田鼠(Lasiopodomys fuscus)和喜马拉雅旱獭(Marmota himalayana)的vkorc1基因序列信息。同时,采集5个种群共54只高原鼢鼠,对vkorc1基因全序列进行测序分析。结果显示,从转录组组装结果中成功获得5种动物的vkorc1基因编码区全序列,其中青海田鼠、长尾仓鼠、高原鼢鼠vkorc1基因编码区长度为486bp,喜马拉雅旱獭和高原鼠兔为492bp;在DNA序列水平上,5种高原动物存在143个变异位点,与大鼠的序列相似性为80.1%~90.7%,而与小鼠的序列相似性为79.7%~89.8%。在氨基酸序列水平上,5种高原动物存在37个变异位点,大鼠的序列相似性为84.0%~92.0%,而与小鼠的序列相似性为85.9%~92.0%;未发现与已知抗凝血杀鼠剂抗性相关的氨基酸位点。对5个种群54只高原鼢鼠vkorc1基因全序列的测序分析显示,比对后的全长为1 808bp,共检测到8个变异位点,其中两个为插入缺失位点,全部变异都发生在内含子区。本研究首次以基因序列为分析对象,可以为青藏高原地区的鼠害防治提供关键基础资料。
关键词
抗凝血杀鼠剂抗药性
VKORC1
序列变异
青藏高原
高原鼢鼠
Keywords
resistance to anticoagulant rodenticides
vkorc1
sequence variation
Qinghai-Tibet Plateau
plateau zokor
分类号
S812.6 [农业科学—草业科学]
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题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
青藏高原5种害鼠vkorc1基因的测序分析
赵芳
张同作
苏建平
慈海鑫
李生庆
李志宁
林恭华
《草业科学》
CAS
CSCD
北大核心
2016
4
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