LATERAL ORGAN BOUNDARIES DOMAIN(LBD)家族是含有高度保守的LOB结构域的一类植物特有转录因子,参与植物的生长代谢以及多种逆境胁迫应答等过程。本研究通过生物信息学方法对葡萄LBD基因家族中的VvLBD35和VvLBD36进行基因结构和进化关...LATERAL ORGAN BOUNDARIES DOMAIN(LBD)家族是含有高度保守的LOB结构域的一类植物特有转录因子,参与植物的生长代谢以及多种逆境胁迫应答等过程。本研究通过生物信息学方法对葡萄LBD基因家族中的VvLBD35和VvLBD36进行基因结构和进化关系分析,并利用qRT-PCR技术检测两个基因的组织表达模式以及在干旱、高盐、高温和低温条件下的诱导表达模式。结果显示,VvLBD35和VvLBD36均含有α-螺旋、无规则卷曲和β-转角结构,VvLBD36还含有较多的β-折叠结构;VvLBD35和VvLBD36与拟南芥、水稻、玉米、柑橘和番茄等植物中的LBD蛋白都有较高的同源性;VvLBD35和VvLBD36的启动子区含有多种胁迫、激素以及生长发育相关的应答元件;VvLBD35和VvLBD36在根、茎、叶中均有不同程度的表达,且均在叶中表达量最高,约是根和茎中的2~8倍;诱导表达模式分析表明,VvLBD35受高温诱导最为显著,下调至约为对照的6%,而VvLBD36受高盐和高温的诱导最为显著,分别上调至对照的5.67倍和14.29倍。本研究为进一步深入揭示VvLBD35和VvLBD36的生物学功能奠定了实验基础。展开更多
文摘LATERAL ORGAN BOUNDARIES DOMAIN(LBD)家族是含有高度保守的LOB结构域的一类植物特有转录因子,参与植物的生长代谢以及多种逆境胁迫应答等过程。本研究通过生物信息学方法对葡萄LBD基因家族中的VvLBD35和VvLBD36进行基因结构和进化关系分析,并利用qRT-PCR技术检测两个基因的组织表达模式以及在干旱、高盐、高温和低温条件下的诱导表达模式。结果显示,VvLBD35和VvLBD36均含有α-螺旋、无规则卷曲和β-转角结构,VvLBD36还含有较多的β-折叠结构;VvLBD35和VvLBD36与拟南芥、水稻、玉米、柑橘和番茄等植物中的LBD蛋白都有较高的同源性;VvLBD35和VvLBD36的启动子区含有多种胁迫、激素以及生长发育相关的应答元件;VvLBD35和VvLBD36在根、茎、叶中均有不同程度的表达,且均在叶中表达量最高,约是根和茎中的2~8倍;诱导表达模式分析表明,VvLBD35受高温诱导最为显著,下调至约为对照的6%,而VvLBD36受高盐和高温的诱导最为显著,分别上调至对照的5.67倍和14.29倍。本研究为进一步深入揭示VvLBD35和VvLBD36的生物学功能奠定了实验基础。
