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湘西黄牛LPL基因exon5的多态性与生长性状的相关性
被引量：
6
1
作者
王兴平
罗仍卓么
+2 位作者
李峰
王京仁
李娜
《江苏农业学报》
CSCD
北大核心
2012年第4期792-796,共5页
脂蛋白脂酶(LPL)是机体脂质和脂蛋白代谢的关键酶,在脂质代谢、转运和能量代谢方面发挥着重要作用,影响着动物的生长发育。为探讨湘西黄牛LPL基因的分子遗传特征和寻找与生长性状相关的分子标记,采用PCR产物测序的方法检测了湘西黄牛LP...
脂蛋白脂酶(LPL)是机体脂质和脂蛋白代谢的关键酶,在脂质代谢、转运和能量代谢方面发挥着重要作用,影响着动物的生长发育。为探讨湘西黄牛LPL基因的分子遗传特征和寻找与生长性状相关的分子标记,采用PCR产物测序的方法检测了湘西黄牛LPL基因的SNP位点,并进行了LPL基因exon 5的g.365458G>A位点进行了群体遗传多态与生长性状的关联分析。SNP检测结果表明,LPL基因在Intron 4上新发现了3个SNP(g.365186A>C、g.365248C>T和g.365249C>T),在exon5的182 bp处检测到了1个SNP(g.365458G>A)。g.365458G>A位点的多态性检测结果表明,g.365458G>A位点存在AA、AG和GG 3种基因型,呈中度多态,且达到了Hardy-Weinberg平衡状态。多态性与生产性状的相关性分析结果表明,湘西黄牛AA基因型个体的体高和胸围显著大于GG基因型个体(P<0.05),AA基因型个体的体长和体重极显著大于GG基因型个体(P<0.01)。A等位基因对湘西黄牛的体高、体长、胸围和体重都为正效应,而G等位基因都为负效应。推测LPL基因exon5的g.365458G>A位点有可能作为湘西黄牛生长性状的分子遗传标记位点。
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关键词
湘西黄牛
LPL基因
限制性片段长度多态性(RFLP)
生长性状
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职称材料
牛锌指蛋白312基因的克隆及序列分析
2
作者
王兴平
罗仍卓么
+1 位作者
王京仁
李淑红
《中国畜牧兽医》
CAS
北大核心
2011年第9期118-121,共4页
本试验采用RT-PCR和测序相结合的方法克隆了牛锌指蛋白312(ZnF312)基因,得到了1812bp的cDNA序列,包括63bp的5′非翻译区(1-63)、1377bp的CDS区(64-1440)和372bp的3′非翻译区(1441-1812)。采用生物信息学方法分析了该基因及其所编码的...
本试验采用RT-PCR和测序相结合的方法克隆了牛锌指蛋白312(ZnF312)基因,得到了1812bp的cDNA序列,包括63bp的5′非翻译区(1-63)、1377bp的CDS区(64-1440)和372bp的3′非翻译区(1441-1812)。采用生物信息学方法分析了该基因及其所编码的蛋白质的结构和功能,结果表明,ZnF312基因位于22号染色体上,编码458个氨基酸,分子质量为48.82ku,等电点为9.419,含有6个锌指结构域(ZnF_C2H2),与人、黑猩猩、小鼠、大鼠和狗的ZnF312蛋白序列的相似性分别为97%、97%、94%、94%和95%,ZnF312蛋白亚细胞定位于细胞核的概率为95.7%,定位于线粒体的概率为4.3%。结合ZnF_C2H2在真核生物中的重要作用,推测牛ZnF312蛋白可能识别相应的靶基因,在生长发育或疾病控制中起着重要的作用。
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关键词
牛
ZnF312基因
基因克隆
生物信息学
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职称材料
题名
湘西黄牛LPL基因exon5的多态性与生长性状的相关性
被引量：
6
1
作者
王兴平
罗仍卓么
李峰
王京仁
李娜
机构
湖南
文理学院生命科学学院
出处
《江苏农业学报》
CSCD
北大核心
2012年第4期792-796,共5页
基金
湖南省科技计划项目(2010NK3043)
湖南省自然科学基金项目(11JJ4020)
+2 种基金
湖南文理学院博士启动项目(BSQD1002)
湖南省高校创新平台开放基金项目(11K045)
湖南省动物学重点学科建设项目
文摘
脂蛋白脂酶(LPL)是机体脂质和脂蛋白代谢的关键酶,在脂质代谢、转运和能量代谢方面发挥着重要作用,影响着动物的生长发育。为探讨湘西黄牛LPL基因的分子遗传特征和寻找与生长性状相关的分子标记,采用PCR产物测序的方法检测了湘西黄牛LPL基因的SNP位点,并进行了LPL基因exon 5的g.365458G>A位点进行了群体遗传多态与生长性状的关联分析。SNP检测结果表明,LPL基因在Intron 4上新发现了3个SNP(g.365186A>C、g.365248C>T和g.365249C>T),在exon5的182 bp处检测到了1个SNP(g.365458G>A)。g.365458G>A位点的多态性检测结果表明,g.365458G>A位点存在AA、AG和GG 3种基因型,呈中度多态,且达到了Hardy-Weinberg平衡状态。多态性与生产性状的相关性分析结果表明,湘西黄牛AA基因型个体的体高和胸围显著大于GG基因型个体(P<0.05),AA基因型个体的体长和体重极显著大于GG基因型个体(P<0.01)。A等位基因对湘西黄牛的体高、体长、胸围和体重都为正效应,而G等位基因都为负效应。推测LPL基因exon5的g.365458G>A位点有可能作为湘西黄牛生长性状的分子遗传标记位点。
关键词
湘西黄牛
LPL基因
限制性片段长度多态性(RFLP)
生长性状
Keywords
Xiangxi cattle
LPLgene
restricted fragment length polymorphism（RFLP）
growth trait
分类号
S823.812 [农业科学—畜牧学]
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职称材料
题名
牛锌指蛋白312基因的克隆及序列分析
2
作者
王兴平
罗仍卓么
王京仁
李淑红
机构
湖南
文理学院生命科学学院
湖南省
普通
高等学校
重点
实验室
(
动物学
)
环洞庭湖生物资源保育与利用研究中心
出处
《中国畜牧兽医》
CAS
北大核心
2011年第9期118-121,共4页
基金
湖南省科技计划项目(2010NK3043)
湖南文理学院博士启动项目(BSQD1002)
+1 种基金
湖南省自然科学基金项目(11JJ4020)
湖南省高校创新平台开放基金项目(11K045)
文摘
本试验采用RT-PCR和测序相结合的方法克隆了牛锌指蛋白312(ZnF312)基因,得到了1812bp的cDNA序列,包括63bp的5′非翻译区(1-63)、1377bp的CDS区(64-1440)和372bp的3′非翻译区(1441-1812)。采用生物信息学方法分析了该基因及其所编码的蛋白质的结构和功能,结果表明,ZnF312基因位于22号染色体上,编码458个氨基酸,分子质量为48.82ku,等电点为9.419,含有6个锌指结构域(ZnF_C2H2),与人、黑猩猩、小鼠、大鼠和狗的ZnF312蛋白序列的相似性分别为97%、97%、94%、94%和95%,ZnF312蛋白亚细胞定位于细胞核的概率为95.7%,定位于线粒体的概率为4.3%。结合ZnF_C2H2在真核生物中的重要作用,推测牛ZnF312蛋白可能识别相应的靶基因,在生长发育或疾病控制中起着重要的作用。
关键词
牛
ZnF312基因
基因克隆
生物信息学
Keywords
cattle
ZnF312 gene
gene cloning
bio-informatics
分类号
Q781 [生物学—分子生物学]
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职称材料
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
湘西黄牛LPL基因exon5的多态性与生长性状的相关性
王兴平
罗仍卓么
李峰
王京仁
李娜
《江苏农业学报》
CSCD
北大核心
2012
6
在线阅读
下载PDF
职称材料
2
牛锌指蛋白312基因的克隆及序列分析
王兴平
罗仍卓么
王京仁
李淑红
《中国畜牧兽医》
CAS
北大核心
2011
0
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职称材料
已选择
0
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