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芳香羧酸衍生物驱避剂的非线性定量构效关系
被引量：
1
1
作者
李颗
李向辉
+1 位作者
徐西林
袁哲明
《昆虫学报》
CAS
CSCD
北大核心
2014年第9期1018-1024,共7页
【目的】驱避剂可使害虫不敢接近受用者从而保护受用者免遭其害。建立高精度、可解释性强的非线性定量构效关系(quantitative structure-activity relationship,QSAR)模型对设计合成新的高效昆虫驱避剂有重要意义。【方法】基于37个芳...
【目的】驱避剂可使害虫不敢接近受用者从而保护受用者免遭其害。建立高精度、可解释性强的非线性定量构效关系(quantitative structure-activity relationship,QSAR)模型对设计合成新的高效昆虫驱避剂有重要意义。【方法】基于37个芳香羧酸类化合物对家蝇Musca domestica的驱避活性,以量子化学计算软件PCLIENT获取每一化合物初始描述符,以二元矩阵重排过滤器、多轮末尾淘汰实施特征非线性筛选,以支持向量回归(support vector regression,SVR)建立非线性QSAR模型,以SVR非线性解释体系分析各保留描述符对驱避活性的影响。【结果】1 542个初始描述符的SVR模型F=1.2,特征筛选后6个保留描述符的SVR模型F=184.6,特征筛选对QSAR模型精度有重要影响。6个保留分子描述符的重要性依次为p4BCD>GATS7v>T(O..O)>JGI8>SssO>nArCONR2。【结论】保留描述符与芳香羧酸类化合物对家蝇驱避活性的非线性关系明显,获得了高精度、普适性强的非线性SVR-QSAR模型。
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关键词
驱避剂
家蝇
芳香族衍生物
驱避活性
非线性
定量构效关系
支持向量回归
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职称材料
基于序列特征筛选与支持向量回归预测蛋白质折叠速率
被引量：
1
2
作者
李咏
周玮
+3 位作者
代志军
陈渊
王志明
袁哲明
《物理化学学报》
SCIE
CAS
CSCD
北大核心
2014年第6期1091-1098,共8页
折叠速率预测对阐明蛋白质折叠机理意义重大.本文收集了115条目前已知折叠速率的蛋白质样本(包括二态、多态和混态蛋白),为了较全面地表征蛋白质分子的一级结构信息,提取序列长度、氨基酸残基多尺度组分、成对残基k-space特征与基于残...
折叠速率预测对阐明蛋白质折叠机理意义重大.本文收集了115条目前已知折叠速率的蛋白质样本(包括二态、多态和混态蛋白),为了较全面地表征蛋白质分子的一级结构信息,提取序列长度、氨基酸残基多尺度组分、成对残基k-space特征与基于残基物理化学性质的地统计学关联总共9357维特征.经改进的二元矩阵重排过滤器和多轮末尾淘汰非线性筛选,获得23个物理化学意义明确的保留特征,建立的非线性支持向量回归模型Jackknife交叉验证的相关系数R=0.95,优于文献报道及其他参比特征选择方法.支持向量回归解释体系表明折叠速率与保留描述符的非线性回归极显著,分析了各保留描述符对折叠速率的影响,结果表明蛋白质折叠速率与序列长度、中短程关联特征、三联体残基组份特征等密切相关.
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关键词
蛋白质折叠
折叠速率预测
高维特征
特征筛选
支持向量回归
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职称材料
三代棉铃虫幼虫发生量的非线性分析——以河北、山西等六省为例
3
作者
魏丽娟
李咏
+1 位作者
陈渊
袁哲明
《湖南农业科学》
2013年第11期62-65,69,共5页
害虫发生量分析是害虫预测预报与综合防治的前提。在分析棉铃虫二代成虫来源及产卵去向的基础上,区分省份与年份,以我国6省1997~2006年玉米等4种非棉花寄主上三代棉铃虫幼虫密度为响应变量,选取棉花寄主上的二代虫卵密度、Bt棉种植面积...
害虫发生量分析是害虫预测预报与综合防治的前提。在分析棉铃虫二代成虫来源及产卵去向的基础上,区分省份与年份,以我国6省1997~2006年玉米等4种非棉花寄主上三代棉铃虫幼虫密度为响应变量,选取棉花寄主上的二代虫卵密度、Bt棉种植面积、玉米种植面积等23个自变量,建立了多变量支持向量回归(Support Vector Regression,SVR)非线性模型。首先根据均方误差(mean square error,MSE)最小原则对23个自变量实施非线性多轮末尾淘汰,获得与害虫发生量相关的重要因素;然后通过保留因子构建棉铃虫发生量非线性回归模型,并以基于F检验的SVR非线性解释性体系验证了模型的显著性,模型R2=0.901 2;最后分析保留因子的显著性和单因子效应,展示了各保留因子对棉铃虫发生量的影响。
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关键词
棉铃虫
发生量
支持向量回归
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职称材料
题名
芳香羧酸衍生物驱避剂的非线性定量构效关系
被引量：
1
1
作者
李颗
李向辉
徐西林
袁哲明
机构
长沙县
农业
科学研究所
湖南农业大学
湖南省
作物种质创新与资源利用
重点
实验室
湖南农业大学湖南省植物病虫害生物学及防控重点实验室
出处
《昆虫学报》
CAS
CSCD
北大核心
2014年第9期1018-1024,共7页
基金
教育部博士点基金项目(20124320110002)
文摘
【目的】驱避剂可使害虫不敢接近受用者从而保护受用者免遭其害。建立高精度、可解释性强的非线性定量构效关系(quantitative structure-activity relationship,QSAR)模型对设计合成新的高效昆虫驱避剂有重要意义。【方法】基于37个芳香羧酸类化合物对家蝇Musca domestica的驱避活性,以量子化学计算软件PCLIENT获取每一化合物初始描述符,以二元矩阵重排过滤器、多轮末尾淘汰实施特征非线性筛选,以支持向量回归(support vector regression,SVR)建立非线性QSAR模型,以SVR非线性解释体系分析各保留描述符对驱避活性的影响。【结果】1 542个初始描述符的SVR模型F=1.2,特征筛选后6个保留描述符的SVR模型F=184.6,特征筛选对QSAR模型精度有重要影响。6个保留分子描述符的重要性依次为p4BCD>GATS7v>T(O..O)>JGI8>SssO>nArCONR2。【结论】保留描述符与芳香羧酸类化合物对家蝇驱避活性的非线性关系明显,获得了高精度、普适性强的非线性SVR-QSAR模型。
关键词
驱避剂
家蝇
芳香族衍生物
驱避活性
非线性
定量构效关系
支持向量回归
Keywords
Repellent
Musca domestica
aromatic carboxylic acid
repellency
nonlinear
quantitative structure-activity relationship（QSAR）
support vector regression（SVR）
分类号
Q964 [生物学—昆虫学]
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职称材料
题名
基于序列特征筛选与支持向量回归预测蛋白质折叠速率
被引量：
1
2
作者
李咏
周玮
代志军
陈渊
王志明
袁哲明
机构
湖南农业大学
湖南农业大学
出处
《物理化学学报》
SCIE
CAS
CSCD
北大核心
2014年第6期1091-1098,共8页
基金
教育部博士点基金(20124320110002)
国家自然科学基金(31301388)
湖南省自然科学基金(14JJ3092)资助项目~~
文摘
折叠速率预测对阐明蛋白质折叠机理意义重大.本文收集了115条目前已知折叠速率的蛋白质样本(包括二态、多态和混态蛋白),为了较全面地表征蛋白质分子的一级结构信息,提取序列长度、氨基酸残基多尺度组分、成对残基k-space特征与基于残基物理化学性质的地统计学关联总共9357维特征.经改进的二元矩阵重排过滤器和多轮末尾淘汰非线性筛选,获得23个物理化学意义明确的保留特征,建立的非线性支持向量回归模型Jackknife交叉验证的相关系数R=0.95,优于文献报道及其他参比特征选择方法.支持向量回归解释体系表明折叠速率与保留描述符的非线性回归极显著,分析了各保留描述符对折叠速率的影响,结果表明蛋白质折叠速率与序列长度、中短程关联特征、三联体残基组份特征等密切相关.
关键词
蛋白质折叠
折叠速率预测
高维特征
特征筛选
支持向量回归
Keywords
Protein folding
Folding rate prediction
High-dimensional feature
Feature screening
Support vector regression
分类号
O629.73 [理学—有机化学]
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职称材料
题名
三代棉铃虫幼虫发生量的非线性分析——以河北、山西等六省为例
3
作者
魏丽娟
李咏
陈渊
袁哲明
机构
湖南农业大学
湖南省
作物种质创新与资源利用
重点
实验室
湖南农业大学湖南省植物病虫害生物学及防控重点实验室
出处
《湖南农业科学》
2013年第11期62-65,69,共5页
基金
湖南省杰出青年科学基金项目(10JJ1005)
教育部博士点基金项目(20124320110002)
文摘
害虫发生量分析是害虫预测预报与综合防治的前提。在分析棉铃虫二代成虫来源及产卵去向的基础上,区分省份与年份,以我国6省1997~2006年玉米等4种非棉花寄主上三代棉铃虫幼虫密度为响应变量,选取棉花寄主上的二代虫卵密度、Bt棉种植面积、玉米种植面积等23个自变量,建立了多变量支持向量回归(Support Vector Regression,SVR)非线性模型。首先根据均方误差(mean square error,MSE)最小原则对23个自变量实施非线性多轮末尾淘汰,获得与害虫发生量相关的重要因素;然后通过保留因子构建棉铃虫发生量非线性回归模型,并以基于F检验的SVR非线性解释性体系验证了模型的显著性,模型R2=0.901 2;最后分析保留因子的显著性和单因子效应,展示了各保留因子对棉铃虫发生量的影响。
关键词
棉铃虫
发生量
支持向量回归
Keywords
cotton bollworm
emergence size
support vector regression
分类号
S435.622.3 [农业科学—农业昆虫与害虫防治]
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职称材料
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
芳香羧酸衍生物驱避剂的非线性定量构效关系
李颗
李向辉
徐西林
袁哲明
《昆虫学报》
CAS
CSCD
北大核心
2014
1
在线阅读
下载PDF
职称材料
2
基于序列特征筛选与支持向量回归预测蛋白质折叠速率
李咏
周玮
代志军
陈渊
王志明
袁哲明
《物理化学学报》
SCIE
CAS
CSCD
北大核心
2014
1
在线阅读
下载PDF
职称材料
3
三代棉铃虫幼虫发生量的非线性分析——以河北、山西等六省为例
魏丽娟
李咏
陈渊
袁哲明
《湖南农业科学》
2013
0
在线阅读
下载PDF
职称材料
已选择
0
条
导出题录
引用分析
参考文献
引证文献
统计分析
检索结果
已选文献
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