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亚麻木质素合成途径中关键酶基因片段的克隆与序列分析 被引量:6
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作者 高原 陈信波 +3 位作者 龙松华 邓欣 邹杰 刘爱玲 《作物学报》 CAS CSCD 北大核心 2008年第2期337-340,共4页
亚麻是一种重要的韧皮纤维作物,木质素对亚麻纤维的性能和品质具有较大影响。以亚麻(Linum usitatis simum L.)茎秆表皮细胞的mRNA为模板,利用木质素合成途径中关键酶基因的同源基因保守序列设计简并引物,通过RT-PCR扩增,电泳获得13个... 亚麻是一种重要的韧皮纤维作物,木质素对亚麻纤维的性能和品质具有较大影响。以亚麻(Linum usitatis simum L.)茎秆表皮细胞的mRNA为模板,利用木质素合成途径中关键酶基因的同源基因保守序列设计简并引物,通过RT-PCR扩增,电泳获得13个特异带。分别将这些DNA片段连接到T载体后转化大肠杆菌,从重组质粒转化菌分别挑取5~8个单菌落测定插入片段序列,得到关键酶基因新的片段序列8个。生物信息学分析结果表明,这些新片段分别属于3个基因家族。其中,2个CCoAOMT基因片段(GenBank登录号为EF214740,EF214741),3个4CL基因片段(GenBank登录号为EF214737,EF214738,EF214739),3个F5H基因片段(GenBank登录号为EF214745,EF214746,EF214747),推测亚麻中这几个木质素代谢关键调控酶基因存在多基因家族。新获得的基因片段序列为进一步克隆全序列和了解调控亚麻木质素的生物合成奠定了基础。 展开更多
关键词 亚麻(Linum usitatissimumL.) CCoAOMT基因 4CL基因 F5H基因 序列分析
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拟南芥保卫细胞中特异性表达基因启动子片段基序分析 被引量:3
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作者 邓荟芬 刘春林 +2 位作者 李进 范亚丽 阮颖 《生物技术通报》 CAS CSCD 2007年第3期145-148,151,共5页
将16个在拟南芥保卫细胞中进行特异性表达和8个非特异表达基因的转录起始密码子ATG上游-500bp的启动子序列在PLACE上进行分析,认为AAAAG基序和TAAAG基序控制某些基因在保卫细胞中进行特异性表达,但分析结果显示有的保卫细胞特异表达启... 将16个在拟南芥保卫细胞中进行特异性表达和8个非特异表达基因的转录起始密码子ATG上游-500bp的启动子序列在PLACE上进行分析,认为AAAAG基序和TAAAG基序控制某些基因在保卫细胞中进行特异性表达,但分析结果显示有的保卫细胞特异表达启动子的序列中却不含有这两个基序,说明还要其它类型的未知基序控制着保卫细胞中的特异表达,这一理论分析为进一步的实验研究提供了理论依据。 展开更多
关键词 保卫细胞 启动子 特异 基序
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甘蓝型油菜LPAT4基因克隆及其生物信息学分析 被引量:2
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作者 肖旦望 刘聪 +3 位作者 胡学芳 邬克彬 官春云 熊兴华 《华北农学报》 CSCD 北大核心 2014年第3期52-58,共7页
为进一步研究油菜LPAT4基因,通过检索与拟南芥LPAT4序列相似度较高的油菜EST序列,拼接后与白菜和甘蓝的LPAT4序列进行同源比对,设计一对引物,从甘蓝型油菜湘油15中扩增全长LPAT4 CDs序列。共获得2条CDs序列,它们的长度分别为1 143,1 140... 为进一步研究油菜LPAT4基因,通过检索与拟南芥LPAT4序列相似度较高的油菜EST序列,拼接后与白菜和甘蓝的LPAT4序列进行同源比对,设计一对引物,从甘蓝型油菜湘油15中扩增全长LPAT4 CDs序列。共获得2条CDs序列,它们的长度分别为1 143,1 140 bp,分别命名为BnLPAT4-1和BnLPAT4-2。BnLPAT4-1编码380个氨基酸,所得蛋白质的相对分子质量和等电点分别为43.29 kDa和8.74;BnLPAT4-2编码379个氨基酸,所得蛋白质的相对分子质量和等电点分别为43.16 kDa和8.93。他们均具有LPLAT_LCLAT1样结构域,同属于LPLAT超基因家族。比较所用油菜序列SNP分析显示,LPAT4共存在41个多态性位点,其中单变异位点7个,简约信息位点34个。这41个多态性位点中,引起同义变异的位点为23个,引起取代变异的位点18个,共导致16个氨基酸发生改变。分析表明,BnLPAT4-1和BnLPAT4-2为甘蓝型油菜湘油15号LPAT4基因的2个拷贝,从序列组成、理化性质、保守结构域以及同源建模4个方面来看,它们均具备LPLAT超基因家族的特征,为该基因家族的2个成员。 展开更多
关键词 LPAT4 甘蓝型油菜 同源建模分析 保守结构域 SNP
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芸芥种质资源的遗传多样性研究 被引量:6
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作者 钟军 戴林健 +4 位作者 李栒 官春云湖南农业大学基因工程省重点实验室湖南长沙410128湖南农业大学油料作物研究所湖南长沙410128 熊兴华 刘春林 周小云 《中国油料作物学报》 CAS CSCD 北大核心 2004年第2期1-5,共5页
用100个随机引物对18份芸芥材料的基因组DNA进行扩增,结果有10个随机引物得到了稳定一致的RAPD谱带,每个引物扩增出2~17条谱带,共扩增出91条谱带。采用UPGMA法对扩增出的谱带进行遗传聚类分析,在遗传距离(D)=0.1333处,将18个芸芥材料分... 用100个随机引物对18份芸芥材料的基因组DNA进行扩增,结果有10个随机引物得到了稳定一致的RAPD谱带,每个引物扩增出2~17条谱带,共扩增出91条谱带。采用UPGMA法对扩增出的谱带进行遗传聚类分析,在遗传距离(D)=0.1333处,将18个芸芥材料分为2类8组,揭示了芸芥种质资源的遗传多样性。 展开更多
关键词 芸芥 RAPD DNA指纹图谱 聚类分析
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亚麻遗传多样性的RAPD分析 被引量:6
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作者 何东锋 陈信波 +4 位作者 邓欣 龙松华 高原 王进 王玉富 《生物技术通报》 CAS CSCD 2008年第5期126-129,144,共5页
从600个随机引物筛选出28个扩增稳定性较好的引物,对18份来自不同国家和地区的亚麻资源遗传多态性进行RAPD分析。结果表明:共扩增出条带529,其中多态性条带201,总的多态性百分率(PPB)为38.0%。用NTSYSpc(2.10)软件进行UPGMA聚类分析,18... 从600个随机引物筛选出28个扩增稳定性较好的引物,对18份来自不同国家和地区的亚麻资源遗传多态性进行RAPD分析。结果表明:共扩增出条带529,其中多态性条带201,总的多态性百分率(PPB)为38.0%。用NTSYSpc(2.10)软件进行UPGMA聚类分析,18个亚麻品种遗传距离为0.0469~0.1332之间,可分3大类,其中红木5号与匈牙利5号亲缘关系最近,ABYSSINIA(BROWN)和匈牙利5号遗传距离相差最显著,达到0.1332。 展开更多
关键词 RAPD分析 亚麻 亲缘关系 遗传距离
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油菜分子标记研究进展 被引量:8
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作者 刘忠松 官春云 +1 位作者 孟金陵 危文亮 《生物技术通报》 CAS CSCD 1997年第5期14-16,共3页
以DNA为基础的分子标记具有数量多、中性的特点,因此自分子标记方法发明以来,已迅速应用到许多生物学研究之中。就油菜而言,RFLP,RAPD,SSR和AFLP已先后用于亲缘关系和遗传距离分析、品种鉴别、遗传图谱构建和基因定位等方面。
关键词 油菜 分子标记 研究进展
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RNA干扰载体构建方法的研究进展 被引量:11
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作者 粟挺 刘爱玲 陈信波 《湖南农业科学》 2011年第10期1-4,共4页
RNA干扰是通过外源或内源的双链RNA在细胞内诱导同源序列的基因表达沉默的现象。目前RNA干扰技术不但被广泛地应用于各种基因的功能研究,而且在农作物抗逆品种的选育方面起重要的作用。RNA干扰技术的关键是构建能在受体中稳定表达的干... RNA干扰是通过外源或内源的双链RNA在细胞内诱导同源序列的基因表达沉默的现象。目前RNA干扰技术不但被广泛地应用于各种基因的功能研究,而且在农作物抗逆品种的选育方面起重要的作用。RNA干扰技术的关键是构建能在受体中稳定表达的干扰载体。阐述了近几年发展起来的3种简单、快捷、稳定的构建RNA干扰载体的方法。 展开更多
关键词 RNA干扰 载体构建 基因 综述
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用于PCR分析的芥菜型油菜总DNA的快速提取 被引量:3
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作者 严明理 刘忠松 +1 位作者 官春云 刘丽莉 《现代农业科技》 2008年第16期172-173,共2页
通过对所提DNA质量、效率和PCR检测,建立和优化了可用于PCR分析的芥菜型油菜总DNA的提取方法,这一方法快速,所提的DNA质量好,可在芥菜型油菜生长发育早期进行。
关键词 芥菜型油菜 快速提取DNA PCR分析
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亚麻分子标记应用研究进展 被引量:5
9
作者 何东锋 陈信波 +2 位作者 高国赋 王进 王玉富 《湖南农业科学》 2009年第5期21-23,共3页
分子标记是继形态学标记、细胞学标记和生化标记之后迅速发展起来的一种新标记。分子标记技术应用于亚麻的研究,对亚麻亲缘关系与遗传多样性、及遗传图谱构建及资源保护利用等提供了极大的便利。主要叙述了亚麻遗传多态性及亲缘关系、... 分子标记是继形态学标记、细胞学标记和生化标记之后迅速发展起来的一种新标记。分子标记技术应用于亚麻的研究,对亚麻亲缘关系与遗传多样性、及遗传图谱构建及资源保护利用等提供了极大的便利。主要叙述了亚麻遗传多态性及亲缘关系、系普分析、种质鉴定、基因定位、遗传图谱构建和分子标记辅助选择育种等的研究进展,探讨了分子标记在亚麻研究中尚需解决的问题。 展开更多
关键词 亚麻 分子标记 研究进展
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保卫细胞中特异表达启动子片段缺失后表达载体的构建
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作者 邓荟芬 阮颖 +3 位作者 刘春林 范亚丽 李进 杜培粉 《湖南农业科学》 2007年第4期75-77,80,共4页
iMyAP基因启动子的核心启动子370 bp片段能启动基因在保卫细胞中特异性表达。将其进行缺失,克隆得到370 bp、308bp和150 bp的启动子片段,与pMD18-T载体连接并进行序列分析后用BLAST软件作同源分析的结果显示,它们的核苷酸序列与GenBank... iMyAP基因启动子的核心启动子370 bp片段能启动基因在保卫细胞中特异性表达。将其进行缺失,克隆得到370 bp、308bp和150 bp的启动子片段,与pMD18-T载体连接并进行序列分析后用BLAST软件作同源分析的结果显示,它们的核苷酸序列与GenBank中登陆的iMyAP启动子片段的核苷酸序列一致。将这3个启动子片段分别与pCAMBIA-1303质粒相连,构建得到表达载体。 展开更多
关键词 iMyAP基因 启动子 表达载体
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亚麻RAPD反应体系的优化和品种间多态性标记的筛选 被引量:2
11
作者 梁毅莉 陈信波 陈婕妤 《湖南农业科学》 2009年第2期7-10,14,共5页
用600个随机引物对白花和山西大同两个亚麻品种进行RAPD分析,筛选出31条两品种间具多态性的RAPD特异引物,为利用以上两品种构建我国的亚麻遗传图谱奠定了基础。
关键词 亚麻 DNA分子标记 RAPD
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