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茶树尿卟啉原脱羧酶基因CsHEME2的克隆与生物信息学分析
1
作者
高羲之
张晨禹
+4 位作者
陈建姣
易晓芹
李云飞
陈佳豪
沈程文
《茶叶通讯》
2021年第2期214-224,共11页
为初步探索茶树对酸雨胁迫的应答机制,基于模拟酸雨胁迫茶树幼苗成熟叶片转录组测序结果,采用RTPCR技术从茶树cDNA中克隆出尿卟啉原脱羧酶(Uroporphyrinogen decarboxylase,HEME2)的CDS区全长序列(GenBank登录号:MN329147),其总长度为11...
为初步探索茶树对酸雨胁迫的应答机制,基于模拟酸雨胁迫茶树幼苗成熟叶片转录组测序结果,采用RTPCR技术从茶树cDNA中克隆出尿卟啉原脱羧酶(Uroporphyrinogen decarboxylase,HEME2)的CDS区全长序列(GenBank登录号:MN329147),其总长度为1182 bp,共编码393个氨基酸残基。生物信息学分析结果表明,CsHEME2基因编码蛋白分子质量约为43.17 kDa,理论等电点(pI)约为6.73,是稳定的疏水蛋白,不具有信号肽为非分泌蛋白,亚细胞定位预测结果为该基因定位在叶绿体,二、三级结构以α-螺旋和无规则卷曲为主。进化树结果显示,CsHEME2基因与中华猕猴桃(Actinidia chinensis)亲缘关系最近。采用实时荧光定量PCR技术检测CsHEME2基因在模拟酸雨胁迫处理叶片和正常叶片中的表达水平,结果显示该基因在模拟酸雨胁迫处理叶片中的相对表达量比在正常叶片中高并存在显著差异。
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关键词
茶树
CsHEME2基因
基因表达
生物信息学
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题名
茶树尿卟啉原脱羧酶基因CsHEME2的克隆与生物信息学分析
1
作者
高羲之
张晨禹
陈建姣
易晓芹
李云飞
陈佳豪
沈程文
机构
湖南农业大学园艺学院/茶学教育部重点实验室/国家植物功能成分利用工程技术研究中心
出处
《茶叶通讯》
2021年第2期214-224,共11页
基金
国家自然科学基金项目(31271789)
中央引导地方科技发展专项(2019XF5041)
湖南省现代农业产业技术体系建设专项(湘财农指[2019]0047号)。
文摘
为初步探索茶树对酸雨胁迫的应答机制,基于模拟酸雨胁迫茶树幼苗成熟叶片转录组测序结果,采用RTPCR技术从茶树cDNA中克隆出尿卟啉原脱羧酶(Uroporphyrinogen decarboxylase,HEME2)的CDS区全长序列(GenBank登录号:MN329147),其总长度为1182 bp,共编码393个氨基酸残基。生物信息学分析结果表明,CsHEME2基因编码蛋白分子质量约为43.17 kDa,理论等电点(pI)约为6.73,是稳定的疏水蛋白,不具有信号肽为非分泌蛋白,亚细胞定位预测结果为该基因定位在叶绿体,二、三级结构以α-螺旋和无规则卷曲为主。进化树结果显示,CsHEME2基因与中华猕猴桃(Actinidia chinensis)亲缘关系最近。采用实时荧光定量PCR技术检测CsHEME2基因在模拟酸雨胁迫处理叶片和正常叶片中的表达水平,结果显示该基因在模拟酸雨胁迫处理叶片中的相对表达量比在正常叶片中高并存在显著差异。
关键词
茶树
CsHEME2基因
基因表达
生物信息学
Keywords
Camellia sinensis
CsHEME2 gene
Gene expression
Bioinformatics
分类号
S571.1 [农业科学—茶叶生产加工]
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作者
出处
发文年
被引量
操作
1
茶树尿卟啉原脱羧酶基因CsHEME2的克隆与生物信息学分析
高羲之
张晨禹
陈建姣
易晓芹
李云飞
陈佳豪
沈程文
《茶叶通讯》
2021
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