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女贞叶中一条糖基转移酶的基因克隆、生物信息学分析及原核表达 被引量:2
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作者 周洛兵 申甲一 +4 位作者 曾碧容 袁希伟 谭朝阳 蒋情 徐德宏 《化学与生物工程》 CAS 北大核心 2024年第4期31-39,共9页
女贞叶化学成分复杂,糖苷类物质是其发挥药理活性的关键成分,糖苷的形成离不开糖基转移酶。利用cDNA末端快速扩增技术,对女贞叶中一条糖基转移酶编码基因LlUGT3进行了克隆;根据基因和蛋白质序列进行了生物信息学分析;通过基因工程技术使... 女贞叶化学成分复杂,糖苷类物质是其发挥药理活性的关键成分,糖苷的形成离不开糖基转移酶。利用cDNA末端快速扩增技术,对女贞叶中一条糖基转移酶编码基因LlUGT3进行了克隆;根据基因和蛋白质序列进行了生物信息学分析;通过基因工程技术使LlUGT3基因在大肠杆菌体内进行了异源表达。结果表明,LlUGT3基因cDNA全长1684 bp,由85 bp 5′-UTR、159 bp 3′-UTR、1440 bp ORF组成,其中ORF编码一条含479个氨基酸残基的酶蛋白,其相对分子质量、理论等电点和亲水性平均系数分别为54.8 kDa、5.86和-0.381;在LlUGT3酶蛋白一级结构中含有一段糖基转移酶高度保守的PSPG盒,但不含信号肽且无跨膜片段,在二级结构中含有α螺旋(42.59%)、β折叠(12.73%)和无规卷曲(44.68%),在三级结构中由肽链折叠形成α/β/α类Rossmann折叠区域,并且两者之间夹着一个底物结合腔;同源建模结果显示,LlUGT3酶蛋白与模板分子PaGT3序列相似度很高,而且系统发育树分析也表明两者亲缘关系最近;分子对接分析表明,LlUGT3酶蛋白的His17-Asp116对发挥催化功能,PSPG盒主要涉及结合UDPG,而LIUGT酶与辣椒素的结合方式与PaGT3相似;通过基因工程技术,实现了LlUGT3基因在大肠杆菌体内的异源表达。该研究为进一步深入研究LlUGT3酶蛋白的结构与功能奠定了基础。 展开更多
关键词 糖基转移酶 女贞叶 基因克隆 生物信息学分析 原核表达
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女贞糖基转移酶基因(LlUGT)的克隆、生物信息学分析及原核表达 被引量:1
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作者 申甲一 周洛兵 +2 位作者 吴文妹 谭朝阳 徐德宏 《植物资源与环境学报》 CAS CSCD 北大核心 2023年第2期47-55,共9页
根据前期女贞(Ligustrum lucidum Ait.)转录组分析结果,利用cDNA末端快速扩增(RACE)技术从叶片中克隆到1个编码糖基转移酶的基因,命名为LlUGT。该基因cDNA全长1621 bp,由47 bp的5′非翻译区、1473 bp的开放阅读框(ORF)和101 bp的3′非... 根据前期女贞(Ligustrum lucidum Ait.)转录组分析结果,利用cDNA末端快速扩增(RACE)技术从叶片中克隆到1个编码糖基转移酶的基因,命名为LlUGT。该基因cDNA全长1621 bp,由47 bp的5′非翻译区、1473 bp的开放阅读框(ORF)和101 bp的3′非翻译区组成,其ORF编码1个含490个氨基酸残基的蛋白(LlUGT),该蛋白的理论相对分子质量和理论等电点分别为55365.68和pI 6.26。生物信息学分析结果表明:LlUGT的氨基酸序列中含有1段糖基转移酶高度保守的区域,即PSPG盒。LlUGT的二级结构含有α-螺旋(41.02%)、β-折叠(10.41%)和无规卷曲(48.57%),三级结构中由肽链折叠形成2个正对的α/β/α类Rossmann折叠区域,并且二者之间夹着1个底物结合口袋。氨基酸序列比对和系统发育分析结果显示:LlUGT与拟南芥(Arabidopsis thaliana(Linn.)Heynh.)UGT74F2的亲缘关系最近,氨基酸序列一致性为47%,且二者具有相同功能的氨基酸残基,故推测LlUGT与UGT74F2功能相似。LlUGT与水杨酸的分子对接实验结果显示:LlUGT中的His51一方面与水杨酸羧基形成氢键,另一方面与Asp143形成氢键,这与UGT74F2的对接结果相同,故推测LlUGT与UGT74F2相同,也是专一催化水杨酸生成糖酯的酶。此外,通过基因工程技术成功在大肠杆菌体内获得LlUGT蛋白。综上所述,本研究首次从女贞叶片中克隆到1个编码糖基转移酶的基因,经理论预测其编码蛋白是1种催化水杨酸生成糖酯的酶。 展开更多
关键词 女贞 糖基转移酶 基因克隆 生物信息学分析 原核表达
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益母草糖基转移酶基因的克隆及原核表达分析(英文) 被引量:4
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作者 徐德宏 谭朝阳 《植物科学学报》 CAS CSCD 北大核心 2016年第3期397-405,共9页
通过cDNA末端快速扩增技术(rapid amplification of cDNA ends,RACE)从益母草(Leonurus heterophyllus Sweet)叶片中克隆获得了一个编码糖基转移酶的基因(LhsUGT)。该基因cDNA全长为1562 bp,开放阅读框(open reading frame,ORF)... 通过cDNA末端快速扩增技术(rapid amplification of cDNA ends,RACE)从益母草(Leonurus heterophyllus Sweet)叶片中克隆获得了一个编码糖基转移酶的基因(LhsUGT)。该基因cDNA全长为1562 bp,开放阅读框(open reading frame,ORF)为1368 bp,编码455个氨基酸残基,其分子量和等电点分别为50.47 k D和5.52。生物信息学分析结果显示:LhsUGT编码的酶蛋白含有3种二级结构,其中α螺旋占43.1%,β折叠片占17.5%,无规卷曲占39.4%,其C端还发现了一段高度保守的PSPG结构域,说明LhsUGT编码的酶蛋白属于植物糖基转移酶超家族;对LhsUGT的氨基酸序列进行BLAST同源比对,发现益母草与其它植物的糖基转移酶序列相似性为26.4%-68.0%;系统进化树分析表明,LhsUGT蛋白属于拟南芥糖基转移酶超家族的L组,故推测它可能具有催化简单酚类发生糖基化的功能;SDS-PAGE电泳显示,原核表达系统成功表达出分子量约为69 k D的LhsUGT重组蛋白,其N端含有一段17.9 k D的His标签,且在IPTG诱导5 h后达到最高表达量。本研究结果为进一步开展体外酶促反应、阐明益母草糖基转移酶的生物学功能奠定了基础。 展开更多
关键词 益母草 糖基转移酶基因 CDNA克隆 生物信息学分析 原核表达
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对羟基苯甲醇对小白菜天麻素积累和生长的影响 被引量:2
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作者 易怀锟 江灵敏 +5 位作者 何彦 刘鹏 李笑 张玉蓉 谭朝阳 徐德宏 《浙江农业科学》 2018年第12期2302-2305,共4页
利用植物水培法,探讨营养液中添加对羟基苯甲醇,小白菜能否产生和积累天麻素,并进一步研究对羟基苯甲醇对小白菜生长的影响。结果显示,小白菜能以浓度依赖的方式将对羟基苯甲醇转化为天麻素,并在水培第6天达到最高值,但随着时间的推移,... 利用植物水培法,探讨营养液中添加对羟基苯甲醇,小白菜能否产生和积累天麻素,并进一步研究对羟基苯甲醇对小白菜生长的影响。结果显示,小白菜能以浓度依赖的方式将对羟基苯甲醇转化为天麻素,并在水培第6天达到最高值,但随着时间的推移,天麻素积累量逐渐降低。说明小白菜体内存在识别对羟基苯甲醇的糖基转移酶,由其催化生成的天麻素因进一步代谢而很难在小白菜中长期积累。水培营养液中添加对羟基苯甲醇,会抑制小白菜根的生长并延缓或阻滞株高的增大,但小白菜能在较短时间和一定浓度范围内抵抗对羟基苯甲醇的危害,而且这种抵抗能力与对羟基苯甲醇浓度和施加时间呈负相关。以上研究结果为以后大规模利用小白菜既经济又高效地水培生成天麻素,并进一步将其开发成为一种保健蔬菜奠定了基础。 展开更多
关键词 小白菜 对羟基苯甲醇 天麻素 植物水培法
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