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甲状腺癌铁死亡预后风险模型的构建及其潜在机制的生物信息学分析
被引量:
1
1
作者
杨仁义
彭书旺
+2 位作者
王永恒
董宇轩
段姗姗
《吉林大学学报(医学版)》
CAS
CSCD
北大核心
2023年第2期402-413,共12页
目的:筛选甲状腺癌(TC)差异预后铁死亡基因(PFRGs),构建TC铁死亡相关基因(FRGs)预后风险模型,并阐述其潜在作用机制。方法:从癌症基因组图谱(TCGA)数据库获取基因表达及临床数据,从铁死亡疾病数据库(FerrDb)和人类基因数据库(GeneCards...
目的:筛选甲状腺癌(TC)差异预后铁死亡基因(PFRGs),构建TC铁死亡相关基因(FRGs)预后风险模型,并阐述其潜在作用机制。方法:从癌症基因组图谱(TCGA)数据库获取基因表达及临床数据,从铁死亡疾病数据库(FerrDb)和人类基因数据库(GeneCards)中获取FRGs,采用R软件筛选TCPFRGs;从TCGA和GTEx数据库获取TC组织和甲状腺组织中PFRGs mRNA表达数据,从人类蛋白图谱(HPA)数据库获取免疫组织化学结果,验证PFRGs mRNA和蛋白表达的差异;采用时间依赖性受试者工作特征(time-ROC)曲线和Kaplan-Meier曲线评估PFRGs与TC患者生存和预后的关系;采用单因素和多因素Cox回归分析计算PFRGs表达的风险评分,纳入TC患者临床数据,进行独立预后分析,并构建Nomogram图;TCGA数据库中PFRGs与各基因表达的相关性采用Spearman相关分析,计算相关系数并筛选共表达基因;采用生物信息学方法对PFRGs共表达基因进行蛋白-蛋白互作(PPI)网络图、基因本体论(GO)和京都基因与基因组百科全书(KEGG)富集分析。结果:在TC中差异分析筛选出3 317个上调基因和3 456个下调基因,单因素Cox回归分析筛选出343个差异表达基因(DEGs)与TC患者的生存和预后相关,其中包括CD44、膜联蛋白A1(ANXA1)和核受体亚家族4A类成员1 (NR4A1)。Kaplan-Meier和time-ROC曲线显示CD44、ANXA1和NR4A1的表达与TC患者生存和预后有关联(P=0.048,P=0.005,P=0.036),且均具有良好的1、3和5年生存预测作用。构建3个基因风险评分系统,风险评分作为TC患者临床预后因子[风险比(HR)=8.882,95%CI:1.561~50.547,P=0.014)],风险评分越高,生存预后越差[P=0.011,ROC曲线下面积(AUC)=0.761、0.767和0.722];风险评分联合TC患者临床特征构建的Nomogram图(C-index=0.938)对TC患者的生存具有较好的预测作用。共表达与富集分析,TC铁死亡主要与其共表达基因(DUSP1、 DUSP5、 DUSP6、 FOS、 IL1RAP、 JUN、 MET、RASGRF1、TGFA、TGFBR1、TNFRSF1A)介导MAPK信号通路,影响MAPK活性和p-MAPK活性,调控MAPK失活。结论:基于生物信息学筛选出的TC差异PFRGs CD44、ANXA1和NR4A1与TC患者生存和预后相关,由3个基因构建的预测模型具有较好的预测能力,其作用机制可能与多基因网状调控MAPK信号通路有关。
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关键词
甲状腺肿瘤
铁死亡
风险评分
Nomogram图
生存预后
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职称材料
肿瘤科护士角色清晰度对体面劳动感的影响研究
被引量:
6
2
作者
薛亚玲
聂婷瑶
+1 位作者
张萍
王雅琼
《护理学杂志》
CSCD
北大核心
2023年第22期73-76,共4页
目的 探讨肿瘤科护士角色清晰度对体面劳动感的影响,为采取针对性措施提高护士体面劳动感提供参考。方法 采用一般资料问卷、角色清晰度量表、体面劳动感知量表对湖南省5所三级医院336名肿瘤科护士进行调查。结果 肿瘤科护士角色清晰度...
目的 探讨肿瘤科护士角色清晰度对体面劳动感的影响,为采取针对性措施提高护士体面劳动感提供参考。方法 采用一般资料问卷、角色清晰度量表、体面劳动感知量表对湖南省5所三级医院336名肿瘤科护士进行调查。结果 肿瘤科护士角色清晰度得分(30.50±5.16)分、体面劳动感得分(47.98±6.09)分。角色清晰度与体面劳动感呈正相关(r=0.257,P<0.05),分层回归分析显示,是否接受过灵性教育培训、月收入、角色清晰度是肿瘤科护士体面劳动感的影响因素(均P<0.05),其中角色清晰度可独立解释5.4%体面劳动感的变异。结论 肿瘤科护士体面劳动感处于中等水平。管理者应及时引导护士,形成对自身角色的正确认知,提高其体面劳动感。
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关键词
肿瘤科护士
角色清晰度
体面劳动感
职业规划
灵性教育
护理管理
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职称材料
题名
甲状腺癌铁死亡预后风险模型的构建及其潜在机制的生物信息学分析
被引量:
1
1
作者
杨仁义
彭书旺
王永恒
董宇轩
段姗姗
机构
湖南中医药大学第一附属医院胃肠甲状腺血管外科
湖南中医药大学
研究生院
出处
《吉林大学学报(医学版)》
CAS
CSCD
北大核心
2023年第2期402-413,共12页
基金
国家自然科学基金青年基金项目(82002397)
湖南省卫健委科研计划项目(202104010382,B20180739,D202304018086)。
文摘
目的:筛选甲状腺癌(TC)差异预后铁死亡基因(PFRGs),构建TC铁死亡相关基因(FRGs)预后风险模型,并阐述其潜在作用机制。方法:从癌症基因组图谱(TCGA)数据库获取基因表达及临床数据,从铁死亡疾病数据库(FerrDb)和人类基因数据库(GeneCards)中获取FRGs,采用R软件筛选TCPFRGs;从TCGA和GTEx数据库获取TC组织和甲状腺组织中PFRGs mRNA表达数据,从人类蛋白图谱(HPA)数据库获取免疫组织化学结果,验证PFRGs mRNA和蛋白表达的差异;采用时间依赖性受试者工作特征(time-ROC)曲线和Kaplan-Meier曲线评估PFRGs与TC患者生存和预后的关系;采用单因素和多因素Cox回归分析计算PFRGs表达的风险评分,纳入TC患者临床数据,进行独立预后分析,并构建Nomogram图;TCGA数据库中PFRGs与各基因表达的相关性采用Spearman相关分析,计算相关系数并筛选共表达基因;采用生物信息学方法对PFRGs共表达基因进行蛋白-蛋白互作(PPI)网络图、基因本体论(GO)和京都基因与基因组百科全书(KEGG)富集分析。结果:在TC中差异分析筛选出3 317个上调基因和3 456个下调基因,单因素Cox回归分析筛选出343个差异表达基因(DEGs)与TC患者的生存和预后相关,其中包括CD44、膜联蛋白A1(ANXA1)和核受体亚家族4A类成员1 (NR4A1)。Kaplan-Meier和time-ROC曲线显示CD44、ANXA1和NR4A1的表达与TC患者生存和预后有关联(P=0.048,P=0.005,P=0.036),且均具有良好的1、3和5年生存预测作用。构建3个基因风险评分系统,风险评分作为TC患者临床预后因子[风险比(HR)=8.882,95%CI:1.561~50.547,P=0.014)],风险评分越高,生存预后越差[P=0.011,ROC曲线下面积(AUC)=0.761、0.767和0.722];风险评分联合TC患者临床特征构建的Nomogram图(C-index=0.938)对TC患者的生存具有较好的预测作用。共表达与富集分析,TC铁死亡主要与其共表达基因(DUSP1、 DUSP5、 DUSP6、 FOS、 IL1RAP、 JUN、 MET、RASGRF1、TGFA、TGFBR1、TNFRSF1A)介导MAPK信号通路,影响MAPK活性和p-MAPK活性,调控MAPK失活。结论:基于生物信息学筛选出的TC差异PFRGs CD44、ANXA1和NR4A1与TC患者生存和预后相关,由3个基因构建的预测模型具有较好的预测能力,其作用机制可能与多基因网状调控MAPK信号通路有关。
关键词
甲状腺肿瘤
铁死亡
风险评分
Nomogram图
生存预后
Keywords
Thyroid neoplasm
Ferroptosis
Risk score
Nomogram
Survival prognosis
分类号
R736.3 [医药卫生—肿瘤]
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职称材料
题名
肿瘤科护士角色清晰度对体面劳动感的影响研究
被引量:
6
2
作者
薛亚玲
聂婷瑶
张萍
王雅琼
机构
湖南中医药大学第一附属医院胃肠甲状腺血管外科
湖南中医药大学
第一
附属
医院
老年病科
湖南中医药大学
第一
附属
医院
血液肿瘤科
出处
《护理学杂志》
CSCD
北大核心
2023年第22期73-76,共4页
基金
湖南卫生健康委2023年度科研课题(D202314058411)。
文摘
目的 探讨肿瘤科护士角色清晰度对体面劳动感的影响,为采取针对性措施提高护士体面劳动感提供参考。方法 采用一般资料问卷、角色清晰度量表、体面劳动感知量表对湖南省5所三级医院336名肿瘤科护士进行调查。结果 肿瘤科护士角色清晰度得分(30.50±5.16)分、体面劳动感得分(47.98±6.09)分。角色清晰度与体面劳动感呈正相关(r=0.257,P<0.05),分层回归分析显示,是否接受过灵性教育培训、月收入、角色清晰度是肿瘤科护士体面劳动感的影响因素(均P<0.05),其中角色清晰度可独立解释5.4%体面劳动感的变异。结论 肿瘤科护士体面劳动感处于中等水平。管理者应及时引导护士,形成对自身角色的正确认知,提高其体面劳动感。
关键词
肿瘤科护士
角色清晰度
体面劳动感
职业规划
灵性教育
护理管理
Keywords
oncology nurse
role clarity
sense of decent work
career planning
spiritual education
nursing management
分类号
R47 [医药卫生—护理学]
C931.3 [经济管理—管理学]
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职称材料
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
甲状腺癌铁死亡预后风险模型的构建及其潜在机制的生物信息学分析
杨仁义
彭书旺
王永恒
董宇轩
段姗姗
《吉林大学学报(医学版)》
CAS
CSCD
北大核心
2023
1
在线阅读
下载PDF
职称材料
2
肿瘤科护士角色清晰度对体面劳动感的影响研究
薛亚玲
聂婷瑶
张萍
王雅琼
《护理学杂志》
CSCD
北大核心
2023
6
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职称材料
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