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基于全基因组重测序评估湖北五个地方鸡遗传多样性与群体结构
1
作者
王瑞
张小键
《中国家禽》
北大核心
2025年第9期15-22,共8页
为了解湖北地方鸡的群体遗传结构和遗传多样性,从而更好地保护和利用湖北省地方鸡遗传资源,研究基于全基因组重测序技术,对70只湖北地方鸡的全基因组单核苷酸多态性进行分析。结果显示:通过观测杂合度、期望杂合度、近交系数、连锁不平...
为了解湖北地方鸡的群体遗传结构和遗传多样性,从而更好地保护和利用湖北省地方鸡遗传资源,研究基于全基因组重测序技术,对70只湖北地方鸡的全基因组单核苷酸多态性进行分析。结果显示:通过观测杂合度、期望杂合度、近交系数、连锁不平衡衰减程度、核苷酸多样性分析,发现五个湖北地方鸡品种具有较高的遗传多样性。主成分分析、Admixture分析、系统进化树分析、基因流分析评估五个湖北地方鸡的群体遗传结构,发现湖北地方鸡因地理分布相近,与其他地方鸡相比遗传背景也更相近;将其与红色原鸡进行两两比较,受选择程度由大到小依次为郧阳大鸡、景阳鸡、江汉鸡、洪山鸡、双莲鸡。Treemix分析、f3检验评估湖北地方鸡与来航鸡、洛克鸡的基因交流情况,发现双莲鸡与来航鸡间存在显著遗传交流;同时,评估湖北地方鸡有效群体由大到小依次为江汉鸡、双莲鸡、景阳鸡、郧阳大鸡、洪山鸡。研究表明,湖北地方鸡遗传多样性丰富,受外来品种基因渗入的影响,仅检测到双莲鸡与来航鸡之间存在显著的基因交流,表明当前保种措施得当;与其他地方鸡相比,湖北地方鸡具有相似的遗传背景,需要进一步加强保种措施,以确保湖北地方鸡遗传资源的可持续发展。
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关键词
湖北地方鸡
遗传多样性
群体结构
基因渗入
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题名
基于全基因组重测序评估湖北五个地方鸡遗传多样性与群体结构
1
作者
王瑞
张小键
机构
北京市丰台区
农业
技术推广中心
湖北省神农架林区农业农村局
出处
《中国家禽》
北大核心
2025年第9期15-22,共8页
文摘
为了解湖北地方鸡的群体遗传结构和遗传多样性,从而更好地保护和利用湖北省地方鸡遗传资源,研究基于全基因组重测序技术,对70只湖北地方鸡的全基因组单核苷酸多态性进行分析。结果显示:通过观测杂合度、期望杂合度、近交系数、连锁不平衡衰减程度、核苷酸多样性分析,发现五个湖北地方鸡品种具有较高的遗传多样性。主成分分析、Admixture分析、系统进化树分析、基因流分析评估五个湖北地方鸡的群体遗传结构,发现湖北地方鸡因地理分布相近,与其他地方鸡相比遗传背景也更相近;将其与红色原鸡进行两两比较,受选择程度由大到小依次为郧阳大鸡、景阳鸡、江汉鸡、洪山鸡、双莲鸡。Treemix分析、f3检验评估湖北地方鸡与来航鸡、洛克鸡的基因交流情况,发现双莲鸡与来航鸡间存在显著遗传交流;同时,评估湖北地方鸡有效群体由大到小依次为江汉鸡、双莲鸡、景阳鸡、郧阳大鸡、洪山鸡。研究表明,湖北地方鸡遗传多样性丰富,受外来品种基因渗入的影响,仅检测到双莲鸡与来航鸡之间存在显著的基因交流,表明当前保种措施得当;与其他地方鸡相比,湖北地方鸡具有相似的遗传背景,需要进一步加强保种措施,以确保湖北地方鸡遗传资源的可持续发展。
关键词
湖北地方鸡
遗传多样性
群体结构
基因渗入
Keywords
Hubei local chicken
genetic diversity
group structure
bloodline invasion
分类号
S831.2 [农业科学—畜牧学]
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题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
基于全基因组重测序评估湖北五个地方鸡遗传多样性与群体结构
王瑞
张小键
《中国家禽》
北大核心
2025
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