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题名宜昌地区结核分枝杆菌基因分型与成簇特征分析
被引量：3
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作者
刘晓俊
余枫华
余云芳
纪律
周攀
赵雁林
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机构
湖北省宜昌市疾病预防控制中心检验科
中国疾病预防控制中心结核病预防控制中心国家结核病参比实验室
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出处
《中国防痨杂志》
CAS
CSCD
2019年第3期308-314,共7页
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基金
湖北省卫生与计划生育委员会联合基金项目(WJ2018H241).
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文摘
目的描述宜昌地区结核分枝杆菌的基因分型及成簇特征,为宜昌地区的结核病防治提供依据。方法搜集宜昌地区2016年12月至2017年5月经基因芯片检测阳性的结核病患者痰标本,接种罗氏培养基进行培养后,得到的367株结核分枝杆菌临床分离株选择国际通用的24位点结核分枝杆菌散在分布重复单位及可变数目串联重复序列(MIRU-VNTR)进行分子分型,用Hunter-Gaston指数(HGI)和遗传差异值(h)对MIRU位点的分辨率和差异性进行评价;运用BioNumerics5.0软件对VNTR-MIRU结果进行成簇性分析,根据近期传播率公式计算其近期传播率;367株菌株分离来自367例患者,细分为初治患者321例、复治患者46例后分别进行成簇率统计,初复治患者的成簇率比较采用χ2检验,P<0.05为差异有统计学意义。结果367株结核分枝杆菌24位点VNTR-MIRU分型结果显示,其总的分辨率HGI值为0.999,其中遗传多样性最高的位点为QUB11b,其h值为0.79;遗传多样性最低的位点为MIRU24,其h值为0.03。分析时发现基因型呈明显的多态性,总共有324个基因型。成簇性分析发现,其中90株菌株形成39个簇,成簇率为24.52%(90/367),近期传播率为13.90%(51/367);复治患者菌株成簇率为21.74%(10/46),初治患者菌株成簇率为24.92%(80/321),两者成簇率比较,差异无统计学意义(χ2=0.220,P=0.639)。结论宜昌地区的结核分枝杆菌呈现出较高的遗传多样性,近期传播率较低,且成簇率与初复治无关,提示宜昌地区结核分枝杆菌以内燃复发为主,也存在小范围内的流行,在结核防控方面要加以重视。
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关键词
分枝杆菌
结核
基因型
串联重复序列
序列标记位点
聚类分析
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Keywords
Mycobacterium tuberculosis
Genotype
Tandem repeat sequences
Sequence tagged sites
Cluster analysis
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分类号
R446.5
[医药卫生—诊断学]
R521
[医药卫生—内科学]
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