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猪流行性腹泻病毒HB201602株的分离鉴定及S1基因序列分析
被引量:
2
1
作者
刘威
袁芳艳
+7 位作者
周丹娜
刘泽文
杨克礼
段正赢
郭锐
高婷
梁婉
田永祥
《湖北农业科学》
2019年第24期227-231,共5页
从湖北地区规模化养殖场疑似腹泻病料中成功检测并分离获得了一株猪流行性腹泻病毒,分离毒株感染Vero细胞可引起明显的细胞病变,病毒效价达1.0×10^5.6TCID50/0.1 mL。间接免疫荧光结果显示HB201602感染细胞后,能被抗PEDV S蛋白的...
从湖北地区规模化养殖场疑似腹泻病料中成功检测并分离获得了一株猪流行性腹泻病毒,分离毒株感染Vero细胞可引起明显的细胞病变,病毒效价达1.0×10^5.6TCID50/0.1 mL。间接免疫荧光结果显示HB201602感染细胞后,能被抗PEDV S蛋白的特异性单克隆抗体所识别,进一步证实所分离毒株为PEDV病毒。基于S1基因构建了系统发育树,表明2011年后分离的毒株大多以G2型变异毒株为主,HB201602属于G2-a亚型(变异毒株)簇。S1基因遗传变异分析发现G1-b亚型毒株与其他簇毒株相比存在9个特异的氨基酸突变,G1-a亚型经典毒株存在4个特异的氨基酸突变,S1基因的变异分析将有助于了解PEDV的遗传变异趋势,为新型疫苗的研发提供依据。
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关键词
猪流行性腹泻
分离鉴定
序列分析
系统发育树
遗传变异
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职称材料
羊流产嗜性衣原体蛋白-蛋白相互作用网络的构建
2
作者
刘威
袁芳艳
+7 位作者
周丹娜
刘泽文
高婷
郭锐
杨克礼
段正赢
梁婉
田永祥
《湖北农业科学》
2021年第22期124-128,共5页
病原菌的相互作用组学研究是揭示潜在信号转导通路和新型药物靶标的有力工具。通过同源蛋白映射的方法构建了羊流产嗜性衣原体(Chlamydia abortus)的蛋白-蛋白相互作用网络。结果表明,所构建的互作网络包含220个蛋白和1276个相互作用关...
病原菌的相互作用组学研究是揭示潜在信号转导通路和新型药物靶标的有力工具。通过同源蛋白映射的方法构建了羊流产嗜性衣原体(Chlamydia abortus)的蛋白-蛋白相互作用网络。结果表明,所构建的互作网络包含220个蛋白和1276个相互作用关系。通过分析蛋白的互作频率,确定了在羊流产嗜性衣原体中互作频率最高的20个蛋白,主要与转录、翻译、分子伴侣等功能相关。进一步分析发现,伴侣蛋白DnaK、GroEL、DnaJ发生互作的频率较高,能与核糖体蛋白、代谢相关蛋白等多种功能蛋白发生相互作用。若DnaK、GroEL、DnaJ的功能受到抑制,将会对羊流产嗜性衣原体的正常生命活动造成较大的影响。
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关键词
羊流产嗜性衣原体(Chlamydia
abortus)
蛋白相互作用
互作网络
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职称材料
题名
猪流行性腹泻病毒HB201602株的分离鉴定及S1基因序列分析
被引量:
2
1
作者
刘威
袁芳艳
周丹娜
刘泽文
杨克礼
段正赢
郭锐
高婷
梁婉
田永祥
机构
湖北省农业科学院畜牧兽医研究所/农业农村部兽用药物与诊断技术湖北科学观测实验站
出处
《湖北农业科学》
2019年第24期227-231,共5页
基金
国家重点研发计划项目(2016YFD0500906)
湖北省农业科技创新中心资助项目(2015-620-004-001)
文摘
从湖北地区规模化养殖场疑似腹泻病料中成功检测并分离获得了一株猪流行性腹泻病毒,分离毒株感染Vero细胞可引起明显的细胞病变,病毒效价达1.0×10^5.6TCID50/0.1 mL。间接免疫荧光结果显示HB201602感染细胞后,能被抗PEDV S蛋白的特异性单克隆抗体所识别,进一步证实所分离毒株为PEDV病毒。基于S1基因构建了系统发育树,表明2011年后分离的毒株大多以G2型变异毒株为主,HB201602属于G2-a亚型(变异毒株)簇。S1基因遗传变异分析发现G1-b亚型毒株与其他簇毒株相比存在9个特异的氨基酸突变,G1-a亚型经典毒株存在4个特异的氨基酸突变,S1基因的变异分析将有助于了解PEDV的遗传变异趋势,为新型疫苗的研发提供依据。
关键词
猪流行性腹泻
分离鉴定
序列分析
系统发育树
遗传变异
Keywords
porcine epidemic diarrhea virus
isolation
sequence analysis
phylogenetic tree
genetic variation
分类号
S852.651 [农业科学—基础兽医学]
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职称材料
题名
羊流产嗜性衣原体蛋白-蛋白相互作用网络的构建
2
作者
刘威
袁芳艳
周丹娜
刘泽文
高婷
郭锐
杨克礼
段正赢
梁婉
田永祥
机构
湖北省农业科学院畜牧兽医研究所/农业农村部兽用药物与诊断技术湖北科学观测实验站
出处
《湖北农业科学》
2021年第22期124-128,共5页
基金
国家重点研发计划项目(2016YFD0500906)
国家自然科学基金项目(315020069)
湖北省农业科技创新中心资助项目(2016-620-000-001-026)。
文摘
病原菌的相互作用组学研究是揭示潜在信号转导通路和新型药物靶标的有力工具。通过同源蛋白映射的方法构建了羊流产嗜性衣原体(Chlamydia abortus)的蛋白-蛋白相互作用网络。结果表明,所构建的互作网络包含220个蛋白和1276个相互作用关系。通过分析蛋白的互作频率,确定了在羊流产嗜性衣原体中互作频率最高的20个蛋白,主要与转录、翻译、分子伴侣等功能相关。进一步分析发现,伴侣蛋白DnaK、GroEL、DnaJ发生互作的频率较高,能与核糖体蛋白、代谢相关蛋白等多种功能蛋白发生相互作用。若DnaK、GroEL、DnaJ的功能受到抑制,将会对羊流产嗜性衣原体的正常生命活动造成较大的影响。
关键词
羊流产嗜性衣原体(Chlamydia
abortus)
蛋白相互作用
互作网络
Keywords
Chlamydia abortus
protein interaction
interaction network
分类号
S852.67 [农业科学—基础兽医学]
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职称材料
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
猪流行性腹泻病毒HB201602株的分离鉴定及S1基因序列分析
刘威
袁芳艳
周丹娜
刘泽文
杨克礼
段正赢
郭锐
高婷
梁婉
田永祥
《湖北农业科学》
2019
2
在线阅读
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职称材料
2
羊流产嗜性衣原体蛋白-蛋白相互作用网络的构建
刘威
袁芳艳
周丹娜
刘泽文
高婷
郭锐
杨克礼
段正赢
梁婉
田永祥
《湖北农业科学》
2021
0
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职称材料
已选择
0
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参考文献
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