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基于多数据库综合分析胰腺癌中TRIM29基因表达及甲基化水平的预后价值
被引量：
1
1
作者
姚宇轩
邓正栋
+2 位作者
梅洪亮
李翔宇
王剑明
《华中科技大学学报（医学版）》
CAS
CSCD
北大核心
2022年第6期772-779,共8页
目的探究三结构域蛋白29(TRIM29)作为胰腺癌患者预后标志物的价值。方法通过生物信息学方法,利用TCGA、GEO、ICGC数据库探究TRIM29 mRNA表达及甲基化水平在胰腺癌患者预后中的作用。结果TRIM29在胰腺癌组织中显著上调(P<0.05)。TRIM2...
目的探究三结构域蛋白29(TRIM29)作为胰腺癌患者预后标志物的价值。方法通过生物信息学方法,利用TCGA、GEO、ICGC数据库探究TRIM29 mRNA表达及甲基化水平在胰腺癌患者预后中的作用。结果TRIM29在胰腺癌组织中显著上调(P<0.05)。TRIM29高表达的胰腺癌患者总生存期(OS)显著低于TRIM29低表达的胰腺癌患者(P<0.05)。Meta分析验证了TRIM29上调是胰腺癌患者OS的不利预后因素。TRIM29表达水平与胰腺癌T分期和病理分期密切相关(均P<0.05)。TRIM29表达水平是胰腺癌患者预后的独立危险因素(HR=1.19,95%CI=1.03~1.36,P<0.05)。列线图分析同样验证了TRIM29的预测能力。GO富集分析结果显示TRIM29可能具有调节细胞外基质结构成分,参与细胞间连接等分子功能;KEGG富集分析结果显示TRIM29可能与粘着斑和PI3K-Akt等信号通路相关。TRIM29甲基化水平和表达量呈负相关(r=-0.71,P<0.01),且TRIM29低甲基化的胰腺癌患者OS和无进展生存期(PFS)显著低于TRIM29高甲基化的胰腺癌患者(均P<0.05)。结论TRIM29在胰腺癌组织中呈现高表达和低甲基化水平,且与胰腺癌患者预后不良密切相关,甲基化调控可能在TRIM29促进胰腺癌的发生发展中具有重要作用。
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关键词
胰腺癌
TRIM29
甲基化
生物信息学
预后
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题名
基于多数据库综合分析胰腺癌中TRIM29基因表达及甲基化水平的预后价值
被引量：
1
1
作者
姚宇轩
邓正栋
梅洪亮
李翔宇
王剑明
机构
武汉科技大学附属天佑医院肝胆胰外科
华中科技大学同济
医学
院附属同济医院小儿外科
湖北省先天性巨结肠及同源病临床医学研究中心
中国人民解放军中部战区总医院普通外科
华中科技大学同济
医学
院附属同济医院胆胰外科
出处
《华中科技大学学报（医学版）》
CAS
CSCD
北大核心
2022年第6期772-779,共8页
基金
国家自然科学基金资助项目(No.82072730)。
文摘
目的探究三结构域蛋白29(TRIM29)作为胰腺癌患者预后标志物的价值。方法通过生物信息学方法,利用TCGA、GEO、ICGC数据库探究TRIM29 mRNA表达及甲基化水平在胰腺癌患者预后中的作用。结果TRIM29在胰腺癌组织中显著上调(P<0.05)。TRIM29高表达的胰腺癌患者总生存期(OS)显著低于TRIM29低表达的胰腺癌患者(P<0.05)。Meta分析验证了TRIM29上调是胰腺癌患者OS的不利预后因素。TRIM29表达水平与胰腺癌T分期和病理分期密切相关(均P<0.05)。TRIM29表达水平是胰腺癌患者预后的独立危险因素(HR=1.19,95%CI=1.03~1.36,P<0.05)。列线图分析同样验证了TRIM29的预测能力。GO富集分析结果显示TRIM29可能具有调节细胞外基质结构成分,参与细胞间连接等分子功能;KEGG富集分析结果显示TRIM29可能与粘着斑和PI3K-Akt等信号通路相关。TRIM29甲基化水平和表达量呈负相关(r=-0.71,P<0.01),且TRIM29低甲基化的胰腺癌患者OS和无进展生存期(PFS)显著低于TRIM29高甲基化的胰腺癌患者(均P<0.05)。结论TRIM29在胰腺癌组织中呈现高表达和低甲基化水平,且与胰腺癌患者预后不良密切相关,甲基化调控可能在TRIM29促进胰腺癌的发生发展中具有重要作用。
关键词
胰腺癌
TRIM29
甲基化
生物信息学
预后
Keywords
pancreatic cancer
TRIM29
methylation
bioinformatics
prognosis
分类号
R735.9 [医药卫生—肿瘤]
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作者
出处
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1
基于多数据库综合分析胰腺癌中TRIM29基因表达及甲基化水平的预后价值
姚宇轩
邓正栋
梅洪亮
李翔宇
王剑明
《华中科技大学学报（医学版）》
CAS
CSCD
北大核心
2022
1
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