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miR-1/133基因簇的进化及其调控网络
被引量：
1
1
作者
陈怡香
岳虎
+1 位作者
张超文
刘杰
《华中师范大学学报（自然科学版）》
CAS
北大核心
2018年第2期231-239,共9页
miR-1/133基因簇在心肌和骨骼肌中特异性表达,对心脏以及骨骼肌的发育及生理病理具有重要作用.该研究采用生物信息学方法,研究了miR-1/133基因簇的进化特征,预测了其靶基因及其调控的生物学过程.利用miRBase数据库对23种不同物种间miR-1...
miR-1/133基因簇在心肌和骨骼肌中特异性表达,对心脏以及骨骼肌的发育及生理病理具有重要作用.该研究采用生物信息学方法,研究了miR-1/133基因簇的进化特征,预测了其靶基因及其调控的生物学过程.利用miRBase数据库对23种不同物种间miR-1/133基因簇的序列、组织方式进行了比较.采用最大似然法构建miR-1/133基因簇的系统进化树,显示该基因簇的进化与物种进化关系有一定差异.利用在线数据库对miR-1/133基因簇上游转录因子及下游靶基因进行预测,并对其进行综合分析,绘制出该基因簇的网络调控图,表明miR-1/133基因簇参与了骨骼肌与心肌发育、胰岛素受体信号通路、经典Wnt信号通路、p53信号通路等体内重要生理过程,为进一步阐明miR-1/133基因簇的生物学功能提供了理论依据.
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关键词
miR-1/133基因簇
生物信息学分析
进化分析
靶基因预测
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职称材料
题名
miR-1/133基因簇的进化及其调控网络
被引量：
1
1
作者
陈怡香
岳虎
张超文
刘杰
机构
湖北理工学院肾脏疾病发生与干预湖北省重点实验室
出处
《华中师范大学学报（自然科学版）》
CAS
北大核心
2018年第2期231-239,共9页
基金
国家自然科学基金项目(81600773)
湖北省教育厅自然科学基金项目(Q20164505)
湖北理工学院青年人才引进项目(16xjz08R)
文摘
miR-1/133基因簇在心肌和骨骼肌中特异性表达,对心脏以及骨骼肌的发育及生理病理具有重要作用.该研究采用生物信息学方法,研究了miR-1/133基因簇的进化特征,预测了其靶基因及其调控的生物学过程.利用miRBase数据库对23种不同物种间miR-1/133基因簇的序列、组织方式进行了比较.采用最大似然法构建miR-1/133基因簇的系统进化树,显示该基因簇的进化与物种进化关系有一定差异.利用在线数据库对miR-1/133基因簇上游转录因子及下游靶基因进行预测,并对其进行综合分析,绘制出该基因簇的网络调控图,表明miR-1/133基因簇参与了骨骼肌与心肌发育、胰岛素受体信号通路、经典Wnt信号通路、p53信号通路等体内重要生理过程,为进一步阐明miR-1/133基因簇的生物学功能提供了理论依据.
关键词
miR-1/133基因簇
生物信息学分析
进化分析
靶基因预测
Keywords
miR-1/133 gene cluster
bioinformatic analysis
evolution analysis
predic-tion of target gene
分类号
Q522 [生物学—生物化学]
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题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
miR-1/133基因簇的进化及其调控网络
陈怡香
岳虎
张超文
刘杰
《华中师范大学学报（自然科学版）》
CAS
北大核心
2018
1
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