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中国南阳黄牛HDAC1基因SNP检测及与生长性状的相关性分析
被引量：
3
1
作者
杨颖
陆江
+5 位作者
李湘萍
佘纳
唐核心
石德顺
吕祁峰
徐照学
《江苏农业科学》
2018年第16期25-30,共6页
采用DNA测序比对和PCR-SSCP分析技术,以15头南阳黄牛为样本,探讨HDAC1基因第5外显子、第11外显子、3'-UTR序列的单核苷酸多态性以及与南阳黄牛经济性状的关联性。结果显示,南阳黄牛HDAC1基因纯合子TT型频率比例最小,纯合子CC型频率...
采用DNA测序比对和PCR-SSCP分析技术,以15头南阳黄牛为样本,探讨HDAC1基因第5外显子、第11外显子、3'-UTR序列的单核苷酸多态性以及与南阳黄牛经济性状的关联性。结果显示,南阳黄牛HDAC1基因纯合子TT型频率比例最小,纯合子CC型频率比例最大;C等位基因占多数。南阳黄牛HDAC1基因第5外显子没有多态性位点;第11外显子在第110 bp处存在A/G突变位点,为同义突变。南阳黄牛HDAC1基因mRNA 3'-UTR非翻译区存在2个突变:199 bp处的T/C多态性位点,其中TT型基因型频率> TG型;以及49 bp处的A/C多态性位点,其中AA型基因型频率> AC型。南阳黄牛HDAC1基因第11外显子基因多态性位点与其生长性状关联分析显示:AG和AA基因型群体中腰角宽、体长有显著性差异(P <0. 05),GG基因型比AG基因型群体在日增质量水平有显著提高(P <0. 05);在腰角宽、体长、日增质量上加性效应及显性效应水平显著(P <0. 05);其余性状均值在不同基因型群体中差异不显著。南阳黄牛HDAC1基因mRNA 3'-UTR非翻译区T/C(199 bp)处位点多态性与生长性状关联性分析发现,各性状在不同基因型群体的均值均无显著差异;A/G(49 bp)处位点多态性与其生长性状关联分析表明:AC和AA基因型群体中在体高、尻长、十字部高和日增质量经济性状上差异显著(P <0. 05),体长性状二者差异极显著(P <0. 01)。研究结果证实了南阳黄牛经济性状与其HDAC1基因片段中的一些SNP位点差异或多态性有关,这些SNP位点可以考虑为潜在的南阳黄牛分子育种目标位点。
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关键词
南阳黄牛
HDAC1基因
单核苷酸多态性
生长性状
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题名
中国南阳黄牛HDAC1基因SNP检测及与生长性状的相关性分析
被引量：
3
1
作者
杨颖
陆江
李湘萍
佘纳
唐核心
石德顺
吕祁峰
徐照学
机构
广西大学动物
科
学技术
学院
上海交通大学
附属
上海市第九人民
医院
湖北医药学院麻醉学研究所及附属太和医院麻醉科
河南省畜牧
研究所
出处
《江苏农业科学》
2018年第16期25-30,共6页
基金
国家肉牛牦牛产业技术体系专项(编号:CARS-38)
国家教育部2016年度第二批国家级大学生创新创业训练计划项目(编号:201610929005)
+4 种基金
国家教育部2012年度第二批国家级大学生创新创业训练计划项目(编号:201210929004)
湖北医药学院自然科学研究基金(编号:2011QDZR-2)
湖北省十堰市科学技术研究与开发项目(编号:14Y13)
湖北医药学院2015年学科建设资助项目(学科英才成长)
2017年度湖北医药学院附属太和医院科学研究基金
文摘
采用DNA测序比对和PCR-SSCP分析技术,以15头南阳黄牛为样本,探讨HDAC1基因第5外显子、第11外显子、3'-UTR序列的单核苷酸多态性以及与南阳黄牛经济性状的关联性。结果显示,南阳黄牛HDAC1基因纯合子TT型频率比例最小,纯合子CC型频率比例最大;C等位基因占多数。南阳黄牛HDAC1基因第5外显子没有多态性位点;第11外显子在第110 bp处存在A/G突变位点,为同义突变。南阳黄牛HDAC1基因mRNA 3'-UTR非翻译区存在2个突变:199 bp处的T/C多态性位点,其中TT型基因型频率> TG型;以及49 bp处的A/C多态性位点,其中AA型基因型频率> AC型。南阳黄牛HDAC1基因第11外显子基因多态性位点与其生长性状关联分析显示:AG和AA基因型群体中腰角宽、体长有显著性差异(P <0. 05),GG基因型比AG基因型群体在日增质量水平有显著提高(P <0. 05);在腰角宽、体长、日增质量上加性效应及显性效应水平显著(P <0. 05);其余性状均值在不同基因型群体中差异不显著。南阳黄牛HDAC1基因mRNA 3'-UTR非翻译区T/C(199 bp)处位点多态性与生长性状关联性分析发现,各性状在不同基因型群体的均值均无显著差异;A/G(49 bp)处位点多态性与其生长性状关联分析表明:AC和AA基因型群体中在体高、尻长、十字部高和日增质量经济性状上差异显著(P <0. 05),体长性状二者差异极显著(P <0. 01)。研究结果证实了南阳黄牛经济性状与其HDAC1基因片段中的一些SNP位点差异或多态性有关,这些SNP位点可以考虑为潜在的南阳黄牛分子育种目标位点。
关键词
南阳黄牛
HDAC1基因
单核苷酸多态性
生长性状
分类号
S813.1 [农业科学—畜牧学]
S823.812 [农业科学—畜牧学]
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作者
出处
发文年
被引量
操作
1
中国南阳黄牛HDAC1基因SNP检测及与生长性状的相关性分析
杨颖
陆江
李湘萍
佘纳
唐核心
石德顺
吕祁峰
徐照学
《江苏农业科学》
2018
3
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