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幽门螺杆菌阳性萎缩性胃炎大鼠生物信息分析及安胃汤影响的研究
被引量：
2
1
作者
徐杉
周瑞东
+5 位作者
龚纯
蒙毅
张帆
郑景辉
唐友明
朱永苹
《世界中医药》
CAS
2022年第10期1377-1384,1389,共9页
目的:基于生物医学大数据筛选幽门螺杆菌(Hp)相关性慢性萎缩性胃炎的关键基因,探索其发病机制及安胃汤对其的影响。方法:从数据库Gene Expression Omnibus(GEO)下载Hp相关性慢性萎缩性胃炎相关芯片数据,利用GEO_(2)R软件筛选出Hp相关性...
目的:基于生物医学大数据筛选幽门螺杆菌(Hp)相关性慢性萎缩性胃炎的关键基因,探索其发病机制及安胃汤对其的影响。方法:从数据库Gene Expression Omnibus(GEO)下载Hp相关性慢性萎缩性胃炎相关芯片数据,利用GEO_(2)R软件筛选出Hp相关性慢性萎缩性胃炎差异基因,进行生物信息学分析,根据蛋白参与通路数量确定核心蛋白,建立Hp阳性慢性萎缩性胃炎大鼠模型,用PCR和蛋白质印迹法(Western Blotting)进行检测并观察安胃汤对其表达的影响。结果:经过检索分析GSE13873和GSE27411系列芯片数据被纳入,取2个芯片交集的20个差异基因进行生物信息学分析,发现载脂蛋白A1、CD36、囊性纤维化穿膜传导调节蛋白(CFTR)可能是信号通路的核心蛋白。Western Blotting及PCR结果显示Hp相关性慢性萎缩性胃炎大鼠胃组织中,CD36蛋白表达下调(P<0.05),载脂蛋白A1和CFTR蛋白表达上调(P<0.05);与模型组比较,实验观察高剂量组、实验观察中剂量组和实验观察低剂量组胃组织中CD36蛋白表达上调,载脂蛋白A1和CFTR表达下调(P<0.05),其与Hp相关性慢性萎缩性胃炎发病关系密切。结论:通过对GEO中Hp相关性慢性萎缩性胃炎芯片生物信息学分析结合Western Blotting及PCR进一步的验证发现载脂蛋白A1、CD36、CFTR作为信号通路的核心蛋白实验结果与生物信息学分析结果一致。
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关键词
慢性萎缩性胃炎
幽门螺旋杆菌
生物信息学
基因芯片
安胃汤
载脂蛋白A1
CD36
囊性纤维化穿膜传导调节蛋白
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职称材料
题名
幽门螺杆菌阳性萎缩性胃炎大鼠生物信息分析及安胃汤影响的研究
被引量：
2
1
作者
徐杉
周瑞东
龚纯
蒙毅
张帆
郑景辉
唐友明
朱永苹
机构
广西
中医药大学
湖北中医药大学附属公安中医医院
广西
中医药大学
附属
瑞康
医院
消化内科
出处
《世界中医药》
CAS
2022年第10期1377-1384,1389,共9页
基金
国家自然科学基金项目(81860843)
广西自然科学基金项目(2017GXNSFAA198111,2018GXNSFAA281063)
+1 种基金
广西一流学科建设开放课题自然科学研究项目(2019XK165)
广西研究生教育创新计划项目(XYJ20054)。
文摘
目的:基于生物医学大数据筛选幽门螺杆菌(Hp)相关性慢性萎缩性胃炎的关键基因,探索其发病机制及安胃汤对其的影响。方法:从数据库Gene Expression Omnibus(GEO)下载Hp相关性慢性萎缩性胃炎相关芯片数据,利用GEO_(2)R软件筛选出Hp相关性慢性萎缩性胃炎差异基因,进行生物信息学分析,根据蛋白参与通路数量确定核心蛋白,建立Hp阳性慢性萎缩性胃炎大鼠模型,用PCR和蛋白质印迹法(Western Blotting)进行检测并观察安胃汤对其表达的影响。结果:经过检索分析GSE13873和GSE27411系列芯片数据被纳入,取2个芯片交集的20个差异基因进行生物信息学分析,发现载脂蛋白A1、CD36、囊性纤维化穿膜传导调节蛋白(CFTR)可能是信号通路的核心蛋白。Western Blotting及PCR结果显示Hp相关性慢性萎缩性胃炎大鼠胃组织中,CD36蛋白表达下调(P<0.05),载脂蛋白A1和CFTR蛋白表达上调(P<0.05);与模型组比较,实验观察高剂量组、实验观察中剂量组和实验观察低剂量组胃组织中CD36蛋白表达上调,载脂蛋白A1和CFTR表达下调(P<0.05),其与Hp相关性慢性萎缩性胃炎发病关系密切。结论:通过对GEO中Hp相关性慢性萎缩性胃炎芯片生物信息学分析结合Western Blotting及PCR进一步的验证发现载脂蛋白A1、CD36、CFTR作为信号通路的核心蛋白实验结果与生物信息学分析结果一致。
关键词
慢性萎缩性胃炎
幽门螺旋杆菌
生物信息学
基因芯片
安胃汤
载脂蛋白A1
CD36
囊性纤维化穿膜传导调节蛋白
Keywords
Chronic atrophic gastritis
Helicobacter pylori
Bioinformatics
Gene chip
Anwei Decoction
APOA1
CD36
Cystic fibrosis transmembrane conductance regulator
分类号
R256 [医药卫生—中医内科学]
R285.5 [医药卫生—中药学]
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职称材料
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
幽门螺杆菌阳性萎缩性胃炎大鼠生物信息分析及安胃汤影响的研究
徐杉
周瑞东
龚纯
蒙毅
张帆
郑景辉
唐友明
朱永苹
《世界中医药》
CAS
2022
2
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