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白及种质资源遗传多样性分析
被引量：
3
1
作者
王洁
朱锡彭
+4 位作者
王腾斐
朱建军
李文俊
邢丙聪
郑颖
《浙江农林大学学报》
CAS
CSCD
北大核心
2023年第2期321-329,共9页
【目的】采用简单重复序列间扩增(ISSR)和相关序列扩增多态性(SRAP)等2种标记技术分析不同种源白及Bletilla striata样本的遗传多样性水平和遗传关系,为白及种质的鉴定、分类、保护和开发提供理论依据。【方法】从100个ISSR引物和238对S...
【目的】采用简单重复序列间扩增(ISSR)和相关序列扩增多态性(SRAP)等2种标记技术分析不同种源白及Bletilla striata样本的遗传多样性水平和遗传关系,为白及种质的鉴定、分类、保护和开发提供理论依据。【方法】从100个ISSR引物和238对SRAP引物组合中筛选出多态性高、扩增条带清晰、重复性好的引物进行聚合酶链式反应(PCR)扩增,用Popgene 32.0计算来自浙江、云南、贵州和四川等省32个不同种源白及的遗传多样性参数和遗传距离,用NTSYS-pc 2.10e进行聚类分析。【结果】从100个ISSR引物中筛选出11个多态性较好的引物,共扩增出188个条带,平均每个引物扩增出17.09个条带,其中多态性位点174个,占总扩增片段的92.20%;从238对SRAP引物组合中筛选出11对多态性较好的引物组合,共扩增出216个条带,平均每个引物扩增出19.64个条带,其中多态性位点202个,占总扩增片段的93.52%。综合ISSR和SRAP的标记结果发现:四川白及种源的遗传多样性水平最高,贵州最低;非加权组平均法(UPGMA聚类)和主坐标分析(PCoA分析)结果显示:聚为一类的白及种源大多来自同一省份,云南省与四川省白及种源的遗传距离较近,浙江省和贵州省白及种源的遗传距离较近,说明遗传距离与地理距离存在一定的重合,但并不呈正相关。【结论】本研究所选白及种源间具有较高的遗传多样性,ISSR和SRAP标记技术均可有效揭示白及的遗传多样性和亲缘关系。
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关键词
白及
遗传多样性
简单重复序列间扩增(ISSR)标记
相关序列扩增多态性(SRAP)标记
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职称材料
利用ISSR与SRAP分子标记分析金线莲种质资源遗传多样性
被引量：
8
2
作者
黄锦春
万思琦
+7 位作者
陈扬
李丽红
张自力
朱建军
吴梅
邢丙聪
邵清松
陆晨飞
《浙江农林大学学报》
CAS
CSCD
北大核心
2023年第1期22-29,共8页
【目的】研究浙江与福建等地引种、杂交与野生的金线莲Anoectochilus roxburghii样品间遗传多样性和亲缘关系,为金线莲种质资源鉴定及优良新品种(系)选育提供科学依据。【方法】以48份新鲜金线莲叶片为材料,分别采用简单重复序列扩增多...
【目的】研究浙江与福建等地引种、杂交与野生的金线莲Anoectochilus roxburghii样品间遗传多样性和亲缘关系,为金线莲种质资源鉴定及优良新品种(系)选育提供科学依据。【方法】以48份新鲜金线莲叶片为材料,分别采用简单重复序列扩增多态性(ISSR)与序列相关扩增多态性(SRAP)分子标记技术,各挑选11条(对)多态性好、扩增条带清晰的引物。经琼脂糖凝胶电泳成像后,统计其扩增条带数,运用NTSYS-PC 2.1和POPGENE 32软件进行非加权组平均法(UPGMA)聚类分析。【结果】ISSR分子标记技术共扩增出86条条带,其中多态性条带84条,多态位点百分率为97.67%;SRAP分子标记技术共扩增出88条条带,其中多态性条带86条,多态位点百分率为97.73%,ISSR和SRAP标记均表现出较高的多态性。不同样本间的遗传距离和遗传一致度表明:浙江省与福建省的金线莲种质混杂严重,而遗传多样性结果显示:福建省的金线莲种群遗传多样性更高。此外,基于ISSR和SRAP标记的UPGMA聚类结果显示:48份不同种源的金线莲依亲缘关系的远近可分为四大类,聚类的划分受到一定地域性的影响,但各地域的金线莲品种在这四大类中均互有混杂。【结论】金线莲在物种水平上遗传多样性较高,在各地区、各品种(系)间遗传交流频繁,ISSR与SRAP分子标记技术可以从分子水平上揭示浙江与福建等地金线莲的遗传多样性,且结合ISSR标记与SRAP标记的分析结果要优于单一的分子标记结果。
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关键词
金线莲
遗传多样性
分子标记
种质资源
ISSR
SRAP
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职称材料
题名
白及种质资源遗传多样性分析
被引量：
3
1
作者
王洁
朱锡彭
王腾斐
朱建军
李文俊
邢丙聪
郑颖
机构
浙江农林大学浙江省特色中药资源保护与创新利用
重点
实验室
温州科技职业学院温州市园艺植物育种重点实验室
成都市农林科
学院
出处
《浙江农林大学学报》
CAS
CSCD
北大核心
2023年第2期321-329,共9页
基金
“十四五”浙江省农业(中药材)新品种选育重大科技专项(2021C02074)
浙江省特色中药资源保护与创新利用重点实验室资助项目(2021E10013)
温州市园艺植物育种重点实验室开放项目(ZD202003)。
文摘
【目的】采用简单重复序列间扩增(ISSR)和相关序列扩增多态性(SRAP)等2种标记技术分析不同种源白及Bletilla striata样本的遗传多样性水平和遗传关系,为白及种质的鉴定、分类、保护和开发提供理论依据。【方法】从100个ISSR引物和238对SRAP引物组合中筛选出多态性高、扩增条带清晰、重复性好的引物进行聚合酶链式反应(PCR)扩增,用Popgene 32.0计算来自浙江、云南、贵州和四川等省32个不同种源白及的遗传多样性参数和遗传距离,用NTSYS-pc 2.10e进行聚类分析。【结果】从100个ISSR引物中筛选出11个多态性较好的引物,共扩增出188个条带,平均每个引物扩增出17.09个条带,其中多态性位点174个,占总扩增片段的92.20%;从238对SRAP引物组合中筛选出11对多态性较好的引物组合,共扩增出216个条带,平均每个引物扩增出19.64个条带,其中多态性位点202个,占总扩增片段的93.52%。综合ISSR和SRAP的标记结果发现:四川白及种源的遗传多样性水平最高,贵州最低;非加权组平均法(UPGMA聚类)和主坐标分析(PCoA分析)结果显示:聚为一类的白及种源大多来自同一省份,云南省与四川省白及种源的遗传距离较近,浙江省和贵州省白及种源的遗传距离较近,说明遗传距离与地理距离存在一定的重合,但并不呈正相关。【结论】本研究所选白及种源间具有较高的遗传多样性,ISSR和SRAP标记技术均可有效揭示白及的遗传多样性和亲缘关系。
关键词
白及
遗传多样性
简单重复序列间扩增(ISSR)标记
相关序列扩增多态性(SRAP)标记
Keywords
Bletilla striata
genetic diversity
ISSR marker
SRAP marker
分类号
S722 [农业科学—林木遗传育种]
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职称材料
题名
利用ISSR与SRAP分子标记分析金线莲种质资源遗传多样性
被引量：
8
2
作者
黄锦春
万思琦
陈扬
李丽红
张自力
朱建军
吴梅
邢丙聪
邵清松
陆晨飞
机构
浙江农林大学浙江省特色中药资源保护与创新利用
重点
实验室
温州科技职业学院温州市园艺植物育种重点实验室
金华市农业科学研究院
出处
《浙江农林大学学报》
CAS
CSCD
北大核心
2023年第1期22-29,共8页
基金
国家自然科学基金资助项目(82173916)
国家级大学生创新创业训练计划项目(202210341058)
浙江农林大学学生科研训练项目(S202210341017)。
文摘
【目的】研究浙江与福建等地引种、杂交与野生的金线莲Anoectochilus roxburghii样品间遗传多样性和亲缘关系,为金线莲种质资源鉴定及优良新品种(系)选育提供科学依据。【方法】以48份新鲜金线莲叶片为材料,分别采用简单重复序列扩增多态性(ISSR)与序列相关扩增多态性(SRAP)分子标记技术,各挑选11条(对)多态性好、扩增条带清晰的引物。经琼脂糖凝胶电泳成像后,统计其扩增条带数,运用NTSYS-PC 2.1和POPGENE 32软件进行非加权组平均法(UPGMA)聚类分析。【结果】ISSR分子标记技术共扩增出86条条带,其中多态性条带84条,多态位点百分率为97.67%;SRAP分子标记技术共扩增出88条条带,其中多态性条带86条,多态位点百分率为97.73%,ISSR和SRAP标记均表现出较高的多态性。不同样本间的遗传距离和遗传一致度表明:浙江省与福建省的金线莲种质混杂严重,而遗传多样性结果显示:福建省的金线莲种群遗传多样性更高。此外,基于ISSR和SRAP标记的UPGMA聚类结果显示:48份不同种源的金线莲依亲缘关系的远近可分为四大类,聚类的划分受到一定地域性的影响,但各地域的金线莲品种在这四大类中均互有混杂。【结论】金线莲在物种水平上遗传多样性较高,在各地区、各品种(系)间遗传交流频繁,ISSR与SRAP分子标记技术可以从分子水平上揭示浙江与福建等地金线莲的遗传多样性,且结合ISSR标记与SRAP标记的分析结果要优于单一的分子标记结果。
关键词
金线莲
遗传多样性
分子标记
种质资源
ISSR
SRAP
Keywords
Anoectochilus roxburghii
genetic diversity
molecular marker
germplasm resources
ISSR
SRAP
分类号
S567.2 [农业科学—中草药栽培]
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职称材料
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
白及种质资源遗传多样性分析
王洁
朱锡彭
王腾斐
朱建军
李文俊
邢丙聪
郑颖
《浙江农林大学学报》
CAS
CSCD
北大核心
2023
3
在线阅读
下载PDF
职称材料
2
利用ISSR与SRAP分子标记分析金线莲种质资源遗传多样性
黄锦春
万思琦
陈扬
李丽红
张自力
朱建军
吴梅
邢丙聪
邵清松
陆晨飞
《浙江农林大学学报》
CAS
CSCD
北大核心
2023
8
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职称材料
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引证文献
统计分析
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