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Lyon IARC多瘤病毒SYBR Green I实时荧光定量PCR方法的建立
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作者 雷晓哓 赵宸辰 +6 位作者 张昕宇 李玉莹 黄海鑫 汪伟 郑敏 孙文超 兰添 《中国动物传染病学报》 北大核心 2024年第6期98-104,共7页
Lyon IARC多瘤病毒(LIPyV)是2017年于人类皮肤样本中新发现的病毒,为更加了解其致病性和流行病学状况,本试验拟建立一种灵敏度高、可快速检测LIPyV的SYBR Green I实时荧光定量PCR方法,并对该方法的特异性、灵敏性和重复性进行评价。结... Lyon IARC多瘤病毒(LIPyV)是2017年于人类皮肤样本中新发现的病毒,为更加了解其致病性和流行病学状况,本试验拟建立一种灵敏度高、可快速检测LIPyV的SYBR Green I实时荧光定量PCR方法,并对该方法的特异性、灵敏性和重复性进行评价。结果显示:该检测方法的Ct值与标准品模板线性关系良好,相关系数为0.9989;利用该方法检测CBoV、FBoV、AGV2这几种病毒的基因组均没有出现非特异性扩增;敏感性比普通PCR检测方法高100倍;组内和组间重复性试验的变异系数小于1%;通过60份样本检测发现LIPyV阳性率为6.67%,比普通PCR更灵敏可靠。结果表明,本试验建立的SYBR Green I实时荧光定量PCR方法可用于LIPyV的快速检测。 展开更多
关键词 Lyon IARC多瘤病毒 SYBR Green I实时荧光定量PCR 特异性 灵敏度
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猪传染性胃肠炎病毒荧光RT-RAA方法的建立及初步应用 被引量:7
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作者 吕荞 赵钟毅 +10 位作者 尹德玮 刘宇梦 汪伟 郑敏 胡诗悦 赵宸辰 张昕宇 雷晓哓 陆景仪 孙文超 兰添 《畜牧兽医学报》 CAS CSCD 北大核心 2023年第5期2208-2214,共7页
旨在建立一种简便、高效的猪传染性胃肠炎病毒(transmissible gastroenteritis virus,TGEV)的检测方法。本研究针对TGEV N基因设计了特异性的引物和探针,并构建重组质粒标准品TGEV-N,经过筛选及优化后建立TGEV荧光逆转录重组酶介异等温... 旨在建立一种简便、高效的猪传染性胃肠炎病毒(transmissible gastroenteritis virus,TGEV)的检测方法。本研究针对TGEV N基因设计了特异性的引物和探针,并构建重组质粒标准品TGEV-N,经过筛选及优化后建立TGEV荧光逆转录重组酶介异等温扩增(reverse-transcription recombinase-aid amplification,RT-RAA)检测方法。结果显示,该方法在42℃恒温条件下进行,20 min即可完成检测,与猪流行性腹泻病毒、猪繁殖与呼吸综合征病毒、猪丁型冠状病毒、猪肠道α冠状病毒等猪源病毒均无交叉反应;将TGEV-N稀释后,以10^(0)~10^(6)拷贝·μL^(-1)作为模板,进行敏感性试验,结果表明,该方法最低检出限可以达到6.62×10^(1)拷贝·μL^(-1);采用该方法对50份猪源样品进行检测,阳性率为6%(3/50),检测结果与RT-PCR一致。本试验建立的TGEV荧光RT-RAA检测方法简便、高效、特异、灵敏,为TGEV的临床筛查提供可行技术。 展开更多
关键词 猪传染性胃肠炎病毒 荧光RT-RAA 临床检测
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