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Real-Time PCR检测棘阿米巴方法建立及应用
被引量:
1
1
作者
秦茜
谷禾
+2 位作者
梁韶晖
韩真真
郑善子
《中国人兽共患病学报》
CAS
CSCD
北大核心
2014年第2期158-162,共5页
目的采用TaqMan探针法建立检测棘阿米巴18srDNA的实时荧光定量PCR(Real—timePCR)方法,为早期诊断棘阿米巴病提供基因诊断标准方法。方法提取实验室培养的4株土壤中分离的和1株水中分离的不同基因型棘阿米巴DNA,测序后在物种保守区...
目的采用TaqMan探针法建立检测棘阿米巴18srDNA的实时荧光定量PCR(Real—timePCR)方法,为早期诊断棘阿米巴病提供基因诊断标准方法。方法提取实验室培养的4株土壤中分离的和1株水中分离的不同基因型棘阿米巴DNA,测序后在物种保守区域设计Real—time引物和TaqMan探针,用建立的方法检测动物模型兔眼分泌物、大肠杆菌、人巨细胞病毒、卡式肺孢子虫、疑似棘阿米巴角膜炎160例病人眼分泌物。结果与传统实验室培养病原相比,所建立的qPCR检测棘阿米巴角膜炎方法测定大肠杆菌、人巨细胞病毒和卡式肺孢子虫与该研究的实验室分离棘阿米巴物种没有交叉反应,检测结果均为阴性。而160例疑似病人,用培养法检测出感染棘阿米巴患者为5例,用qPCR方法检测出6例,其中5例为培养法测出患者,qPCR方法检测阳性率(3.75%)略高于普通培养法(3.13%),但无统计学意义(P〉O.05)。qPCR方法在95%置信区间中灵敏度100%(47.95%~100%)高于普通培养法83.33%(36.10%~97.24%)。结论所建立测定棘阿米巴18srDNA的Real-timePCR基因检测方法具有无创伤性、高效、特异、经济等特点,适用于疑似棘阿米巴角膜炎病人门诊筛选的有效方法。
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关键词
棘阿米巴
TAQMAN探针
18s
RDNA
REAL-TIME
PCR
qPCR
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职称材料
题名
Real-Time PCR检测棘阿米巴方法建立及应用
被引量:
1
1
作者
秦茜
谷禾
梁韶晖
韩真真
郑善子
机构
温州医科大学寄生虫学教研室
温州医科大学
附属二院放射科
温州医科大学
附属二院眼科
延边
大学
寄生虫
教研室
出处
《中国人兽共患病学报》
CAS
CSCD
北大核心
2014年第2期158-162,共5页
基金
浙江省自然科学基金(No.Y2080973)
温州市科技局(No.Y20090012)联合资助~~
文摘
目的采用TaqMan探针法建立检测棘阿米巴18srDNA的实时荧光定量PCR(Real—timePCR)方法,为早期诊断棘阿米巴病提供基因诊断标准方法。方法提取实验室培养的4株土壤中分离的和1株水中分离的不同基因型棘阿米巴DNA,测序后在物种保守区域设计Real—time引物和TaqMan探针,用建立的方法检测动物模型兔眼分泌物、大肠杆菌、人巨细胞病毒、卡式肺孢子虫、疑似棘阿米巴角膜炎160例病人眼分泌物。结果与传统实验室培养病原相比,所建立的qPCR检测棘阿米巴角膜炎方法测定大肠杆菌、人巨细胞病毒和卡式肺孢子虫与该研究的实验室分离棘阿米巴物种没有交叉反应,检测结果均为阴性。而160例疑似病人,用培养法检测出感染棘阿米巴患者为5例,用qPCR方法检测出6例,其中5例为培养法测出患者,qPCR方法检测阳性率(3.75%)略高于普通培养法(3.13%),但无统计学意义(P〉O.05)。qPCR方法在95%置信区间中灵敏度100%(47.95%~100%)高于普通培养法83.33%(36.10%~97.24%)。结论所建立测定棘阿米巴18srDNA的Real-timePCR基因检测方法具有无创伤性、高效、特异、经济等特点,适用于疑似棘阿米巴角膜炎病人门诊筛选的有效方法。
关键词
棘阿米巴
TAQMAN探针
18s
RDNA
REAL-TIME
PCR
qPCR
Keywords
Acanthamoeba keratitis
TaqMan probe
real-time PCR
分类号
R382 [医药卫生—医学寄生虫学]
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题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
Real-Time PCR检测棘阿米巴方法建立及应用
秦茜
谷禾
梁韶晖
韩真真
郑善子
《中国人兽共患病学报》
CAS
CSCD
北大核心
2014
1
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