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清华大学生物馆IVC动物房的工艺设计 被引量:7
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作者 王兆绰 王银银 +1 位作者 罗金环 常智杰 《中国比较医学杂志》 CAS 2004年第2期119-121,共3页
清华大学生物系基因组研究所 ,在校内生物馆第一层改建SPF动物实验设施一处 ,面积约 130m2 。文章介绍了作者的设计思路及改建实施方案、IVC笼具的特点及使用要求 ,同时还总结了改建实验动物设施的经验.
关键词 清华大学 生物馆 IVC动物房 工艺设计 平面布局
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生命科学学科仪器共享平台的特色与管理模式 被引量:22
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作者 冯倩倩 赵敏 +1 位作者 靳娇 潘勋 《实验技术与管理》 CAS 北大核心 2017年第2期250-253,共4页
清华大学根据学科布局与发展的需要,先后建设了10个面向全校开放服务的公共科研平台,为科学研究与人才培养提供了技术支撑与服务。由于校级平台资源配置的局限性,时常遇到设备机时紧张、预约困难、维护资金不足等问题;而且,校级平台一... 清华大学根据学科布局与发展的需要,先后建设了10个面向全校开放服务的公共科研平台,为科学研究与人才培养提供了技术支撑与服务。由于校级平台资源配置的局限性,时常遇到设备机时紧张、预约困难、维护资金不足等问题;而且,校级平台一般较少配置专业性较强的大型设备。针对上述情况,在清华大学—北京大学生命科学联合中心的资助下,生命科学学院于2011年开始建设重点服务于生命学科的仪器共享平台。在平台建设与运行管理实践中,逐步形成了仪器共享平台的特色与管理模式。 展开更多
关键词 生命科学 仪器共享平台 管理模式
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对科学实验在中医药研究中的意义及其可能的指导性的探讨
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作者 杜力军 雷帆 +3 位作者 孙虹 李成功 胡时先 任宾 《世界科学技术-中医药现代化》 北大核心 2025年第2期314-320,共7页
当前科学实验在中医药研究中的应用越来越多,这使得传统中医药的作用不断被阐明。但是科学实验真正意义在于对原有理论的探讨,并因实验中新发现对原有理论发展进行可能的指导。因此,仅仅将科学实验定位于“阐释”中医药作用机理而不是... 当前科学实验在中医药研究中的应用越来越多,这使得传统中医药的作用不断被阐明。但是科学实验真正意义在于对原有理论的探讨,并因实验中新发现对原有理论发展进行可能的指导。因此,仅仅将科学实验定位于“阐释”中医药作用机理而不是导向中医药理论发展、就失去了科学实验的意义和价值。本文从历史角度出发、结合相关文献对科学实验和中医药两种理论范式进行分析,就其异同及其可能的连接点、科学实验在中医药理论研究与发展中的重要性、以及可能的指导性进行了探讨,认为科学实验与中医药虽属不同理论范式,但是其来源于临床实践的客观物质性决定了科学实验与中医药之间的可连接性,即共同的病理生理变化,并可以此为基本点实现科学实验与中医药的连接;为保证这种科学实验与中医药的连接的正确性,在科学实验中应注重科学观的贯彻执行、以保证所研究结果的专属性和特异性,最终对中医药理论发展做出应有的贡献。 展开更多
关键词 中医药研究 现代科学 科学实验 理论探讨
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生成式人工智能辅助学术论文写作的伦理要求专家共识
4
作者 卜友泉 曹永福 +36 位作者 昌增益 陈宏宇 陈晓巍 陈园园 陈柱成 邓蕊 丁洁 范仲凯 高国全 高旭 胡兰 胡晓青 贾弘禔 孔英 李恩民 李凌 李玉华 刘俊荣 刘志强 罗亚平 吕雪梅 裴雁曦 彭小忠 汤其群 万有 汪勇 王明旭 王宪 谢广宽 解军 严晓华 尹梅 于忠山 周春燕 朱瑞芳 《解剖学报》编辑部 《生命的化学》编辑部 《中国生物化学与分子生物学报》 北大核心 2025年第6期826-832,共7页
随着生成式人工智能技术的迅猛发展,其在学术研究与论文写作中得到广泛应用,在不断拓展科研边界的同时,也引发了著作权归属、内容真实性、引用失准、责任认定等一系列伦理与规范挑战。面对人工智能深度参与学术内容生成的趋势,构建公开... 随着生成式人工智能技术的迅猛发展,其在学术研究与论文写作中得到广泛应用,在不断拓展科研边界的同时,也引发了著作权归属、内容真实性、引用失准、责任认定等一系列伦理与规范挑战。面对人工智能深度参与学术内容生成的趋势,构建公开、透明、可控、可信的伦理治理体系,已成为保障科研诚信和维护学术共同体信任的关键课题。本专家共识围绕人工智能辅助学术论文写作的核心环节,从研究选题、数据管理、文献引用、成果署名等方面,系统提出了伦理要求。旨在明确人工智能在学术论文写作中的适用边界与伦理准则,确保科技工具在提升效率的同时坚守诚信底线,为构建负责任、可持续的科研生态提供治理参考和制度支撑。 展开更多
关键词 生成式人工智能 学术论文 伦理要求
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AI时代中的电子显微学研究:严峻挑战、无穷机遇与壮阔前景 被引量:2
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作者 刘铮 沈庆涛 隋森芳 《电子显微学报》 北大核心 2025年第1期124-135,共12页
近十年来结构生物学的发展突飞猛进,取得的标志性突破有两个,一是以冷冻电镜为代表的结构解析技术方向上的突破,二是以AlphaFold算法为代表的结构预测模型上的突破。2024年5月Google DeepMind更新了其生物结构预测工具,最新版本的AlphaF... 近十年来结构生物学的发展突飞猛进,取得的标志性突破有两个,一是以冷冻电镜为代表的结构解析技术方向上的突破,二是以AlphaFold算法为代表的结构预测模型上的突破。2024年5月Google DeepMind更新了其生物结构预测工具,最新版本的AlphaFold 3拥有可以预测几乎所有分子类型的蛋白质复合体结构的能力,在药物互作预测方面也实现了很高的准确性。AlphaFold 3的发布为结构生物学研究带来巨大的变革,展现了AI技术的巨大潜力,也点燃了大众对生命科学和医学研究的热情与想象。与此同时,电子显微学的研究并未停下脚步,新技术、新方法层出不穷,在解析全新蛋白结构、超大超复杂复合体结构、动态结构、原位结构,以及更大尺度的细胞、组织、器官样品的研究中,电子显微学依旧有着不可替代的优势。当前有观点认为结构预测模型甚至可以替代以X射线晶体学和电子显微学为代表的传统实验科学,通过计算便能完成生物结构解析,但是这种观点是片面的。事实上,未来的结构生物学研究,必将是一个整合实验科学与AI技术,从单个蛋白或复合体的结构全面拓展到多蛋白复杂体系、细胞内原位、以及超越微观尺度进入到介观和宏观尺度等方面的研究。 展开更多
关键词 电子显微学 高分辨结构 AlphaFold 结构模型预测
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应用单张冷冻电镜显微照片解析近原子分辨率的单颗粒三维重构 被引量:1
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作者 杨梓 范潇 王宏伟 《电子显微学报》 北大核心 2025年第1期91-105,共15页
冷冻电镜单颗粒三维重构方法解析生物大分子结构通常需要收集大量的照片进行分析。本工作证明当冷冻样品质量足够好时,仅使用单张冷冻电镜显微照片上的蛋白颗粒图像就可以获得近原子级分辨率的单颗粒三维重构密度图,并分别解析了apoferr... 冷冻电镜单颗粒三维重构方法解析生物大分子结构通常需要收集大量的照片进行分析。本工作证明当冷冻样品质量足够好时,仅使用单张冷冻电镜显微照片上的蛋白颗粒图像就可以获得近原子级分辨率的单颗粒三维重构密度图,并分别解析了apoferritin和20S蛋白酶体的三维结构。研究发现,由于蛋白分子颗粒在样品中Z轴不同位置的分布和电子显微镜的像散作用对单张照片中衬度传递函数零点缺失形成了综合补偿效应,从而在单颗粒三维重构中有效恢复了空间频率全域内的结构信息。本研究通过分析不同累计曝光剂量数据的三维重构发现,保存无损高频信息以及足够角度搜索的低频信息的最低辐照剂量其实远低于当前通用的累积曝光量。据此,本工作估算了完成正确高分辨率三维结构解析所需要的最低辐照剂量以及最小颗粒数。本工作加深了我们对冷冻电镜数据信号在图像中保存的理解,为开发更好的冷冻电镜数据采集策略、更好地保存完整高频信号提供了实验上的启示。 展开更多
关键词 冷冻电镜(Cryo⁃EM) 单颗粒分析(SPA) 衬度传递函数(CTF) 信噪比(SNR)
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生物科学计算平台冷冻电镜结构解析实验室管理 被引量:9
7
作者 杨涛 贾安宝 +2 位作者 阮华斌 王亚坤 刘燕 《实验技术与管理》 CAS 北大核心 2017年第2期227-230,234,共5页
以清华大学生命科学院生物计算平台冷冻电镜结构解析实验室管理为案例,介绍了实验室现状、制度体系、平台运行和成果4个部分,阐述了实验室管理和运行过程中经常出现的问题,提出了有效的改进措施,以便进一步提高设备的完好率和利用率,切... 以清华大学生命科学院生物计算平台冷冻电镜结构解析实验室管理为案例,介绍了实验室现状、制度体系、平台运行和成果4个部分,阐述了实验室管理和运行过程中经常出现的问题,提出了有效的改进措施,以便进一步提高设备的完好率和利用率,切实有效地为科研和教学服务,为建立高效有序的实验管理提供理论依据。 展开更多
关键词 生物科学计算平台 冷冻电镜结构解析实验室 实验室管理及运行
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中医学在自然哲学-科学发展的历史定位——对中医药优势特点及未来发展的哲学再思考 被引量:12
8
作者 杜力军 赵玉男 +5 位作者 王玉刚 谢伟东 雷帆 李俊 孙虹 袁梽漪 《世界科学技术-中医药现代化》 CSCD 北大核心 2021年第5期1470-1477,共8页
一直以来对中医学与当代自然科学的关系存在着争论。对于中医学这种临床具有强大生命力的学科,从历史发展的角度对其进行分析定位,对于全面深入认识与发展中医学具有重要意义。为此,我们从西方自然哲学-自然科学的发展角度来探讨中医学... 一直以来对中医学与当代自然科学的关系存在着争论。对于中医学这种临床具有强大生命力的学科,从历史发展的角度对其进行分析定位,对于全面深入认识与发展中医学具有重要意义。为此,我们从西方自然哲学-自然科学的发展角度来探讨中医学的历史定位,从中获得对中医学的理性认识,为中医药学科的发展提供哲学和科学依据。结果表明:(1)从探讨自然运行规律来看,中医学属于科学范畴;(2)从历史角度来看,中医学应属于自然哲学下,与由数理实验科学发展而来的自然科学并列;(3)"形而上学-辨证论治-信息反馈修正"是其理论形成的主要闭环模式,并以此确保了这种形而上学与临床诊疗紧密结合在防治疾病上的可行性和可确证性;(4)对中医学的研究应该既不同于自然哲学也不同于自然科学;(5)坚持科学自觉和哲学自觉是研究发展中医学的重要治学态度。 展开更多
关键词 中医学 自然哲学 自然科学 中药学 科学
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组织透明化方法对小鼠全脑可视化的影响
9
作者 张丹 连佳欢 冯倩倩 《实验技术与管理》 北大核心 2025年第3期9-17,共9页
为探索表达内源性荧光蛋白小鼠组织的最佳透明化方案,分析了6种组织透明化方法CLARITY、CUBIC、FRUIT、3DISCO、uDISCO、PEGASOS对小鼠全脑透明程度、内源荧光保留强度、神经元胞体计数和透明后小鼠全脑体积等可视化参数的影响。结果显... 为探索表达内源性荧光蛋白小鼠组织的最佳透明化方案,分析了6种组织透明化方法CLARITY、CUBIC、FRUIT、3DISCO、uDISCO、PEGASOS对小鼠全脑透明程度、内源荧光保留强度、神经元胞体计数和透明后小鼠全脑体积等可视化参数的影响。结果显示,CLARITY方法处理后小鼠全脑透明化程度最高,内源荧光保留强度和神经元胞体计数最佳,但全脑体积膨胀,选择成像设备时需满足一定的尺寸要求。CUBIC和FRUIT方法透明化程度较差,内源荧光保留强度和神经元胞体计数较弱,但全脑体积基本不变,成本和技术门槛低,适合初学者。3DISCO、uDISCO和PEGASOS方法透明化程度高,全脑体积有明显缩小,增加了选择成像设备的自由度,但3DISCO和uDISCO方法内源荧光保留强度较弱,神经元胞体计数较少,不太适合表达内源性荧光蛋白的小鼠组织。PEGASOS方法处理的小鼠全脑组织内源荧光保留强度和神经元胞体计数表现优异,是小鼠全脑可视化和表达内源性荧光蛋白小鼠组织透明化的优选方法。 展开更多
关键词 组织透明化方法 透明程度 内源荧光保留强度 神经元胞体计数 全脑体积
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持续建设科研条件平台 助力生命学科跨越式发展 被引量:5
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作者 潘勋 冯倩倩 王宏伟 《实验技术与管理》 CAS 北大核心 2021年第4期1-6,共6页
该文从科研条件平台建设入手,配置领军人才和学术骨干开展前沿领域研究所需的仪器设备与设施,支撑生物及医学学科快速发展。生命学科发展实践证明,一流学科建设与技术支撑体系之间关系密切,互相促进、协同发展;一流的公共科研条件平台... 该文从科研条件平台建设入手,配置领军人才和学术骨干开展前沿领域研究所需的仪器设备与设施,支撑生物及医学学科快速发展。生命学科发展实践证明,一流学科建设与技术支撑体系之间关系密切,互相促进、协同发展;一流的公共科研条件平台及其技术支撑体系是吸引和稳定一流师资、开展一流科研、培养一流人才的必要保障。 展开更多
关键词 生命科学 科研条件平台 学科发展
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分析超速离心-沉降速率法研究蛋白质-蛋白质相互作用
11
作者 常卿 褚文丹 +3 位作者 芦亚菲 杨姊 曲娜 李文奇 《生物学杂志》 北大核心 2025年第5期111-116,共6页
分析超速离心-沉降速率法(AUC-SV)是一种用于确定溶液中分子大小和形状的经典生物物理技术,可以根据分子之间在相互作用过程中形成的复合物的数量、大小、化学计量学和亲和力来描述它们之间的相互作用。通过AUC-SV建立免疫相关的重要标... 分析超速离心-沉降速率法(AUC-SV)是一种用于确定溶液中分子大小和形状的经典生物物理技术,可以根据分子之间在相互作用过程中形成的复合物的数量、大小、化学计量学和亲和力来描述它们之间的相互作用。通过AUC-SV建立免疫相关的重要标记分子免疫球蛋白Fc区受体IIb(CD32b)和人IgG1抗体的Fc之间的受体和配体相互作用分析的方法,并与表面等离子共振(SPR)技术和微量热泳动(MST)技术等体外相互作用分析方法进行平行比较,进一步验证了SV-AUC研究蛋白质-蛋白质相互作用的方法可靠性。 展开更多
关键词 分析超速离心-沉降速率法 蛋白质-蛋白质相互作用 免疫球蛋白Fc区受体IIb 抗体Fc片段
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关于第几轮PCR获得等长的DNA的思考及教学建议
12
作者 张小春 吴久宏 冯骞 《生物学教学》 北大核心 2025年第4期86-89,共4页
自2011年江苏高考题考查过PCR第3轮循环产物中开始出现等长的DNA片段后,关于等长DNA片段的考查总是伴随着争论与疑惑,本文对此问题进行分析,并给出相应的教学建议。
关键词 PCR 等长DNA 教学建议
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从科学哲学的“证实”/“证伪”认识中医药科学实验的对照设计 被引量:3
13
作者 杜力军 雷帆 +5 位作者 谢伟东 邢东明 闫智勇 李俊 袁梽漪 高红伟 《世界科学技术-中医药现代化》 CSCD 北大核心 2019年第6期1141-1146,共6页
科学哲学发展过程中的“证实”和“证伪”方法论,从一个问题的两个方面认证理论假说的科学性。我们可以从中得到启示:在中医药科学实验中不仅仅需要证实,还需要证伪。而后者对于一个实验假说的确证更重要。本文对此进行了讨论。结果表... 科学哲学发展过程中的“证实”和“证伪”方法论,从一个问题的两个方面认证理论假说的科学性。我们可以从中得到启示:在中医药科学实验中不仅仅需要证实,还需要证伪。而后者对于一个实验假说的确证更重要。本文对此进行了讨论。结果表明一个实验设计的受试部分属于“证实”的相关内容,其余则属于“证伪”的范畴,即所谓的“对照”(Control)。证伪设计的充分与否直接关系到证实部分结果的确证性,也就是关系到实验假说的正确性。证伪对照设计的多少取决于该实验假设全称逻辑表述中内涵的多少。证伪属性的对照越充分,实验假设理论的检验也越确证。充分认识这些对于中医药科学实验设计水平的提高有积极的意义。 展开更多
关键词 中医药 科学实验 对照 证伪 科学哲学
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生物大分子凝聚体研究相关术语
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作者 阮科 方晓峰 +7 位作者 李丹 李丕龙 吝易 王峥 施蕴渝 张明杰 张宏 刘聪 《生物化学与生物物理进展》 北大核心 2025年第4期1027-1035,共9页
蛋白质和RNA等生物大分子通过多价弱相互作用发生相分离,从而形成具有动态特性的液态凝聚体,其进一步发生相转变形成不同物质状态比如胶装或固状的凝聚体。这些凝聚体能够在细胞内对多种生命活动进行精确的时空调控。然而,随着对该领域... 蛋白质和RNA等生物大分子通过多价弱相互作用发生相分离,从而形成具有动态特性的液态凝聚体,其进一步发生相转变形成不同物质状态比如胶装或固状的凝聚体。这些凝聚体能够在细胞内对多种生命活动进行精确的时空调控。然而,随着对该领域研究的拓展和深入,相关术语使用的混乱和不规范问题逐渐显现,阻碍了学术交流和科学知识的传播。因此,有必要对生物大分子凝聚体相关术语进行讨论,以明确概念、促进跨学科合作、提高研究效率,从而推动生物大分子凝聚体领域的健康发展。 展开更多
关键词 生物大分子凝聚体 术语使用建议
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基于嗜盐底盘的可再生资源利用与生物制造
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作者 王婉泽 丁军 +1 位作者 闫煦 陈国强 《化工进展》 北大核心 2025年第5期2421-2428,共8页
在“碳中和”目标的驱动下,以化石燃料为原料的传统生产模式正在逐渐被绿色、可持续发展的生物制造所替代。嗜盐微生物是一类需要在高盐环境中才能正常生长的微生物,因其适应极端条件的特性和在资源化利用中的潜力,近年来受到生物制造... 在“碳中和”目标的驱动下,以化石燃料为原料的传统生产模式正在逐渐被绿色、可持续发展的生物制造所替代。嗜盐微生物是一类需要在高盐环境中才能正常生长的微生物,因其适应极端条件的特性和在资源化利用中的潜力,近年来受到生物制造行业的广泛关注和研究。本文综述了盐单胞菌在开放式连续发酵的条件下合成可降解的生物基塑料——聚羟基脂肪酸酯(PHA)的研究进展,同时探讨了其应用廉价底物或废弃物生产多种高附加值产品的可行性,为生物制造业的可持续发展提供了有利支持。通过开发基因调控元件、优化基因编辑技术以及改造代谢通路和形态学特性,盐单胞菌作为底盘细胞低成本生产多种聚合物、小分子化合物、氨基酸和蛋白质的应用潜力进一步提升。在廉价碳源的资源化利用方面,本文介绍了嗜盐微生物利用淀粉、纤维素、乙酸、餐厨废弃物等为底物生长和生产的相关研究。最后,展望了利用盐单胞菌进行一碳资源高值化应用的潜力和前景,以推动下一代工业生物技术发展和“碳中和”目标的实现。 展开更多
关键词 嗜盐微生物 下一代工业生物技术 聚羟基脂肪酸酯 可再生能源 碳中和
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石墨烯载网在冷冻电镜样品制备中的应用研究
16
作者 宋佶岭 张晨辉 +2 位作者 付韵桥 王宏伟 刘楠 《电子显微学报》 北大核心 2025年第1期106-114,共9页
在冷冻电镜结构解析过程中,样品制备是关键限速步骤之一,经常受到气液界面等问题困扰。石墨烯支撑膜能够富集生物样品颗粒、降低电子束照射导致的样品漂移和充电效应,并且具有较低的背景噪音,已经被应用于冷冻样品的制备,缓解气液界面... 在冷冻电镜结构解析过程中,样品制备是关键限速步骤之一,经常受到气液界面等问题困扰。石墨烯支撑膜能够富集生物样品颗粒、降低电子束照射导致的样品漂移和充电效应,并且具有较低的背景噪音,已经被应用于冷冻样品的制备,缓解气液界面等问题造成的影响,提高样品制备成功率。为了更广泛地将石墨烯载网用以冷冻电镜样品制备,本文介绍了石墨烯膜覆盖度的表征办法和对比了不同亲水化处理条件对石墨烯支撑膜产生的影响,着重针对使用石墨烯载网制备冷冻样品时出现的一些异常冰层现象进行了研究分析,并讨论了冷冻样品制备过程中溶液的扩散过程。该研究加深了对石墨烯表面液体分布和扩散过程的理解,为优化使用石墨烯载网用以冷冻电镜样品制备提供了基础。 展开更多
关键词 冷冻电镜 样品制备 石墨烯 生物大分子
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植物硝酸盐转运蛋白家族NPF及其蛋白修饰调控机制研究进展
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作者 寇玉晨 谢一宁 +2 位作者 袁艳辉 单晓昳 张曦 《遗传》 北大核心 2025年第10期1118-1131,共14页
氮素是植物生长不可或缺的大量元素,而硝酸盐是植物主要的氮素来源,其供需关系对植物发育起决定性影响。NRT1/PTR家族(nitrate transporter 1/peptide transporter family,NPF)作为主要的硝酸盐转运家族,在硝酸盐摄取过程中扮演着关键... 氮素是植物生长不可或缺的大量元素,而硝酸盐是植物主要的氮素来源,其供需关系对植物发育起决定性影响。NRT1/PTR家族(nitrate transporter 1/peptide transporter family,NPF)作为主要的硝酸盐转运家族,在硝酸盐摄取过程中扮演着关键的角色。在植物研究中,该类蛋白可通过蛋白翻译后修饰来调控其功能,进而调控硝酸盐感知、摄取以及植物发育。NRT1.1(NPF6.3/CHL1)是NPF的重要成员之一,兼具硝酸盐转运和感受器的双重功能。本文综述了拟南芥(Arabidopsis thaliana)、水稻(Oryza sativa)和玉米(Zea mays)等NPF硝酸盐转运蛋白家族在调节硝酸盐摄取及利用中的作用,总结了蛋白翻译后的修饰对硝酸盐转运与植物发育的影响。最后,展望了在树木中开展相关研究的前景,以期为提高树木氮肥利用效率、增强其抗逆能力和生态环境保护提供科学依据和技术支持。 展开更多
关键词 硝酸盐转运蛋白 氮利用效率 蛋白质翻译后修饰 树木
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化债背景下银政金融业务对商业银行的影响和发展策略研究
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作者 张圆圆 季忠艳 熊舒莉 《武汉金融》 北大核心 2025年第2期78-88,共11页
新时期政府投融资以市场化为主导,向国企资产运营化和运营资产证券化的方向发展是必然选择。银政金融业务作为商业银行重要的业务领域,随着政府债务情况的变化将面临新的机遇和挑战。本文在论述银政金融业务发展现状的基础上,从商业银... 新时期政府投融资以市场化为主导,向国企资产运营化和运营资产证券化的方向发展是必然选择。银政金融业务作为商业银行重要的业务领域,随着政府债务情况的变化将面临新的机遇和挑战。本文在论述银政金融业务发展现状的基础上,从商业银行经营绩效和信用风险两个维度论证了银政金融业务的价值贡献与风险程度,并提出银政金融业务发展的政策建议:地方政府投融资应着力提升国有资产投资回报率和价值创造能力,以政府引导基金为支撑,创新新增投资业务合作模式,同时以公募REITs业务为抓手,盘活存量业务;商业银行要制定差异化经营策略,严格管控传统政府类金融业务风险,同时构建产业生态链,创新股权财政金融服务模式。 展开更多
关键词 银政金融业务 商业银行 地方政府债务
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CryoSeek(酷寻)——利用冷冻电镜开启结构生物学发现的新范式
19
作者 王彤彤 李张强 颜宁 《电子显微学报》 北大核心 2025年第1期136-143,共8页
随着冷冻电镜技术的突破以及AI辅助的结构预测和自动模型搭建算法的发展,结构生物学正在经历由目标结构解析到结构引导的未知生物大分子发现的范式转变。本综述回顾了冷冻电镜的发展历史,并介绍CryoSeek(酷寻)研究策略:利用冷冻电镜探... 随着冷冻电镜技术的突破以及AI辅助的结构预测和自动模型搭建算法的发展,结构生物学正在经历由目标结构解析到结构引导的未知生物大分子发现的范式转变。本综述回顾了冷冻电镜的发展历史,并介绍CryoSeek(酷寻)研究策略:利用冷冻电镜探索自然环境中完全未知的生物大分子结构。作者从清华大学的荷塘采集水样作为CryoSeek研究的起点,经过过滤和富集后,通过冷冻电镜观察到多种纤维结构,并获得了两种相似螺旋TLP-1a/b的高分辨率图谱,其原子模型由AI辅助的CryoNet自动搭建。结构分析表明TLP-1a/b通过供体链交换模式组装。结构比对和序列分析显示TLP-1a/b可能是未鉴定的细菌菌毛。以上研究表明高分辨率结构解析引导并推动了未知生物大分子的识别,标志着结构生物学研究的新兴范式的建立。 展开更多
关键词 冷冻电镜 结构生物学 CryoSeek 纤维 供体链交换
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转运必需内体分选复合物螺旋纤丝Vps24⁃Vps2的冷冻电镜结构研究
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作者 刘德生 李耀旺 孙珊 《电子显微学报》 北大核心 2025年第1期28-35,共8页
转运必需内体分选复合物-Ⅲ(endosomal sorting complex required for transport-Ⅲ,ESCRT-Ⅲ)介导了一系列细胞膜重塑事件,包括多囊体的形成、细胞分裂和病毒释放等。这些过程的关键步骤之一是将ESCRT-Ⅲ蛋白亚基组装成纤丝状结构。在... 转运必需内体分选复合物-Ⅲ(endosomal sorting complex required for transport-Ⅲ,ESCRT-Ⅲ)介导了一系列细胞膜重塑事件,包括多囊体的形成、细胞分裂和病毒释放等。这些过程的关键步骤之一是将ESCRT-Ⅲ蛋白亚基组装成纤丝状结构。在本研究中,作者利用冷冻电镜技术解析了由Vps24和Vps2融合蛋白(Vps24-Vps2)形成的双链螺旋纤丝的结构,分辨率为4.07A。在该结构中,呈伸展构象的Vps24-Vps2单体首先形成反向结合的二聚体,二聚体之间再错位结合形成一股螺旋,两股螺旋互相缠绕最终形成纤丝。该结构为理解ESCRT-Ⅲ丝状结构组装以及解聚过程提供了结构基础。 展开更多
关键词 转运必需内体分选复合物 ESCRT Vps24 Vps2 冷冻电镜结构
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