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合成生物学研究中的微生物启动子工程策略被引量：12: 1; 作者于慧敏郑煜堃 +2 位作者杜岩王苗苗梁有向《合成生物学》 CSCD 2021年第4期598-611,共14页; 合成生物学研究对于我国绿色生物制造产业和可持续发展战略至关重要。启动子是合成生物学核心元件,是在转录水平上实现基因高效、精准表达调控的最关键因素之一。本文重点对原核微生物启动子工程研究的基本内容、研究进展及发展趋势进... 展开更多; 关键词合成生物学启动子工程调控机制改造策略诱导信号动态代谢调控人工智能从头设计; 在线阅读下载PDF 职称材料

微生物细胞工厂生产化学品的研究进展——以几种典型小分子和大分子化学品为例被引量：1: 2; 作者郑煜堃孙青 +1 位作者陈振于慧敏《化工学报》 EI CAS CSCD 北大核心 2021年第12期6109-6121,共13页; 微生物细胞工厂的创制和优化改造是绿色生物制造的重要内容。基于构建高效微生物细胞工厂的主要使能技术及其新发展,以几种典型小分子和大分子化学品为例,综述了微生物细胞工厂生产化学品的研究进展。讨论了启动子工程、代谢流分析等经... 展开更多; 关键词微生物细胞工厂使能技术代谢工程大宗化学品大分子; 在线阅读下载PDF 职称材料

基于极端微生物的生物制造被引量：1: 3; 作者邵明威孙思勉 +1 位作者杨时茂陈国强《合成生物学》 CSCD 北大核心 2024年第6期1419-1436,共18页; 以微生物或酶为基础的生物制造,正以其绿色、环保、可持续等优势逐渐替代以化石燃料为原料的传统化工生产模式。然而,传统工业生物技术存在易染菌、设备复杂、难以连续发酵等劣势。相较而言,“下一代工业生物技术”(NGIB)利用以嗜盐菌... 展开更多; 关键词极端微生物嗜盐菌下一代工业生物技术生物制造聚羟基丁酸基因工程代谢工程合成生物学无灭菌发酵非粮生物原料; 在线阅读下载PDF 职称材料

游离细胞催化法生产丙烯酰胺的菌株改造策略被引量：1: 4; 作者于慧敏焦松沈忠耀《生物产业技术》 2017年第6期52-58,共7页; 丙烯酰胺是一种重要的酰胺类化合物,其聚合产物——聚丙烯酰胺被广泛应用于三次采油、水处理、造纸、冶金等领域。以腈水合酶为核心的生物催化法,尤其是游离细胞催化法,具有转化效率高、产物纯度高以及环境友好等优点,是目前丙烯酰胺生... 展开更多; 关键词丙烯酰胺腈水合酶游离细胞催化细胞和胞内酶的协同改造; 在线阅读下载PDF 职称材料

生化工程界的引领者--悼念王义翘教授: 5; 作者于慧敏《合成生物学》 CSCD 2021年第4期468-469,共2页; 第一次听闻王义翘(Daniel I.C.Wang)教授的名字,是在我的导师沈忠耀教授那里--他是清华大学化学工程系生物化工研究所的第一任所长。当王义翘教授在1984年应国家科委生物工程中心的邀请来华访问并对我国生物技术方向“九五”规划提出建... 展开更多; 关键词生化工程国家科委生物化工化工系化学工程系生物工程沈忠基因工程; 在线阅读下载PDF 职称材料

代谢物生物传感器:微生物细胞工厂构建中的合成生物学工具被引量：6: 6; 作者周益康吴亦楠 +3 位作者王天民郑翔邢新会张翀《生物技术通报》 CAS CSCD 北大核心 2017年第1期1-11,共11页; 代谢物生物传感器作为重要的合成生物学工具,能够感应细胞内代谢物浓度的变化,转化为特定信号输出,在微生物细胞工厂的构建中显现出巨大的应用潜力。其主要组成部分通常包括生物识别元件和信号输出元件,前者来源于自然界中丰富的调控元... 展开更多; 关键词代谢物生物传感器响应机理响应性能微生物细胞工厂; 在线阅读下载PDF 职称材料

生物合成脂肽的驱油降黏性能评价及微观驱油机理研究被引量：2: 7; 作者马天祥于慧敏 +3 位作者逯德成王苗苗何欣王琦《石油化工》 CAS CSCD 北大核心 2021年第12期1317-1322,共6页; 对脂肽类生物表面活性剂进行了岩心驱油和稠油降黏评价,并初步探索了脂肽类表面活性剂的微观驱油机理。实验结果表明,加入脂肽类表面活性剂的四元复合驱体系可以显著降低化学表面活性剂用量,采收率比三元复合驱提高了2.1百分点。采用含... 展开更多; 关键词脂肽类表面活性剂驱油降黏微观机理; 在线阅读下载PDF 职称材料

题名合成生物学研究中的微生物启动子工程策略被引量：12: 1; 作者于慧敏郑煜堃杜岩王苗苗梁有向; 机构清华大学化学工程系; 出处《合成生物学》 CSCD 2021年第4期598-611,共14页; 基金国家重点研发计划(2018YFA0902200) 国家自然科学基金面上项目(21776157,22078173)。; 文摘合成生物学研究对于我国绿色生物制造产业和可持续发展战略至关重要。启动子是合成生物学核心元件,是在转录水平上实现基因高效、精准表达调控的最关键因素之一。本文重点对原核微生物启动子工程研究的基本内容、研究进展及发展趋势进行了综述。首先概述了启动子序列基本特征及其受RNA聚合酶σ因子识别调控的一般规律;并以大肠杆菌乳糖操纵子为例简要介绍了诱导型启动子的负调控与正调控诱导机制。其次,分别从对靶基因自身内源启动子进行突变改造以及采用高效外源启动子进行替换改造这两个方面入手,阐述了启动子改造的常用策略。进一步对近年来公开报道的不同类型诱导型启动子进行了梳理,小结了代表性化学分子诱导剂以及物理信号诱导方式的种类及基本特征。简述了非模式和模式微生物组成型启动子的研究进展及研究侧重点。结合动态代谢调控技术及人工智能工具的突破性发展,提出具有动态调控功能的特殊启动子的发现与改造、全新性能启动子元件的人工智能设计与改造等将成为启动子工程研究的新方向与新前沿。最后分析了启动子工程领域存在的挑战性问题,展望了今后的研究重点,并结合合成生物学的发展,进一步强调了微生物启动子工程的重要作用。; 关键词合成生物学启动子工程调控机制改造策略诱导信号动态代谢调控人工智能从头设计; Keywords synthetic biology promoter engineering regulation mechanism evolution strategies induction signals dynamic metabolic regulation AI de novo design; 分类号 Q812 [生物学—生物工程]; 在线阅读下载PDF 职称材料

题名微生物细胞工厂生产化学品的研究进展——以几种典型小分子和大分子化学品为例被引量：1: 2; 作者郑煜堃孙青陈振于慧敏; 机构清华大学化学工程系; 出处《化工学报》 EI CAS CSCD 北大核心 2021年第12期6109-6121,共13页; 基金国家重点研发计划项目(2018YFA0901500,2018YFA0902200) 国家自然科学基金项目(21776157,22078173) 山东省重点研发计划(2020CXGC010602)。; 文摘微生物细胞工厂的创制和优化改造是绿色生物制造的重要内容。基于构建高效微生物细胞工厂的主要使能技术及其新发展,以几种典型小分子和大分子化学品为例,综述了微生物细胞工厂生产化学品的研究进展。讨论了启动子工程、代谢流分析等经典的使能技术和CRISPR基因编辑、诱变耦合高通量筛选、基于人工智能的生物信息学等新技术对于微生物细胞工厂构筑的重要作用。分别以有机醇、有机酸、有机胺小分子和多糖、聚酯类生物大分子的微生物合成为例,分析了如何面向不同特点的产物分子,设计实施不同的基因改造策略,并概述了近年来代表性菌株的生产性能。进一步展望了未来微生物细胞工厂生产化学品的总体发展趋势和应用前景。; 关键词微生物细胞工厂使能技术代谢工程大宗化学品大分子; Keywords microbial cell factory enabling technology metabolic engineering bulk chemicals macromolecules; 分类号 Q815 [生物学—生物工程]; 在线阅读下载PDF 职称材料

题名基于极端微生物的生物制造被引量：1: 3; 作者邵明威孙思勉杨时茂陈国强; 机构清华大学生命科学学院清华大学合成与系统生物学中心清华大学化学工程系; 出处《合成生物学》 CSCD 北大核心 2024年第6期1419-1436,共18页; 基金国家自然科学基金(32130001,21761132013,31771886,31971170)。; 文摘以微生物或酶为基础的生物制造,正以其绿色、环保、可持续等优势逐渐替代以化石燃料为原料的传统化工生产模式。然而,传统工业生物技术存在易染菌、设备复杂、难以连续发酵等劣势。相较而言,“下一代工业生物技术”(NGIB)利用以嗜盐菌、嗜热菌和嗜酸碱菌等极端微生物作为底盘细胞,使用廉价底物生产多种高附加值产品,具有开放、无需灭菌、连续发酵等优点。本文介绍了嗜盐菌、嗜热菌和嗜酸碱菌极端微生物的定义以及在高盐、高温、极度酸碱等极端环境下快速生长的特性。随后总结了目前极端微生物的基因工程手段例如启动子工程、以CRISPR为代表的基因编辑技术、命运共同体策略、稳定质粒载体等,代谢工程手段例如增加碳源前体、敲除旁路代谢、减少副产物、提高转运等,以及极端微生物生产的多种产品例如PHA、蛋白质、氨基酸及小分子衍生物等。同时概括了目前在极端微生物底盘细胞改造过程中仍存在的问题,如缺乏多种优秀的质粒载体、质粒转化效率低、缺乏高效基因编辑技术以及其他非嗜盐菌生长发酵周期较长等,并提出了相应的解决策略。最后展望了如何充分利用不同类型极端微生物的特性生产优势产品,推动下一代工业生物技术的发展与完善,实现绿色、环保、可持续的生物制造。; 关键词极端微生物嗜盐菌下一代工业生物技术生物制造聚羟基丁酸基因工程代谢工程合成生物学无灭菌发酵非粮生物原料; Keywords extremophiles Halomonas next-generation industrial biotechnology bioproduction PHB genetic engineering metabolic engineering synthetic biology unsterile fermentation non-food substrates; 分类号 Q816 [生物学—生物工程]; 在线阅读下载PDF 职称材料

题名游离细胞催化法生产丙烯酰胺的菌株改造策略被引量：1: 4; 作者于慧敏焦松沈忠耀; 机构清华大学化学工程系; 出处《生物产业技术》 2017年第6期52-58,共7页; 基金国家973计划(2013CB733600) 国家自然科学基金(21476126 21776157); 文摘丙烯酰胺是一种重要的酰胺类化合物,其聚合产物——聚丙烯酰胺被广泛应用于三次采油、水处理、造纸、冶金等领域。以腈水合酶为核心的生物催化法,尤其是游离细胞催化法,具有转化效率高、产物纯度高以及环境友好等优点,是目前丙烯酰胺生产的主要方法;而腈水合酶及其生产菌株的性能在丙烯酰胺生产工艺中起着至关重要的作用。分别从细胞层次和酶层次对常用的生产菌株性能改造策略进行了简介,并重点阐述了目前用于腈水合酶生产菌株改造的基因重组策略。最后介绍了腈水合酶和产酶细胞的协同改造策略及改造效果。其中,通过对产腈水合酶红球菌R.ruber TH在酶和细胞层面的协同改造,重组游离细胞TH8实现了工业规模约500g/L高浓丙烯酰胺的三批次水合制备。; 关键词丙烯酰胺腈水合酶游离细胞催化细胞和胞内酶的协同改造; Keywords acrylamide nitrile hydratase free-cell catalysis synergistic evolution of cells and in-cell enzymes; 分类号 TQ225.261 [化学工程—有机化工] TQ920.6 [轻工技术与工程—发酵工程]; 在线阅读下载PDF 职称材料

题名生化工程界的引领者--悼念王义翘教授: 5; 作者于慧敏; 机构清华大学化学工程系; 出处《合成生物学》 CSCD 2021年第4期468-469,共2页; 文摘第一次听闻王义翘(Daniel I.C.Wang)教授的名字,是在我的导师沈忠耀教授那里--他是清华大学化学工程系生物化工研究所的第一任所长。当王义翘教授在1984年应国家科委生物工程中心的邀请来华访问并对我国生物技术方向“九五”规划提出建议的时候,沈忠耀老师就与他相识了。当时,清华大学化工系正在创建生物化工学科。此后,1997年,王义翘教授和他的弟子胡维硕教授,又应邀来华参加清华大学主办的亚太生化工程国际会议并做大会报告,此时我作为大会组委会的博士生志愿者,有幸初识了王教授。他对基因工程、发酵工程技术以及生物化工产业重要性的预判及其必将蓬勃兴起的预见,以及他在报告中、交流中所展现出来的渊博知识、学者风度,都给我留下了极其深刻的印象。; 关键词生化工程国家科委生物化工化工系化学工程系生物工程沈忠基因工程; 分类号 K837.12 [历史地理—历史学]; 在线阅读下载PDF 职称材料

题名代谢物生物传感器:微生物细胞工厂构建中的合成生物学工具被引量：6: 6; 作者周益康吴亦楠王天民郑翔邢新会张翀; 机构清华大学化学工程系教育部工业生物催化重点实验室清华大学合成与系统生物学研究中心; 出处《生物技术通报》 CAS CSCD 北大核心 2017年第1期1-11,共11页; 文摘代谢物生物传感器作为重要的合成生物学工具,能够感应细胞内代谢物浓度的变化,转化为特定信号输出,在微生物细胞工厂的构建中显现出巨大的应用潜力。其主要组成部分通常包括生物识别元件和信号输出元件,前者来源于自然界中丰富的调控元件,如转录因子、核糖开关等,有着不同的响应机理,后者可以为荧光信号、生长优势、特定代谢通路的开闭等,取决于应用所需。着重介绍了近年来代谢物生物传感器在微生物细胞工厂构建中的应用实例,主要包括目标化合物菌株的高通量筛选、选择、胞内代谢动态调控和非遗传异质性选择,同时也着重讨论了代谢物生物传感器的性能对于应用的影响和在实际应用中可能面临的机遇与挑战。; 关键词代谢物生物传感器响应机理响应性能微生物细胞工厂; Keywords metabolite biosensor response mechanism performance microbial cell factory.; 分类号 Q81 [生物学—生物工程] TP212.3 [自动化与计算机技术—检测技术与自动化装置]; 在线阅读下载PDF 职称材料

题名生物合成脂肽的驱油降黏性能评价及微观驱油机理研究被引量：2: 7; 作者马天祥于慧敏逯德成王苗苗何欣王琦; 机构中国石油大庆炼化分公司清华大学化学工程系教育部工业生物催化重点实验室; 出处《石油化工》 CAS CSCD 北大核心 2021年第12期1317-1322,共6页; 基金国家重点研发计划项目(2016YFB0301500) 中国石油天然气股份有限公司科学研究与技术开发项目(2016B-2803(GF))。; 文摘对脂肽类生物表面活性剂进行了岩心驱油和稠油降黏评价,并初步探索了脂肽类表面活性剂的微观驱油机理。实验结果表明,加入脂肽类表面活性剂的四元复合驱体系可以显著降低化学表面活性剂用量,采收率比三元复合驱提高了2.1百分点。采用含脂肽的碱性溶液作为复配降黏剂,在m(降黏剂)∶m(稠油)=1∶1、脂肽0.2 g/L、碱性盐1.2 g/L条件下,稠油体系降黏率达98.8%。进一步的微观驱油机理研究发现,该脂肽类表面活性剂分子极性强、可改变基质润湿性、降低油水界面张力、将水驱后模型通路中的剩余油乳化为油滴,显著提高微观洗油效率,从而强化驱油效果。; 关键词脂肽类表面活性剂驱油降黏微观机理; Keywords lipopeptide surfactant oil flooding viscosity reduction microscopic flooding mechanism; 分类号 TE357 [石油与天然气工程—油气田开发工程]; 在线阅读下载PDF 职称材料

	题名	作者	出处	发文年	被引量	操作
1	合成生物学研究中的微生物启动子工程策略	于慧敏郑煜堃杜岩王苗苗梁有向	《合成生物学》 CSCD	2021	12	在线阅读下载PDF 职称材料
2	微生物细胞工厂生产化学品的研究进展——以几种典型小分子和大分子化学品为例	郑煜堃孙青陈振于慧敏	《化工学报》 EI CAS CSCD 北大核心	2021	1	在线阅读下载PDF 职称材料
3	基于极端微生物的生物制造	邵明威孙思勉杨时茂陈国强	《合成生物学》 CSCD 北大核心	2024	1	在线阅读下载PDF 职称材料
4	游离细胞催化法生产丙烯酰胺的菌株改造策略	于慧敏焦松沈忠耀	《生物产业技术》	2017	1	在线阅读下载PDF 职称材料
5	生化工程界的引领者--悼念王义翘教授	于慧敏	《合成生物学》 CSCD	2021	0	在线阅读下载PDF 职称材料
6	代谢物生物传感器:微生物细胞工厂构建中的合成生物学工具	周益康吴亦楠王天民郑翔邢新会张翀	《生物技术通报》 CAS CSCD 北大核心	2017	6	在线阅读下载PDF 职称材料
7	生物合成脂肽的驱油降黏性能评价及微观驱油机理研究	马天祥于慧敏逯德成王苗苗何欣王琦	《石油化工》 CAS CSCD 北大核心	2021	2	在线阅读下载PDF 职称材料