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斜带石斑鱼、赤点石斑鱼RAPD和线粒体Cyt b基因序列变异分析
被引量：
16
1
作者
蒙子宁
杨丽萍
+5 位作者
吴丰
张勇
刘晓春
郭奕惠
庄怡谋
林浩然
《中山大学学报（自然科学版）》
CAS
CSCD
北大核心
2007年第1期75-80,共6页
斜带石斑鱼和赤点石斑鱼为具有重要经济价值的海水鱼类。对这两种石斑鱼进行了随机扩增多态DNA(RAPD)和线粒体细胞色素b(Cyt b)基因序列变异分析。计算多态位点百分率、基因多样性和香农信息指数等遗传参数,以此评估种内遗传变异水平;...
斜带石斑鱼和赤点石斑鱼为具有重要经济价值的海水鱼类。对这两种石斑鱼进行了随机扩增多态DNA(RAPD)和线粒体细胞色素b(Cyt b)基因序列变异分析。计算多态位点百分率、基因多样性和香农信息指数等遗传参数,以此评估种内遗传变异水平;通过统计变异位点、平均核苷酸差异数、核苷酸多样性以及种间平均每位点核苷酸替代数进行基因序列变异分析,并构建UPGMA系统树。结果表明:斜带石斑鱼的遗传多样性水平高于赤点石斑鱼,这可能与它们在种内特定遗传结构、分布范围大小、自然资源状况的差异有关;斜带石斑鱼和赤点石斑鱼之间检测到的种特异RAPD条带以及基因序列的变异,可作为种间分子鉴定标记。
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关键词
斜带石斑鱼
赤点石斑鱼
RAPD
线粒体CYTB
遗传变异
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职称材料
斜带石斑鱼养殖群体遗传多样性的RAPD分析
被引量：
4
2
作者
蒙子宁
杨丽萍
+5 位作者
吴丰
张勇
刘晓春
郭奕惠
庄怡谋
林浩然
《热带海洋学报》
CAS
CSCD
北大核心
2007年第2期44-48,共5页
利用随机扩增多态DNA(RAPD)技术分析了斜带石斑鱼Epinephelus coioides繁育亲本以及2001、2004年孵育的2批子代群体的遗传多样性。17个引物共扩增出104个位点。应用生物软件POPGENE进行统计分析,3个取样群体的多态位点百分率分别为32.6...
利用随机扩增多态DNA(RAPD)技术分析了斜带石斑鱼Epinephelus coioides繁育亲本以及2001、2004年孵育的2批子代群体的遗传多样性。17个引物共扩增出104个位点。应用生物软件POPGENE进行统计分析,3个取样群体的多态位点百分率分别为32.69%(繁育亲本)、30.77%(2001年子代)和24.04%(2004年子代);基因多样性和香侬信息指数均为繁育亲本群体最高(0.110 8和0.167 0)、2004年子代群体最低(0.066 6和0.103 8)。通过t检验检测群体间遗传多样性的差异显著程度并根据Nei公式计算遗传相似度和遗传距离分析群体间的遗传分化。结果表明,RAPD技术具有较高的灵敏性和多态性,是分析评估斜带石斑鱼遗传多样性较为适宜的分子标记之一;人工养殖不仅使斜带石斑鱼遗传多样性逐年下降,而且目前已经降低到显著的程度,近交和遗传漂变可能是导致遗传多样性下降的2个重要因素。最后对保持斜带石斑鱼遗传多样性的养殖策略进行了探讨。
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关键词
斜带石斑鱼Epinephelus
coioides
养殖群体
遗传多样性
RAPD
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职称材料
题名
斜带石斑鱼、赤点石斑鱼RAPD和线粒体Cyt b基因序列变异分析
被引量：
16
1
作者
蒙子宁
杨丽萍
吴丰
张勇
刘晓春
郭奕惠
庄怡谋
林浩然
机构
中山大学水生经济动物研究所暨广东省水生经济动物良种繁育重点实验室
中国水产科学研究院南海水产研究所
深圳龙歧庄实业发展有限公司
出处
《中山大学学报（自然科学版）》
CAS
CSCD
北大核心
2007年第1期75-80,共6页
基金
国家海洋863计划资助项目(2001AA621010
2003AA603011)
+1 种基金
中国博士后科学基金资助项目(2004036521)
中国水产科学院水产种质资源与养殖技术重点开放实验室开放基金资助项目(2004A006)
文摘
斜带石斑鱼和赤点石斑鱼为具有重要经济价值的海水鱼类。对这两种石斑鱼进行了随机扩增多态DNA(RAPD)和线粒体细胞色素b(Cyt b)基因序列变异分析。计算多态位点百分率、基因多样性和香农信息指数等遗传参数,以此评估种内遗传变异水平;通过统计变异位点、平均核苷酸差异数、核苷酸多样性以及种间平均每位点核苷酸替代数进行基因序列变异分析,并构建UPGMA系统树。结果表明:斜带石斑鱼的遗传多样性水平高于赤点石斑鱼,这可能与它们在种内特定遗传结构、分布范围大小、自然资源状况的差异有关;斜带石斑鱼和赤点石斑鱼之间检测到的种特异RAPD条带以及基因序列的变异,可作为种间分子鉴定标记。
关键词
斜带石斑鱼
赤点石斑鱼
RAPD
线粒体CYTB
遗传变异
Keywords
Epinephelus coioides
E. akaara
RAPD
mitochondrial Cyt b
genetic variation
分类号
Q7 [生物学—分子生物学]
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题名
斜带石斑鱼养殖群体遗传多样性的RAPD分析
被引量：
4
2
作者
蒙子宁
杨丽萍
吴丰
张勇
刘晓春
郭奕惠
庄怡谋
林浩然
机构
中山大学水生经济动物研究所广东省水生经济动物良种繁育重点实验室
中国水产科学研究院南海水产研究所
深圳龙歧庄实业发展有限公司
出处
《热带海洋学报》
CAS
CSCD
北大核心
2007年第2期44-48,共5页
基金
国家海洋"863"项目(2001AA621010
2003AA603011)
+1 种基金
中国博士后科学基金(2004036521)
中国水产科学院水产种质资源与养殖技术重点开放实验室开放基金项目(2004A006)
文摘
利用随机扩增多态DNA(RAPD)技术分析了斜带石斑鱼Epinephelus coioides繁育亲本以及2001、2004年孵育的2批子代群体的遗传多样性。17个引物共扩增出104个位点。应用生物软件POPGENE进行统计分析,3个取样群体的多态位点百分率分别为32.69%(繁育亲本)、30.77%(2001年子代)和24.04%(2004年子代);基因多样性和香侬信息指数均为繁育亲本群体最高(0.110 8和0.167 0)、2004年子代群体最低(0.066 6和0.103 8)。通过t检验检测群体间遗传多样性的差异显著程度并根据Nei公式计算遗传相似度和遗传距离分析群体间的遗传分化。结果表明,RAPD技术具有较高的灵敏性和多态性,是分析评估斜带石斑鱼遗传多样性较为适宜的分子标记之一;人工养殖不仅使斜带石斑鱼遗传多样性逐年下降,而且目前已经降低到显著的程度,近交和遗传漂变可能是导致遗传多样性下降的2个重要因素。最后对保持斜带石斑鱼遗传多样性的养殖策略进行了探讨。
关键词
斜带石斑鱼Epinephelus
coioides
养殖群体
遗传多样性
RAPD
Keywords
Epinephelus coioides
cultured stock
genetic diversity
random amplified polymorphic DNA （RAPD）
分类号
Q319.2 [生物学—遗传学]
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作者
出处
发文年
被引量
操作
1
斜带石斑鱼、赤点石斑鱼RAPD和线粒体Cyt b基因序列变异分析
蒙子宁
杨丽萍
吴丰
张勇
刘晓春
郭奕惠
庄怡谋
林浩然
《中山大学学报（自然科学版）》
CAS
CSCD
北大核心
2007
16
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职称材料
2
斜带石斑鱼养殖群体遗传多样性的RAPD分析
蒙子宁
杨丽萍
吴丰
张勇
刘晓春
郭奕惠
庄怡谋
林浩然
《热带海洋学报》
CAS
CSCD
北大核心
2007
4
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