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题名玻璃珠-涡旋振荡改良法用于硅藻DNA提取
被引量：2
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作者
蔡杰
王博
胡孙林
曲一泓
宋涛
陈建华
邓建强
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机构
海南医学院法医学教研室海南省热带法医学司法鉴定工程研究中心
深圳美恩美科技有限公司
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出处
《法医学杂志》
CAS
CSCD
2022年第1期119-126,共8页
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基金
国家自然科学基金资助项目(81560304,82060341)
海南省院士创新平台科研专项资助项目(YSPTZX202134)。
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文摘
目的检验玻璃珠-涡旋振荡改良法提升硅藻DNA提取的效果。方法以DNeasyPowerSoilPro试剂盒为对照,另选取2种不同原理的植物DNA提取试剂盒(新型植物基因组DNA提取试剂盒、PlantDNA Isolation试剂盒)和1种血液DNA提取试剂盒(全血基因组DNA提取试剂盒)对同一水样及同一溺死案件肺组织的硅藻DNA进行提取。设计不同大小玻璃珠质量比和涡旋振荡时间的组合,选择加入玻璃珠振荡的最佳DNA提取条件。将常规组与改良组的提取产物直接进行电泳,经硅藻特异性PCR扩增检测,采用qPCR对提取物进行定量,对各组的Ct值进行统计学分析。结果当涡旋振荡频率为3000r/min时,DNA提取的最佳组合为涡旋振荡4 min,大小玻璃珠质量比为1∶1。以DNeasyPowerSoilPro试剂盒的Ct值为参照,10 mL水样的Ct值大于0.5g组织的Ct值。其他3种试剂盒采用玻璃珠-涡旋振荡改良法后,用于植物DNA提取的2种试剂盒Ct值均下降,且改良前后组织的Ct值差异均有统计学意义(P<0.05);全血基因组DNA提取试剂盒可以成功提取硅藻DNA,水样提取效果接近DNeasyPowerSoilPro试剂盒,改良法用于组织样本后,其Ct值差异有统计学意义(P<0.05);但应用3种试剂盒对水样中硅藻DNA进行提取时,改良前后的Ct值只有新型植物基因组DNA提取试剂盒差异具有统计学意义(P<0.05)。结论玻璃珠-涡旋振荡改良法可提高植物及血液DNA提取试剂盒对法医学检材中硅藻DNA的提取效果,特别是对组织样本中硅藻DNA的提取。
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关键词
法医病理学
溺死
DNA提取
硅藻
玻璃珠-涡旋振荡改良法
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Keywords
forensic pathology
drowning
DNA extraction
diatom
glass bead-vortex oscillation improv‐ing method
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分类号
DF795.1
[医药卫生—法医学]
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