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神经胶质瘤中自噬和铁死亡相关特征基因的生物信息学分析
1
作者 杨小红 陈旭永 +4 位作者 应卓鹏 方贾栩 战跃福 关莹 陈建强 《海南医科大学学报》 北大核心 2025年第14期1057-1068,共12页
目的:神经胶质瘤(Glioma)是最常见的脑原发性恶性肿瘤,对人们构成巨大威胁。研究表明自噬和铁死亡在Glioma发生、发展中具有重要作用,但其机制尚未完全阐明,为了揭示自噬和铁死亡与Glioma之间的密切关系,本研究通过确定差异特征基因的... 目的:神经胶质瘤(Glioma)是最常见的脑原发性恶性肿瘤,对人们构成巨大威胁。研究表明自噬和铁死亡在Glioma发生、发展中具有重要作用,但其机制尚未完全阐明,为了揭示自噬和铁死亡与Glioma之间的密切关系,本研究通过确定差异特征基因的潜在功能,寻找新的生物标志物和潜在的治疗靶点。方法:将GEO数据库的4个Glioma数据集进行合并,然后进行免疫细胞侵润评估。随后将相关基因与自噬和铁死亡数据库交集,筛选出差异基因后进行生物功能预测。随后采用两种机器学习算法获得与Glioma相关的自噬-铁死亡特征基因,并利用差异分析法、ROC曲线、IHC分析以及构建miRNA-genes调控网络分析确定这些特征基因的潜在价值。结果:基于生物信息学分析获得1 376个Glioma的差异表达基因(DEGs),免疫细胞浸润分析显示Glioma中的CD4+T细胞、单核细胞和嗜酸性粒细胞比例更高。然后DEGs与自噬-铁死亡相关基因交集筛选出12个差异表达自噬-铁死亡基因(DEAFGs),通过GO和KEGG分析显示这些DEAFGs主要富集于传染性病毒感染通路、癌症相关的通路和泛素介导的蛋白水解通路等。接下来,使用两种机器学习最终鉴定出6个与Glioma相关的自噬-铁死亡特征基因,其中5个上调(HIF1A、TNFAIP3、YAP1、BIRC5、AIM2)和1个下调(NEDD4L),ROC曲线分析显示这些特征基因AUC值范围为0.723至0.867。根据IHC分析,验证了YAP1和BIRC5的表达水平在胶质瘤中显著高于正常脑组织。miRNA-genes调控网络表明相关的miRNAs参与特征基因的调控,在Glioma中发挥潜在作用。结论:Glioma中自噬和铁死亡相关的6个特征基因具有诊断和预后的潜在功能,未来可能作为临床上的治疗靶点被开发利用。 展开更多
关键词 神经胶质瘤 自噬 铁死亡 生物信息学 特征基因
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以不同方式处理肌小梁和乳头肌后基于心脏MRI所测中国健康成人左心室结构和功能参数的差异 被引量：1
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作者 李更晓 张振 +7 位作者 周珊珊 谢佳楠 高艺源 刘淑蓉 赵之伟 赵军 孙凯 李坤成 《中国医学影像技术》 CSCD 北大核心 2023年第8期1186-1190,共5页
目的基于心脏MRI(CMRI)以不同方式处理肌小梁和乳头肌(TPM)后观察中国健康成人左心室结构和功能的差异。方法回顾性分析168名中国健康成人,包括男105名、女63名的CMRI资料。分别采用标准(将TPM包含于血池内)和精细(将TPM包含在心肌组织... 目的基于心脏MRI(CMRI)以不同方式处理肌小梁和乳头肌(TPM)后观察中国健康成人左心室结构和功能的差异。方法回顾性分析168名中国健康成人,包括男105名、女63名的CMRI资料。分别采用标准(将TPM包含于血池内)和精细(将TPM包含在心肌组织中)方法测量左心室舒张末期容积(EDV)、收缩末期容积(ESV)、每搏输出量(SV)及射血分数(EF),对比其间左心室结构和功能参数的差异。随机选取50名受试者,由2名观察者以相同方法测量上述参数,分析观察者间测量结果的一致性及其变异系数(CV)。结果相比标准方法测量结果,以精细方法所测全部、男性及女性受试者的EDV、ESV和SV均较小,而EF较大(P均<0.001);经体表面积校正后,以2种方法所获全部、男性及女性受试者EDV、ESV和SV差异均有统计学意义(P均<0.001)。观察者间以标准方法所获左心室EDV、ESV和EF的一致性均极好(ICC=0.90~0.94)、CV为3.10%~5.29%,以精细方法所测上述参数的一致性为好至极好(ICC=0.85~0.95),CV为4.36%~9.74%。结论基于CMRI以不同处理TPM方式所测中国健康成人左心室结构和功能参数存在差异。 展开更多
关键词 心室功能 左 磁共振成像 肌小梁和乳头肌
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磁共振动脉质子自旋标记成像在梗阻性肾病-肾纤维化中的实验研究 被引量：1
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作者 胡根文 刘宝良 +4 位作者 钟淑媛 魏晓婷 邹锦森 史凯宁 杨忠 《中国医学影像学杂志》 CSCD 北大核心 2019年第10期732-735,共4页
目的探讨磁共振动脉质子自旋标记(ASL)成像在梗阻性肾病-肾纤维化模型中的应用。材料与方法将48只SD大鼠随机分为梗阻前组及梗阻后1、2、3、4、5 d组,每组8只。采用手术梗阻左侧肾脏,以右肾作为对照。使用3.0T磁共振进行肾脏ASL成像以... 目的探讨磁共振动脉质子自旋标记(ASL)成像在梗阻性肾病-肾纤维化模型中的应用。材料与方法将48只SD大鼠随机分为梗阻前组及梗阻后1、2、3、4、5 d组,每组8只。采用手术梗阻左侧肾脏,以右肾作为对照。使用3.0T磁共振进行肾脏ASL成像以获得双肾血流量(RBF)。扫描后处死动物并行病理学检查,将影像结果与病理结果进行对照。结果梗阻后1、2、3、4、5 d组大鼠肾脏RBF随梗阻时间延长而逐步下降,梗阻后5 d组大鼠梗阻侧RBF相当于对侧的29.3%。α-平滑肌肌动蛋白(α-SMA)阳性面积比逐渐升高,梗阻后5 d组大鼠梗阻侧α-SMA阳性面积比为(9.37±2.26)%,较对侧[(0.19±0.03)%]显著增高,差异有统计学意义(P<0.01)。梗阻后各组肾脏RBF与α-SMA阳性面积比呈负相关(r=-0.72,P<0.01)。结论磁共振ASL可作为一种无创且不使用造影剂的新技术用于检测梗阻性肾病-肾纤维化进程中RBF的变化,有助于反映肾脏疾病的早期病理生理改变。 展开更多
关键词 肾病 输尿管梗阻 纤维化 磁共振成像 肾血流量 有效 疾病模型 动物 大鼠 Sprague-Dawley
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