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基于Fe_3O_4/乙二胺四乙酸磁性粒子的集成化蛋白质组学方法
1
作者
唐君
郭凯珠
+5 位作者
陈文东
宋培培
封顺
胡巢凤
许瑞莲
田瑞军
《色谱》
CAS
CSCD
北大核心
2016年第12期1263-1269,共7页
建立了基于Fe_3O_4/乙二胺四乙酸(EDTA)磁性粒子的集成化蛋白质组学研究方法。首先用共沉淀法合成EDTA负载的Fe_3O_4/EDTA磁性粒子。在优化的溶液条件下(95%乙腈-1%三氟乙酸,体积分数),100μg Fe_3O_4/EDTA磁性粒子可吸附12.4μg牛血清...
建立了基于Fe_3O_4/乙二胺四乙酸(EDTA)磁性粒子的集成化蛋白质组学研究方法。首先用共沉淀法合成EDTA负载的Fe_3O_4/EDTA磁性粒子。在优化的溶液条件下(95%乙腈-1%三氟乙酸,体积分数),100μg Fe_3O_4/EDTA磁性粒子可吸附12.4μg牛血清白蛋白(BSA),吸附容量是商品化磁珠的10倍左右。以BSA作为标准蛋白质,对所合成的Fe_3O_4/EDTA磁性粒子作为蛋白质组学反应器的酶解时间进行了优化,发现Fe_3O_4/EDTA磁性粒子处理BSA酶解1、8和16 h的肽段序列覆盖率和特征肽段结果相当。因此,可以将复杂的蛋白质样品前处理时间缩短至2 h内。最后,将所合成的Fe_3O_4/EDTA磁性粒子应用于血清的蛋白质组学研究,成功地鉴定出218种蛋白质,其中包含了41种美国食品药品管理局(FDA)认证的生物标志物。所发展的基于Fe_3O_4/EDTA磁性粒子的蛋白质组学样品前处理方法将蛋白质样品预富集、还原、烷基化、酶解、多肽除盐和洗脱等步骤集成到一起,减少了样品转移和处理所造成的损失。这种技术具有快速、灵敏和易于操作的特点,可用于临床蛋白质组学研究。
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关键词
Fe3O4/乙二胺四乙酸(Fe3O4/EDTA)
磁性粒子
蛋白质组学
样品前处理
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职称材料
题名
基于Fe_3O_4/乙二胺四乙酸磁性粒子的集成化蛋白质组学方法
1
作者
唐君
郭凯珠
陈文东
宋培培
封顺
胡巢凤
许瑞莲
田瑞军
机构
深圳市
人民医院肿瘤研究所
南方科技大学化学系
暨南大学基础医学院病理生理学系
西南交通大学生命科学与工程学院
深圳市细胞微环境重点实验室
出处
《色谱》
CAS
CSCD
北大核心
2016年第12期1263-1269,共7页
基金
国家自然科学基金项目(21575057)
深圳市科技计划项目(JCYJ20150901153557178
JSGG20160301103415523)~~
文摘
建立了基于Fe_3O_4/乙二胺四乙酸(EDTA)磁性粒子的集成化蛋白质组学研究方法。首先用共沉淀法合成EDTA负载的Fe_3O_4/EDTA磁性粒子。在优化的溶液条件下(95%乙腈-1%三氟乙酸,体积分数),100μg Fe_3O_4/EDTA磁性粒子可吸附12.4μg牛血清白蛋白(BSA),吸附容量是商品化磁珠的10倍左右。以BSA作为标准蛋白质,对所合成的Fe_3O_4/EDTA磁性粒子作为蛋白质组学反应器的酶解时间进行了优化,发现Fe_3O_4/EDTA磁性粒子处理BSA酶解1、8和16 h的肽段序列覆盖率和特征肽段结果相当。因此,可以将复杂的蛋白质样品前处理时间缩短至2 h内。最后,将所合成的Fe_3O_4/EDTA磁性粒子应用于血清的蛋白质组学研究,成功地鉴定出218种蛋白质,其中包含了41种美国食品药品管理局(FDA)认证的生物标志物。所发展的基于Fe_3O_4/EDTA磁性粒子的蛋白质组学样品前处理方法将蛋白质样品预富集、还原、烷基化、酶解、多肽除盐和洗脱等步骤集成到一起,减少了样品转移和处理所造成的损失。这种技术具有快速、灵敏和易于操作的特点,可用于临床蛋白质组学研究。
关键词
Fe3O4/乙二胺四乙酸(Fe3O4/EDTA)
磁性粒子
蛋白质组学
样品前处理
Keywords
Fe3O4/EDTA （ ethylenediaminetetraacetic acid）
magnetic beads
proteomics
sample preparation
分类号
O658 [理学—分析化学]
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职称材料
题名
作者
出处
发文年
被引量
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1
基于Fe_3O_4/乙二胺四乙酸磁性粒子的集成化蛋白质组学方法
唐君
郭凯珠
陈文东
宋培培
封顺
胡巢凤
许瑞莲
田瑞军
《色谱》
CAS
CSCD
北大核心
2016
0
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