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深圳市输入性寨卡病毒分离株的进化分析及生物学特性研究
1
作者
阳帆
黄亚兰
+4 位作者
黄穗滨
熊玲红
张晓敏
李玥
张仁利
《中国人兽共患病学报》
CAS
CSCD
北大核心
2021年第11期977-984,共8页
目的对从深圳宝安国际机场口岸入境的1例自柬埔寨归国发热人员进行寨卡病毒实验室检测,研究寨卡病毒分离株的遗传进化和生物学特征,为寨卡病毒病的预防控制提供参考依据。方法采集患者血液、唾液和尿液样本,采用荧光RT-PCR方法进行寨卡...
目的对从深圳宝安国际机场口岸入境的1例自柬埔寨归国发热人员进行寨卡病毒实验室检测,研究寨卡病毒分离株的遗传进化和生物学特征,为寨卡病毒病的预防控制提供参考依据。方法采集患者血液、唾液和尿液样本,采用荧光RT-PCR方法进行寨卡病毒核酸检测;选用多种组织培养细胞分离病毒,分别观察病毒株的致病变效应、空斑形成及病毒滴度等,并对两株病毒基因序列进行分子遗传进化研究,分析输入性病例来源。结果荧光RT-PCR结果显示,该病例血清、唾液以及尿液样本寨卡病毒核酸阳性并持续一段时间。首次成功从唾液和尿液标本中分离到寨卡病毒株,将其分别命名为ZIKV/S/SZ1901和ZIKV/U/SZ1901。两分离株均可引起Vero细胞病变,不引起BHK-21细胞病变;均可在Vero细胞中形成空斑,滴度分别为3.4×10^(5) pfu/mL、1.4×103 pfu/mL。RT-PCR扩增出预期大小约10272 bp片段,测序结果表明该片段与ZIKV/Hu/Thai/KngSG/17-D501株相应序列的同源性为99.6%。系统进化树显示该病毒属亚洲谱系,与输入至我国的其它寨卡病毒株位于不同的进化分支。寨卡病毒编码区氨基酸位点分析提示,SZ1901毒株在结构基因的氨基酸位点(D683E、V763M、T777M)和非结构基因NS1基因的(A188V)变异与近几年流行株完全相同。结论根据患者流行病学史、临床表现和实验室检测结果,确诊该病例为深圳市从柬埔寨输入性寨卡病毒感染病例,且寨卡病毒分离株具备与2016年以来流行的寨卡病毒大部分相同的分子基础。
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关键词
寨卡病毒
输入性病例
荧光RT-PCR
进化分析
生物学特性
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职称材料
深圳急性肠胃炎住院患儿中人副肠孤病毒临床和流行病学特征分析
被引量：
10
2
作者
祝亚楠
张海龙
+6 位作者
陈龙
姚相杰
杨洪
韩敏
关心
何雅青
胡贵方
《实用医学杂志》
CAS
北大核心
2020年第3期400-405,共6页
目的研究深圳地区急性肠胃炎住院患儿中人副肠孤病毒(HPeV)的临床和流行病学特征。方法收集2017年1月到2018年12月深圳地区5岁以下急性肠胃炎住院患儿粪便标本(常规细菌鉴定为阴性)497份,实时荧光RT⁃PCR方法检测HPeV,通过巢式PCR扩增VP3...
目的研究深圳地区急性肠胃炎住院患儿中人副肠孤病毒(HPeV)的临床和流行病学特征。方法收集2017年1月到2018年12月深圳地区5岁以下急性肠胃炎住院患儿粪便标本(常规细菌鉴定为阴性)497份,实时荧光RT⁃PCR方法检测HPeV,通过巢式PCR扩增VP3/VP1连接区片段进行分型,同时对患儿的流行病学和临床资料进行统计分析。结果497例患儿中,HPeV的阳性率为8.2%;男性HPeV阳性率为7.6%,女性HPeV阳性率为9.4%(χ2=0.491,P=0.501);0~6月龄患儿HPeV阳性率最高,且92.7%的HPeV阳性患儿月龄<24个月;深圳夏季(7~9月)HPeV的阳性率最高。HPeV阳性患儿主要临床表现为中热(38.1~39℃),腹泻频率平均>6次/d,以黏液便为主,常伴有呕吐,呕吐频率平均每天5次,呕吐物以胃内容物为主。HPeV阳性患儿较阴性患儿在有无呕吐和呕吐物性状差异具有统计学意义。本研究中共检测到HPeV⁃1(HPeV⁃1A和HPeV⁃1B亚型)、3、4、5、6和14在内的6种基因型,其中HPeV⁃1B(56.1%)为优势流行株,其次是HPeV⁃1A(17.1%)、HPeV⁃3(7.3%)、HPeV⁃4(7.3%)、HPeV⁃5(4.9%)、HPeV⁃6(4.9%)和HPeV⁃14(2.4%)。系统进化分析结果显示,大部分深圳分离株与兰州和广州来源的参考株核苷酸序列一致性高。结论本研究首次在深圳地区5岁以下急性肠胃炎住院患儿粪便中检测到HPeV,且在2017年和2018年有稳定的感染率,检测到6种HPeV基因型别可能与急性肠胃炎相关,HPeV夏季检出率最高,好发于0~6个月患儿,可能是引起急性肠胃炎住院患儿呕吐胃内容物的病因。开展HPeV监测以更充分地掌握其在深圳地区的流行和临床特征,有助于进一步明确深圳地区住院患儿病毒性急性肠胃炎病原谱构成。
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关键词
人副肠孤病毒
急性肠胃炎
儿童
基因分型
系统进化分析
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职称材料
1株粘质沙雷氏菌噬菌体的分离和鉴定
被引量：
1
3
作者
肖小平
陈依玲
张仁利
《中国人兽共患病学报》
CAS
CSCD
北大核心
2021年第4期373-377,共5页
目的以粘质沙雷氏菌为宿主菌,从河水中分离噬菌体,在体外和蚊虫肠道验证其裂解能力。方法以粘质沙雷氏菌为宿主菌,在深圳周边河水中分离噬菌体,通过单、双层平板筛选单一的烈性噬菌体;利用噬斑形成实验验证噬菌体的裂解谱;通过饲喂实验...
目的以粘质沙雷氏菌为宿主菌,从河水中分离噬菌体,在体外和蚊虫肠道验证其裂解能力。方法以粘质沙雷氏菌为宿主菌,在深圳周边河水中分离噬菌体,通过单、双层平板筛选单一的烈性噬菌体;利用噬斑形成实验验证噬菌体的裂解谱;通过饲喂实验验证噬菌体在埃及伊蚊肠道内的裂解作用。结果从深圳河流污水中成功分离得到一株针对粘质沙雷氏菌的烈性噬菌体SHENZHEN01,该噬菌体噬斑直径1 mm左右(培养10 h),边界清楚;对粘质沙雷氏菌Sm01、Baz01具有明显的裂解能力,对其他粘质沙雷氏菌菌株、大肠杆菌、金黄色葡萄球菌、绿脓杆菌无裂解作用;对饲喂埃及伊蚊的粘质沙雷氏菌Sm01仍保持明显的裂解能力。结论该噬菌体裂解作用具有特异性,而且在蚊虫肠道内仍能保持活性,具有可以用来治疗粘质沙雷氏菌引起的相关疾病的潜在价值。
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关键词
粘质沙雷氏菌
噬菌体
裂解
埃及伊蚊
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职称材料
题名
深圳市输入性寨卡病毒分离株的进化分析及生物学特性研究
1
作者
阳帆
黄亚兰
黄穗滨
熊玲红
张晓敏
李玥
张仁利
机构
深圳市疾病预防控制中心病原生物研究所
出处
《中国人兽共患病学报》
CAS
CSCD
北大核心
2021年第11期977-984,共8页
基金
国家自然科学基金青年基金(No.81802018)
深圳市科技计划项目(No.JCYJ20190807103005636)联合资助。
文摘
目的对从深圳宝安国际机场口岸入境的1例自柬埔寨归国发热人员进行寨卡病毒实验室检测,研究寨卡病毒分离株的遗传进化和生物学特征,为寨卡病毒病的预防控制提供参考依据。方法采集患者血液、唾液和尿液样本,采用荧光RT-PCR方法进行寨卡病毒核酸检测;选用多种组织培养细胞分离病毒,分别观察病毒株的致病变效应、空斑形成及病毒滴度等,并对两株病毒基因序列进行分子遗传进化研究,分析输入性病例来源。结果荧光RT-PCR结果显示,该病例血清、唾液以及尿液样本寨卡病毒核酸阳性并持续一段时间。首次成功从唾液和尿液标本中分离到寨卡病毒株,将其分别命名为ZIKV/S/SZ1901和ZIKV/U/SZ1901。两分离株均可引起Vero细胞病变,不引起BHK-21细胞病变;均可在Vero细胞中形成空斑,滴度分别为3.4×10^(5) pfu/mL、1.4×103 pfu/mL。RT-PCR扩增出预期大小约10272 bp片段,测序结果表明该片段与ZIKV/Hu/Thai/KngSG/17-D501株相应序列的同源性为99.6%。系统进化树显示该病毒属亚洲谱系,与输入至我国的其它寨卡病毒株位于不同的进化分支。寨卡病毒编码区氨基酸位点分析提示,SZ1901毒株在结构基因的氨基酸位点(D683E、V763M、T777M)和非结构基因NS1基因的(A188V)变异与近几年流行株完全相同。结论根据患者流行病学史、临床表现和实验室检测结果,确诊该病例为深圳市从柬埔寨输入性寨卡病毒感染病例,且寨卡病毒分离株具备与2016年以来流行的寨卡病毒大部分相同的分子基础。
关键词
寨卡病毒
输入性病例
荧光RT-PCR
进化分析
生物学特性
Keywords
Zika virus
imported case
real-time fluorescent RT-PCR
genetic evolution
biological characteristics
分类号
R373 [医药卫生—病原生物学]
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职称材料
题名
深圳急性肠胃炎住院患儿中人副肠孤病毒临床和流行病学特征分析
被引量：
10
2
作者
祝亚楠
张海龙
陈龙
姚相杰
杨洪
韩敏
关心
何雅青
胡贵方
机构
南方医科大学公共卫生学院流行病学系
深圳市疾病预防控制中心病原生物研究所
出处
《实用医学杂志》
CAS
北大核心
2020年第3期400-405,共6页
基金
广东省省级科技计划项目(编号：2014B020212007)
文摘
目的研究深圳地区急性肠胃炎住院患儿中人副肠孤病毒(HPeV)的临床和流行病学特征。方法收集2017年1月到2018年12月深圳地区5岁以下急性肠胃炎住院患儿粪便标本(常规细菌鉴定为阴性)497份,实时荧光RT⁃PCR方法检测HPeV,通过巢式PCR扩增VP3/VP1连接区片段进行分型,同时对患儿的流行病学和临床资料进行统计分析。结果497例患儿中,HPeV的阳性率为8.2%;男性HPeV阳性率为7.6%,女性HPeV阳性率为9.4%(χ2=0.491,P=0.501);0~6月龄患儿HPeV阳性率最高,且92.7%的HPeV阳性患儿月龄<24个月;深圳夏季(7~9月)HPeV的阳性率最高。HPeV阳性患儿主要临床表现为中热(38.1~39℃),腹泻频率平均>6次/d,以黏液便为主,常伴有呕吐,呕吐频率平均每天5次,呕吐物以胃内容物为主。HPeV阳性患儿较阴性患儿在有无呕吐和呕吐物性状差异具有统计学意义。本研究中共检测到HPeV⁃1(HPeV⁃1A和HPeV⁃1B亚型)、3、4、5、6和14在内的6种基因型,其中HPeV⁃1B(56.1%)为优势流行株,其次是HPeV⁃1A(17.1%)、HPeV⁃3(7.3%)、HPeV⁃4(7.3%)、HPeV⁃5(4.9%)、HPeV⁃6(4.9%)和HPeV⁃14(2.4%)。系统进化分析结果显示,大部分深圳分离株与兰州和广州来源的参考株核苷酸序列一致性高。结论本研究首次在深圳地区5岁以下急性肠胃炎住院患儿粪便中检测到HPeV,且在2017年和2018年有稳定的感染率,检测到6种HPeV基因型别可能与急性肠胃炎相关,HPeV夏季检出率最高,好发于0~6个月患儿,可能是引起急性肠胃炎住院患儿呕吐胃内容物的病因。开展HPeV监测以更充分地掌握其在深圳地区的流行和临床特征,有助于进一步明确深圳地区住院患儿病毒性急性肠胃炎病原谱构成。
关键词
人副肠孤病毒
急性肠胃炎
儿童
基因分型
系统进化分析
Keywords
human parechovirus
acute gastroenteritis
children
genotype
phylogenetic analysis
分类号
R183.4 [医药卫生—流行病学]
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职称材料
题名
1株粘质沙雷氏菌噬菌体的分离和鉴定
被引量：
1
3
作者
肖小平
陈依玲
张仁利
机构
深圳市疾病预防控制中心病原生物研究所
出处
《中国人兽共患病学报》
CAS
CSCD
北大核心
2021年第4期373-377,共5页
基金
国家自然科学基金(No.31700148)
深圳“三名”病媒传染病防治研究项目(No.SZSM201611064)联合资助。
文摘
目的以粘质沙雷氏菌为宿主菌,从河水中分离噬菌体,在体外和蚊虫肠道验证其裂解能力。方法以粘质沙雷氏菌为宿主菌,在深圳周边河水中分离噬菌体,通过单、双层平板筛选单一的烈性噬菌体;利用噬斑形成实验验证噬菌体的裂解谱;通过饲喂实验验证噬菌体在埃及伊蚊肠道内的裂解作用。结果从深圳河流污水中成功分离得到一株针对粘质沙雷氏菌的烈性噬菌体SHENZHEN01,该噬菌体噬斑直径1 mm左右(培养10 h),边界清楚;对粘质沙雷氏菌Sm01、Baz01具有明显的裂解能力,对其他粘质沙雷氏菌菌株、大肠杆菌、金黄色葡萄球菌、绿脓杆菌无裂解作用;对饲喂埃及伊蚊的粘质沙雷氏菌Sm01仍保持明显的裂解能力。结论该噬菌体裂解作用具有特异性,而且在蚊虫肠道内仍能保持活性,具有可以用来治疗粘质沙雷氏菌引起的相关疾病的潜在价值。
关键词
粘质沙雷氏菌
噬菌体
裂解
埃及伊蚊
Keywords
Serratia marcescens
phage
lysate
Aedes aegypti
分类号
R378.99 [医药卫生—病原生物学]
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职称材料
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
深圳市输入性寨卡病毒分离株的进化分析及生物学特性研究
阳帆
黄亚兰
黄穗滨
熊玲红
张晓敏
李玥
张仁利
《中国人兽共患病学报》
CAS
CSCD
北大核心
2021
0
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职称材料
2
深圳急性肠胃炎住院患儿中人副肠孤病毒临床和流行病学特征分析
祝亚楠
张海龙
陈龙
姚相杰
杨洪
韩敏
关心
何雅青
胡贵方
《实用医学杂志》
CAS
北大核心
2020
10
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职称材料
3
1株粘质沙雷氏菌噬菌体的分离和鉴定
肖小平
陈依玲
张仁利
《中国人兽共患病学报》
CAS
CSCD
北大核心
2021
1
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