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莱茵衣藻硫胁迫相关microRNA检测及其靶基因分析
被引量：
3
1
作者
胡章立
舒龙飞
苟德明
《深圳大学学报（理工版）》
EI
CAS
北大核心
2011年第3期237-242,共6页
采用特异反转录引物,构建莱茵衣藻microRNA(miRNA)的cDNA文库.选用U4核仁小分子RNA(small nucleolar RNA,snoRNA)作为内参,用SYBR green RT-PCR对3种与莱茵衣藻缺硫胁迫反应相关的miRNA进行检测,利用在线平台软件Web MicroRNAs Designer...
采用特异反转录引物,构建莱茵衣藻microRNA(miRNA)的cDNA文库.选用U4核仁小分子RNA(small nucleolar RNA,snoRNA)作为内参,用SYBR green RT-PCR对3种与莱茵衣藻缺硫胁迫反应相关的miRNA进行检测,利用在线平台软件Web MicroRNAs Designer(WMD3)对miRNA靶基因进行预测.结果表明,在缺硫胁迫下,3种miRNA(miRNA1145.2、miRNA1146和miRNA1158)的表达水平均明显上调,与正常培养的莱茵衣藻表达miRNA的相对丰度比值分别为3.11、2.38和3.67.靶基因预测分析表明,miRNA1145.2能影响脂肪酸氧化反应,miRNA1146与辅酶Q代谢相关,miRNA1158可能参与磷酸戊糖途径调控.
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关键词
生物工程
分子生物学
莱茵衣藻
缺硫胁迫
小分子核糖核酸
实时定量反转录聚合酶链式反应
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职称材料
题名
莱茵衣藻硫胁迫相关microRNA检测及其靶基因分析
被引量：
3
1
作者
胡章立
舒龙飞
苟德明
机构
深圳市海洋生物资源与生态环境重点实验室深圳大学生命科学学院
出处
《深圳大学学报（理工版）》
EI
CAS
北大核心
2011年第3期237-242,共6页
基金
国家自然科学基金资助项目(31070323)~~
文摘
采用特异反转录引物,构建莱茵衣藻microRNA(miRNA)的cDNA文库.选用U4核仁小分子RNA(small nucleolar RNA,snoRNA)作为内参,用SYBR green RT-PCR对3种与莱茵衣藻缺硫胁迫反应相关的miRNA进行检测,利用在线平台软件Web MicroRNAs Designer(WMD3)对miRNA靶基因进行预测.结果表明,在缺硫胁迫下,3种miRNA(miRNA1145.2、miRNA1146和miRNA1158)的表达水平均明显上调,与正常培养的莱茵衣藻表达miRNA的相对丰度比值分别为3.11、2.38和3.67.靶基因预测分析表明,miRNA1145.2能影响脂肪酸氧化反应,miRNA1146与辅酶Q代谢相关,miRNA1158可能参与磷酸戊糖途径调控.
关键词
生物工程
分子生物学
莱茵衣藻
缺硫胁迫
小分子核糖核酸
实时定量反转录聚合酶链式反应
Keywords
bioengineering
molecular biology
Chlamydomonas reinhardtii
sulfur deprivation
micro ribonucleic acid（microRNA）
real-time RT-PCR
分类号
Q74 [生物学—分子生物学]
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作者
出处
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被引量
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1
莱茵衣藻硫胁迫相关microRNA检测及其靶基因分析
胡章立
舒龙飞
苟德明
《深圳大学学报（理工版）》
EI
CAS
北大核心
2011
3
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