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题名管叶槽舌兰新鲜及硅胶干燥根样内生菌多样性研究
被引量：1
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作者
张镇梁
王美娜
李健
李素珍
段晓娟
乔琦
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机构
河南科技大学农学院/牡丹学院
深圳市兰科植物保护研究中心/全国兰科植物种质资源保护中心
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出处
《广西植物》
CAS
CSCD
北大核心
2023年第6期991-1005,共15页
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基金
国家自然科学基金(32001245)
深圳市可持续发展专项(KCXFZ20211020164200001)
深圳市科技计划项目(JCYJ20210324123013037)。
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文摘
管叶槽舌兰(Holcoglossum kimballianum)是一种珍稀濒危兰科植物,其野生种群亟需保护。内生菌对兰科植物的生长发育至关重要,为评估管叶槽舌兰内生菌的多样性、分析采样方式对其内生菌的影响,该文采用高通量测序技术对迁地保育状态下新鲜与硅胶干燥的管叶槽舌兰根内生菌进行研究。结果表明:(1)新鲜及干燥管叶槽舌兰根内生菌物种组成明显不同,管叶槽舌兰内生真菌注释到6门46科51属,内生细菌注释到15门105科178属;干燥后管叶槽舌兰根内生真菌注释到6门88科116属,内生细菌注释到21门154科336属。(2)迁地保育状态的管叶槽舌兰根样内生菌具有丰富的多样性,并且内生细菌群落丰富度和多样性远比内生真菌群落高;经硅胶干燥后,内生真菌α多样性指数升高、β多样性指数降低,而内生细菌的α多样性指数降低、β多样性指数则升高。(3)差异显著性真菌黄盖小脆柄菇(Psathyrella candolleana)和刺盘孢属(Colletotrichum)的C.tofieldiae只存在于新鲜根样中,新鲜管叶槽舌兰差异显著性细菌是马赛菌属(Massilia),干燥根样中差异显著性细菌类群包括拜叶林克氏菌科(Beijerinckiaceae)、黄色杆菌科(Xanthobacteraceae)及慢生根瘤菌属(Bradyrhizobium)。(4)共发生网络分析显示,经干燥后管叶槽舌兰根样内生菌群落中占互作主导地位的优势物种和互作模式都发生了改变。综上认为,不同采样处理会影响管叶槽舌兰根内生菌的群落结构,在研究兰科植物根样内生菌时宜使用新鲜的根样。该研究结果为管叶槽舌兰野生种群保护及人工栽培提供了内生菌数据基础,也为兰科植物内生微生物采样方法提供了参考。
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关键词
管叶槽舌兰
内生真菌
内生细菌
新鲜
硅胶干燥
多样性
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Keywords
Holcoglossum kimballianum
endophytic fungi
endophytic bacteria
fresh
silica gel-dried
diversity
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分类号
Q93-33
[生物学—微生物学]
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题名基于简化基因组测序揭示水角的濒危机制
被引量：2
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作者
吴欣仪
王蒙
郑希龙
张锐
何松
严岳鸿
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机构
深圳市兰科植物保护研究中心/全国兰科植物种质资源保护中心
广东药科大学中药资源学院
中国科学院上海辰山植物科学研究中心
海口市湿地保护管理中心
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出处
《广西植物》
CAS
CSCD
北大核心
2023年第8期1414-1427,共14页
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基金
海口市林业局项目(HNJC2019-0801)
中国科学院战略性先导科技专项(A类)(XDA19050404)。
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文摘
物种的遗传多样性是决定物种适应性和生存能力的关键因素。生境片段化是造成生物多样性丧失的重要因素之一,对植物种群的遗传多样性有着重要影响。水角(Hydrocera triflora)作为一种濒危植物,其遗传多样性状况和濒危机制尚未有报道。该文收集了水角7个种群共计34个样本,利用简化基因组测序技术(RAD-seq)获得了单核苷酸变异位点(SNP)。通过种群遗传多样性和遗传结构的分析,并结合种群历史动态分析和不同气候情景下物种潜在分布区预测,探讨了水角的濒危机制。结果表明:(1)水角遗传多样性较低(H_(o)=0.1569、H_(e)=0.1654、π=0.1865),遗传分化系数较高;AMOVA分析表明,遗传变异主要发生在种群内。(2)Mantel检测表明环境距离与遗传距离、地理距离均呈显著正相关,分别为P=0.0412和P=0.0082。(3)水角的有效种群大小从全新世中期开始持续下降,与琼北火山群的喷发时间一致。(4)与当代气候相比,虽然在未来气候变化下水角的潜在分布区总面积变动不大,但在高CO 2排放的情景下,大量的高适生区将会丧失并转化为低适生区,特别是位于马来群岛的适生区几乎完全消失。该研究结果表明,生境片段化导致了水角较低的遗传多样性和有效种群大小的持续下降。因此,自身更新能力低以及人为活动干扰、城市化等不利的环境条件是导致其濒危的主要原因。建议加强对水角的就地保护,采用人工授粉等方法提高其基因流以增加其种群的遗传多样性,同时,要着重保护湿地免遭破坏。
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关键词
生境片段化
简化基因组测序
遗传多样性
遗传结构
物种分布模型
种群历史动态
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Keywords
habitat fragmentation
Restriction-site Associated DNA sequencing(RAD-seq)
genetic diversity
genetic structure
species distribution models
demographic history
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分类号
Q943
[生物学—植物学]
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