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基于网络药理学和分子对接方法探讨健脾利湿养肝方治疗慢加急性肝衰竭的作用机制
被引量:
2
1
作者
黄琦
李静
+6 位作者
马文峰
韩志毅
孙嘉玲
张卫
孙新锋
陈剑平
周小舟
《中国药理学通报》
CAS
CSCD
北大核心
2024年第3期557-564,共8页
目的运用网络药理学和分子对接探究养肝方治疗慢加急性肝衰竭(acute-on-chronic liver failure,ACLF)的作用机制。方法依托TCMSP及GeneCards等多种数据库,获得健脾利湿养肝方治疗ACLF疾病的相关靶点。应用String及Cytoscape构建作用靶点...
目的运用网络药理学和分子对接探究养肝方治疗慢加急性肝衰竭(acute-on-chronic liver failure,ACLF)的作用机制。方法依托TCMSP及GeneCards等多种数据库,获得健脾利湿养肝方治疗ACLF疾病的相关靶点。应用String及Cytoscape构建作用靶点的PPI网络,筛选出核心作用靶点并采用DAVID进行GO功能注释和KEGG通路富集分析。对健脾利湿养肝方重复出现的活性成分以生物利用度OB值≥30%,类药性DL≥0.18为筛选条件,分选出中药复方健脾利湿养肝方的主要活性成分,并对该主要活性成分与核心作用靶点亲和力进行分子对接及动物体内实验验证。结果共获得健脾利湿养肝方治疗ACLF的活性成分536个,交集靶点基因244个,并筛选出核心靶点基因7个。分子对接显示核心靶基因AKT1、SRC、VEGFA、STAT3、EGFR、MAPK3、HRAS与健脾利湿养肝方中的主要活性成分槲皮素亲和力较好,具有很强的结合活性。另外,体内实验验证健脾利湿养肝方能够降低HRAS、EGFR、STAT3、SRC、VEGFA的表达,以延缓ACLF疾病进展。结论健脾利湿养肝方可能作用于HRAS、EGFR、STAT3、SRC、VEGFA等核心靶点,以达到治疗ACLF的作用。
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关键词
健脾利湿养肝方
慢加急性肝衰竭
网络药理学
分子对接
信号通路
槲皮素
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职称材料
基于网络药理学和分子对接探讨芪术抗癌方治疗原发性肝癌的分子机制
2
作者
马梦情
孙嘉玲
+7 位作者
胡锐
冯文杏
韩志毅
孙新锋
马文峰
张卫
陈剑平
周小舟
《中国药理学通报》
CAS
CSCD
北大核心
2023年第12期2369-2377,共9页
目的运用网络药理学和分子对接探究芪术抗癌方(Qizhu anti-cancer prescription,QZACP)治疗原发性肝癌的作用机制。方法根据TCMSP数据库及GeneCard等疾病数据库寻找药物及原发性肝癌(primary liver cancer,PLC)相关靶点,应用Cytoscape 3...
目的运用网络药理学和分子对接探究芪术抗癌方(Qizhu anti-cancer prescription,QZACP)治疗原发性肝癌的作用机制。方法根据TCMSP数据库及GeneCard等疾病数据库寻找药物及原发性肝癌(primary liver cancer,PLC)相关靶点,应用Cytoscape 3.9.1和String平台分别进行关键化合物和靶点的筛选,并构建中药-关键成分-靶点网络关系图;并通过DAVID平台进行GO功能富集分析和KEGG通路富集分析,依托于R 4.1.1软件进行可视化,最后通过CytoNCA插件对核心聚类蛋白进行分析得到核心作用靶点,使用分子对接技术预测活性成分与核心靶点匹配程度以及动物实验进一步探索QZACP的药效机制。结果QZACP治疗PLC的活性成分有可能是槲皮素、甘草酸苷、白玉兰素B等;潜在靶标为STAT3、EGFR、AKT1等;相关的通路主要有PI3K-Akt信号通路、MAPK信号通路等;分子对接结果显示,关键化学成分与核心靶点都具有良好的结合构象,另外,通过体内实验验证了QZACP能够抑制裸鼠肿瘤的生长,并降低STAT3、EGFR、AKT1等蛋白表达量。结论QZACP可能对PLC治疗存在一定的积极意义,可能与调控PI3K/Akt信号通路有关。
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关键词
芪术抗癌方
原发性肝癌
网络药理学
分子对接
信号通路
机制
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职称材料
题名
基于网络药理学和分子对接方法探讨健脾利湿养肝方治疗慢加急性肝衰竭的作用机制
被引量:
2
1
作者
黄琦
李静
马文峰
韩志毅
孙嘉玲
张卫
孙新锋
陈剑平
周小舟
机构
广州
中医
药大学第四
临床
医学院
深圳市
中医院
国家
临床
肝病
(
中医
)
重点
专科
澳门科技大学
中医
药学院
深圳市
中医院
中药制剂研究
重点
实验室
出处
《中国药理学通报》
CAS
CSCD
北大核心
2024年第3期557-564,共8页
基金
国家自然科学基金资助项目(No82205209)
深圳市科研计划项目(NoJCYJ20210324120405015,JCYJ20180302173542393)。
文摘
目的运用网络药理学和分子对接探究养肝方治疗慢加急性肝衰竭(acute-on-chronic liver failure,ACLF)的作用机制。方法依托TCMSP及GeneCards等多种数据库,获得健脾利湿养肝方治疗ACLF疾病的相关靶点。应用String及Cytoscape构建作用靶点的PPI网络,筛选出核心作用靶点并采用DAVID进行GO功能注释和KEGG通路富集分析。对健脾利湿养肝方重复出现的活性成分以生物利用度OB值≥30%,类药性DL≥0.18为筛选条件,分选出中药复方健脾利湿养肝方的主要活性成分,并对该主要活性成分与核心作用靶点亲和力进行分子对接及动物体内实验验证。结果共获得健脾利湿养肝方治疗ACLF的活性成分536个,交集靶点基因244个,并筛选出核心靶点基因7个。分子对接显示核心靶基因AKT1、SRC、VEGFA、STAT3、EGFR、MAPK3、HRAS与健脾利湿养肝方中的主要活性成分槲皮素亲和力较好,具有很强的结合活性。另外,体内实验验证健脾利湿养肝方能够降低HRAS、EGFR、STAT3、SRC、VEGFA的表达,以延缓ACLF疾病进展。结论健脾利湿养肝方可能作用于HRAS、EGFR、STAT3、SRC、VEGFA等核心靶点,以达到治疗ACLF的作用。
关键词
健脾利湿养肝方
慢加急性肝衰竭
网络药理学
分子对接
信号通路
槲皮素
Keywords
spleen-strengthening and moisture-nourishing liver prescription
acute-on-chronic liver failure
network pharmacology
molecular docking
signaling pathway
quercetin
分类号
R-332 [医药卫生]
R242 [医药卫生—中医临床基础]
R289.5 [医药卫生—方剂学]
R319 [医药卫生—基础医学]
R575.3 [医药卫生—消化系统]
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职称材料
题名
基于网络药理学和分子对接探讨芪术抗癌方治疗原发性肝癌的分子机制
2
作者
马梦情
孙嘉玲
胡锐
冯文杏
韩志毅
孙新锋
马文峰
张卫
陈剑平
周小舟
机构
广州
中医
药大学第四
临床
医学院
深圳市
中医院
国家
临床
肝病
(
中医
)
重点
专科
澳门科技大学
中医
药学院
深圳市
中医院
中药制剂研究
重点
实验室
出处
《中国药理学通报》
CAS
CSCD
北大核心
2023年第12期2369-2377,共9页
基金
国家自然科学基金资助项目(No 82205209)
深圳市科技计划项目(No JCYJ20210324120405015)
广东省中医药局项目(No 20202152)。
文摘
目的运用网络药理学和分子对接探究芪术抗癌方(Qizhu anti-cancer prescription,QZACP)治疗原发性肝癌的作用机制。方法根据TCMSP数据库及GeneCard等疾病数据库寻找药物及原发性肝癌(primary liver cancer,PLC)相关靶点,应用Cytoscape 3.9.1和String平台分别进行关键化合物和靶点的筛选,并构建中药-关键成分-靶点网络关系图;并通过DAVID平台进行GO功能富集分析和KEGG通路富集分析,依托于R 4.1.1软件进行可视化,最后通过CytoNCA插件对核心聚类蛋白进行分析得到核心作用靶点,使用分子对接技术预测活性成分与核心靶点匹配程度以及动物实验进一步探索QZACP的药效机制。结果QZACP治疗PLC的活性成分有可能是槲皮素、甘草酸苷、白玉兰素B等;潜在靶标为STAT3、EGFR、AKT1等;相关的通路主要有PI3K-Akt信号通路、MAPK信号通路等;分子对接结果显示,关键化学成分与核心靶点都具有良好的结合构象,另外,通过体内实验验证了QZACP能够抑制裸鼠肿瘤的生长,并降低STAT3、EGFR、AKT1等蛋白表达量。结论QZACP可能对PLC治疗存在一定的积极意义,可能与调控PI3K/Akt信号通路有关。
关键词
芪术抗癌方
原发性肝癌
网络药理学
分子对接
信号通路
机制
Keywords
Qizhu anti-cancer prescription
primary liver cancer
network pharmacology
molecular docking
signaling pathway
mechanism
分类号
R-332 [医药卫生]
R289.5 [医药卫生—方剂学]
R319 [医药卫生—基础医学]
R735.7 [医药卫生—肿瘤]
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职称材料
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
基于网络药理学和分子对接方法探讨健脾利湿养肝方治疗慢加急性肝衰竭的作用机制
黄琦
李静
马文峰
韩志毅
孙嘉玲
张卫
孙新锋
陈剑平
周小舟
《中国药理学通报》
CAS
CSCD
北大核心
2024
2
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职称材料
2
基于网络药理学和分子对接探讨芪术抗癌方治疗原发性肝癌的分子机制
马梦情
孙嘉玲
胡锐
冯文杏
韩志毅
孙新锋
马文峰
张卫
陈剑平
周小舟
《中国药理学通报》
CAS
CSCD
北大核心
2023
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