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大豆UV-B光受体GmUVR8基因的生物信息学分析
被引量：
3
1
作者
罗秋兰
王潮岗
胡章立
《大豆科学》
CAS
CSCD
北大核心
2018年第2期192-196,共5页
UV-B影响大豆的生长发育,降低大豆的产量,但能够促进大豆类黄酮化合物合成,提高植物对病虫害的抵抗力。本研究利用生物信息学方法系统分析了大豆UV-B光受体UVR8基因及其编码蛋白质的特性。结果显示,大豆中存在4个GmUVR8蛋白质,均为亲水...
UV-B影响大豆的生长发育,降低大豆的产量,但能够促进大豆类黄酮化合物合成,提高植物对病虫害的抵抗力。本研究利用生物信息学方法系统分析了大豆UV-B光受体UVR8基因及其编码蛋白质的特性。结果显示,大豆中存在4个GmUVR8蛋白质,均为亲水性蛋白质,位于细胞核中,尽管它们在大小上存在差异,但是都包含多个保守的RCC1结构域,形成了完整或不完整的七叶β-折叠的结构,与拟南芥的折叠方式极为相似。大豆基因组中这4个GmUVR8编码基因长度不一,分别位于4条染色体上,含有相同的外显子数,具有相同的编码方式。同源序列比对显示GmUVR8c与拟南芥最为相似,而聚类分析显示GmUVR8具有一定特异性。本研究为后期系统分析大豆UV-B光形态建成分子机制和GmUVR8基因功能提供了理论依据。
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关键词
大豆
紫外光B
UVR8光受体
结构域
进化树分析
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职称材料
题名
大豆UV-B光受体GmUVR8基因的生物信息学分析
被引量：
3
1
作者
罗秋兰
王潮岗
胡章立
机构
深圳大学
生命与
海洋
科学学院
/深圳市
海洋
生物
资源与生态环境重点实验室
深圳大学
光电
工程
学院/光电子器件与系统(教育部/广东省)重点实验室
深圳大学龙华生物产业创新研究院/深圳市海洋藻类生物工程技术研究中心
出处
《大豆科学》
CAS
CSCD
北大核心
2018年第2期192-196,共5页
基金
国家自然科学基金(31700309
31470389
+2 种基金
31470431)
广东省自然科学基金(2014A030308017
2017A030310255)
文摘
UV-B影响大豆的生长发育,降低大豆的产量,但能够促进大豆类黄酮化合物合成,提高植物对病虫害的抵抗力。本研究利用生物信息学方法系统分析了大豆UV-B光受体UVR8基因及其编码蛋白质的特性。结果显示,大豆中存在4个GmUVR8蛋白质,均为亲水性蛋白质,位于细胞核中,尽管它们在大小上存在差异,但是都包含多个保守的RCC1结构域,形成了完整或不完整的七叶β-折叠的结构,与拟南芥的折叠方式极为相似。大豆基因组中这4个GmUVR8编码基因长度不一,分别位于4条染色体上,含有相同的外显子数,具有相同的编码方式。同源序列比对显示GmUVR8c与拟南芥最为相似,而聚类分析显示GmUVR8具有一定特异性。本研究为后期系统分析大豆UV-B光形态建成分子机制和GmUVR8基因功能提供了理论依据。
关键词
大豆
紫外光B
UVR8光受体
结构域
进化树分析
Keywords
Soybean
Uhraviolet-B
UVR8 photoreceptor
Domains
Phylogenetic tree analysis
分类号
S565.1 [农业科学—作物学]
Q751 [生物学—分子生物学]
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作者
出处
发文年
被引量
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1
大豆UV-B光受体GmUVR8基因的生物信息学分析
罗秋兰
王潮岗
胡章立
《大豆科学》
CAS
CSCD
北大核心
2018
3
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