线粒体动力学失衡和环境神经毒物对阿尔茨海默病病理进程影响的研究进展 被引量：15

1

作者 赵若聪 刘琼 何晓阳 《中国药理学与毒理学杂志》 CAS CSCD 北大核心 2013年第1期101-105,共5页

线粒体动力学指细胞中的线粒体不断进行分裂融合的一种动态变化,是维持胞内物质与能量运输的重要保障,发动蛋白相关GTP酶1、Fis1、线粒体分裂因子、线粒体融合蛋白1/2和视神经萎缩蛋白1等蛋白为这一过程的直接参与者,它们受到磷酸化、S... 线粒体动力学指细胞中的线粒体不断进行分裂融合的一种动态变化,是维持胞内物质与能量运输的重要保障,发动蛋白相关GTP酶1、Fis1、线粒体分裂因子、线粒体融合蛋白1/2和视神经萎缩蛋白1等蛋白为这一过程的直接参与者,它们受到磷酸化、S-亚硝基化、泛素化、小泛素化和蛋白酶解等信号的精密调控。神经细胞的突触形态与功能维持极度依赖线粒体正常分布与功能,而体内外神经毒性物质可能通过干扰线粒体动力学平衡引发神经元能量代谢障碍,活性氧释放增多,并可加速细胞凋亡。越来越多研究表明,线粒体动力学失衡是阿尔兹海默综合征早期病理进程中的关键事件之一。 展开更多

关键词 线粒体动力学 阿尔茨海默病 环境神经毒物

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多肽组学技术在体液生物标志物中的研究进展 被引量：1

2

作者 郑琬琳 万磊磊 +2 位作者 李水明 洪晓榆 王勇 《质谱学报》 EI CAS CSCD 北大核心 2021年第5期926-941,I0010,共17页

多肽组学是蛋白质组学技术的延伸,理论上是指器官、组织、细胞和体液中分子质量小于10 ku的全部内源性多肽。体液多肽组包含了丰富的人体病理和生理信息,自2000年提出生物标记物研究以来,引起了研究者的广泛关注。本文对多肽组学的研究... 多肽组学是蛋白质组学技术的延伸,理论上是指器官、组织、细胞和体液中分子质量小于10 ku的全部内源性多肽。体液多肽组包含了丰富的人体病理和生理信息,自2000年提出生物标记物研究以来,引起了研究者的广泛关注。本文对多肽组学的研究方法和3种体液多肽组生物标志物的发展和应用进行总结,提出多肽组的宽泛性,探讨利用肽段分子质量作为标记物的缺点,指出在多肽组分析的各个步骤都可能引入一定的不确定性。 展开更多

关键词 质谱 体液 多肽组 生物标记物

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室内观赏鱼池自净化生态系统的构建

3

作者 宋芝蔓 林逸涛 +2 位作者 张翠桔 刘旭坤 汪安泰 《安徽农业科学》 CAS 2015年第5期117-121,共5页

[目的]构建室内观赏鱼池生态自净化系统。[方法]设计了水泵过滤池、入水池、生态净化池和观赏鱼池。结合使用常规水族生物材料,首次在生态净化池投放了单肠目、大口虫目、三肠目涡虫、水螅和浮游动物等。对常见5种水生观赏植物以及硝化... [目的]构建室内观赏鱼池生态自净化系统。[方法]设计了水泵过滤池、入水池、生态净化池和观赏鱼池。结合使用常规水族生物材料,首次在生态净化池投放了单肠目、大口虫目、三肠目涡虫、水螅和浮游动物等。对常见5种水生观赏植物以及硝化细菌的水净化功能进行检测。[结果]实现了鱼池环境物种的多样性,形成了完整的食物链体系,使观赏鱼池获得稳定的水生态平衡环境,构建了具有自净化功能的水生态调控系统。不同的水生观赏植物对水体的净化功能有显著差异。[结论]构建的室内观赏鱼池自净化生态系统方法简便、效果极为显著,可节约人工及水资源均达90%以上,具有应用与推广价值。 展开更多

关键词 室内 鱼池 观赏鱼 水生植物 底栖动物 生态学

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阿尔茨海默病的防治策略研究进展 被引量：47

4

作者 倪嘉缵 陈平 +5 位作者 刘琼 郑易之 何晓阳 宋国丽 应明 续旭 《深圳大学学报（理工版）》 EI CAS 北大核心 2013年第4期331-348,共18页

评述了阿尔茨海默病(Alzheimer's disease,AD)的多种病因学说,包括胆碱能学说、β-淀粉样级联学说、ABC学说(aging,beta-amyloid,channel)、tau蛋白过度磷酸化学说、氧化应激学说、神经细胞凋亡学说和基因突变学说等.指出AD是多因... 评述了阿尔茨海默病(Alzheimer's disease,AD)的多种病因学说,包括胆碱能学说、β-淀粉样级联学说、ABC学说(aging,beta-amyloid,channel)、tau蛋白过度磷酸化学说、氧化应激学说、神经细胞凋亡学说和基因突变学说等.指出AD是多因素引起的病变,其发病机制也必然有多种.由于该病与人体衰老过程密切相关,发病机理复杂,且神经细胞丢失后不具再生能力,这就决定了研究治疗AD有效药物的艰巨性.还指出AD防治工作应重视早期预报和早期干预,发展早期诊断方法包括正电子发射计算机断层扫描、磁共振成像,及血液和尿液中寻找灵敏的生物标志物等技术方法.目前有关AD防治药物包括一线治疗药物、疫苗、尚在研究阶段的药物、辅助性治疗药物、中药以及医疗保健品.前3类药物因疗效或研究结果长期未取得突破性进展,人们开始关注后3类药物对延缓AD的作用及机理.课题组重点开展后3种药物防治AD的作用和机理研究,发现硒代蛋氨酸、辅酶Q-10和中药组分淫羊藿甙对防治AD有好的疗效.综述了目前抗AD药物的研究现状和面临的挑战,提出AD的防治策略是:摒弃针对单一致病因素的治疗思路,从多因素及内在相互联系的系统生物学角度,开展AD防治机制及新药研发. 展开更多

关键词 神经退行性疾病 阿尔茨海默病 病理学 医学成像 药物疗法 认知障碍 文献综述

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雨生红球藻抗氧化系统对活性氧的清除机制 被引量：9

5

作者 王潮岗 韩燊 +2 位作者 陈甄倩 罗尹清 胡章立 《水生生物学报》 CAS CSCD 北大核心 2012年第4期804-808,共5页

雨生红球藻（Haematococcus pluvialis）是一种淡水单细胞绿藻,隶属绿藻门、团藻目、红球藻科、红球藻属。它受强光、氮饥饿、高盐等胁迫时积累大量的虾青素,含量可高达细胞干重的6.0%以上[1]。相关研究也显示来虾青素具有极强的抗氧化... 雨生红球藻（Haematococcus pluvialis）是一种淡水单细胞绿藻,隶属绿藻门、团藻目、红球藻科、红球藻属。它受强光、氮饥饿、高盐等胁迫时积累大量的虾青素,含量可高达细胞干重的6.0%以上[1]。相关研究也显示来虾青素具有极强的抗氧化活性[2—4],它的抗氧化活性较α-生育酚强千倍[5],比维生素E高近百倍[6]。 展开更多

关键词 雨生红球藻 抗氧化系统 活性氧 虾青素 总抗氧化能力

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北部湾海域水质综合污染指数和浮游植物多样性指数评价 被引量：8

6

作者 姜发军 许铭本 +2 位作者 陈宪云 张荣灿 雷富 《广西科学》 CAS 2014年第4期376-380,共5页

【目的】探讨环境污染评价方法,以期反映广西北部湾海域污染水平的客观情况,推进海洋生态环境质量评价方法的进一步发展,为该海域的环境生态研究以及富营养化问题研究提供依据。【方法】利用水质综合污染指数和浮游植物多样性指数分别... 【目的】探讨环境污染评价方法,以期反映广西北部湾海域污染水平的客观情况,推进海洋生态环境质量评价方法的进一步发展,为该海域的环境生态研究以及富营养化问题研究提供依据。【方法】利用水质综合污染指数和浮游植物多样性指数分别对广西北部湾海域2010年6月和2010年9月调查的数据进行污染程度评价,并讨论利用多样性指数评价的合理性。【结果】广西北部湾海域污染等级处于轻中污染至无污染之间,其中利用水质化学因子进行综合评价的结果为轻污染,利用浮游植物多样性指数进行评价的结果为轻中污染至轻污染或无污染。【结论】水质化学评价与水质生物学评价在海域污染程度上存在一定的偏差。利用浮游植物多样性指数评价海域水质污染程度,其评价标准仍有待更多的调查来验证和修正。在实际评价中不能单从指数结果就轻易下定论,应结合理化监测结果,才能得到实际结论。 展开更多

关键词 水质综合污染指数 多样性指数 污染 浮游植物 北部湾

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利用基因工程技术提高微藻油脂含量的研究进展 被引量：6

7

作者 李逸 王潮岗 胡章立 《生物技术通报》 CAS CSCD 北大核心 2015年第3期70-81,共12页

利用微藻油脂制备生物柴油因具有重要的战略意义而受到世界各国的重视,成为近年来的研究热点。利用微藻制备生物柴油具有生长周期短、易于大规模培养、能大量吸收CO2及不占用耕地等优点。但是,由于对藻类油脂合成代谢中的调节机制了解不... 利用微藻油脂制备生物柴油因具有重要的战略意义而受到世界各国的重视,成为近年来的研究热点。利用微藻制备生物柴油具有生长周期短、易于大规模培养、能大量吸收CO2及不占用耕地等优点。但是,由于对藻类油脂合成代谢中的调节机制了解不多,导致微藻基因组研究相对滞后,极大地限制了微藻生物能源的大规模开发和利用。随着现代生物技术的发展,通过基因工程、代谢工程等方法调控微藻脂类的合成代谢,提高藻类含油量和生物量已成为可能。概述了微藻中油脂的合成代谢,归纳总结利用基因工程技术提高微藻油脂含量的研究进展,为获得含油量高的工程微藻及微藻制备生物柴油提供技术储备。 展开更多

关键词 微藻 基因工程 生物柴油 油脂

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蛋白质胰蛋白酶水解过程双位点漏切肽段的质谱鉴定 被引量：4

8

作者 王勇 李水明 +1 位作者 何曼文 邹永东 《质谱学报》 EI CAS CSCD 北大核心 2013年第1期29-34,共6页

为说明胰蛋白酶漏切位点数目设置对蛋白质搜库结果的影响,采用基质辅助激光解吸电离-串联飞行时间质谱(MALDI-TOF/TOF)高置信度地鉴定了细胞色素C和大豆脱落胁迫成熟蛋白。在细胞色素C和大豆脱落胁迫成熟蛋白的胰酶水解液中分别发现了2... 为说明胰蛋白酶漏切位点数目设置对蛋白质搜库结果的影响,采用基质辅助激光解吸电离-串联飞行时间质谱(MALDI-TOF/TOF)高置信度地鉴定了细胞色素C和大豆脱落胁迫成熟蛋白。在细胞色素C和大豆脱落胁迫成熟蛋白的胰酶水解液中分别发现了2个和4个双胰酶漏切位点肽段,确认了文献中报道的当赖氨酸和赖氨酸相邻或赖氨酸、精氨酸各自与天冬氨酸或者谷氨酸相邻时,会引起胰蛋白酶的漏切。此外,还发现组氨酸-赖氨酸-异亮氨酸/丙氨酸结构也有此现象。本研究中检测出漏切肽段并没有明显提高序列覆盖率,但显著增加了蛋白质鉴定结果的确定性。在实际样品分析中如将漏切数设置为1有可能产生肽段鉴定的假阴性。 展开更多

关键词 胰蛋白酶 基质辅助激光解吸电离-串联飞行时间质谱 细胞色素C 大豆脱落胁迫成熟蛋白

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SEC2在莱茵衣藻中的表达及免疫学活性分析 被引量：5

9

作者 李建成 彭世清 胡章立 《深圳大学学报（理工版）》 EI CAS 北大核心 2012年第2期159-164,共6页

通过将金黄色葡萄球菌(Staphylococcus aureus,S.aureus)肠毒素C2(staphylococcal entero-toxin C2,SEC2)基因进行定点突变,获得具有超抗原性的减毒C2基因序列sec2t,把该基因插入含Hsp 70A-RBCS2启动子和RBCS2终止子的pH124载体上,构建... 通过将金黄色葡萄球菌(Staphylococcus aureus,S.aureus)肠毒素C2(staphylococcal entero-toxin C2,SEC2)基因进行定点突变,获得具有超抗原性的减毒C2基因序列sec2t,把该基因插入含Hsp 70A-RBCS2启动子和RBCS2终止子的pH124载体上,构建莱茵衣藻表达载体pH124sec2t,采用'珠磨法'将该载体转入细胞壁缺陷型莱茵衣藻(Chlamydomonas reinhardtii)CC-849中,经含10μg/mL Zeomy-cin的抗性平板筛选、PCR及RT-PCR分析,获得转基因莱茵衣藻Tran-sec2t.Southern blot和Western blot分析表明,sec2t基因已整合入莱茵衣藻核基因组中,且能表达相对分子质量为26 kDa(1 Da=1 u)的目的蛋白.分别以CC-849和Tran-sec2t两种藻细胞培养液(每毫升106个细胞)喂食Balb/c小鼠,并用流式细胞仪检测分析小鼠CD3+、CD4+和CD8+细胞,结果发现,可表达减毒超抗原SEC2T的转基因莱茵衣藻Tran-sec2t能刺激小鼠T淋巴细胞的产生;与对照相比,CD4+与CD8+细胞数目比值有所降低,但CD3+和CD8+细胞有明显提高.研究结果有助于利用转基因藻生产抗肿瘤制剂和动物免疫增强剂. 展开更多

关键词 基因工程 金黄色葡萄球菌 肠毒素C2 莱茵衣藻 超抗原 转基因藻 抗肿瘤 定点突变

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基质辅助激光解吸电离-串联飞行时间质谱鉴定鲨鱼硒结合蛋白 被引量：2

10

作者 王勇 李水明 何曼文 《质谱学报》 EI CAS CSCD 北大核心 2013年第5期257-262,共6页

利用基质辅助激光解吸电离-串联飞行时间质谱(MALDI-TOF/TOF)高置信度地鉴定了原核表达的白鳍鲨硒结合蛋白。实验表明,硒结合蛋白肽段之一被错误指认为胰酶自水解峰和混合谱是影响其未进行串联质谱分析或不能被数据库搜索匹配的主要原因... 利用基质辅助激光解吸电离-串联飞行时间质谱(MALDI-TOF/TOF)高置信度地鉴定了原核表达的白鳍鲨硒结合蛋白。实验表明,硒结合蛋白肽段之一被错误指认为胰酶自水解峰和混合谱是影响其未进行串联质谱分析或不能被数据库搜索匹配的主要原因,同时还发现,虽然赖氨酸结尾肽段在MALDI源中信号强度普遍很低,但对它们进行串联质谱分析也可获得较好的谱图质量,部分数据可用于从头测序。考虑以上因素后,硒结合蛋白鉴定覆盖率由35%增至51%。 展开更多

关键词 硒结合蛋白 基质辅助激光解吸电离-串联飞行时间质谱(MALDI-TOF TOF) 蛋白质鉴定 数据库 搜索 手工解析

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一种莱茵衣藻启动子功能检测系统的构建 被引量：1

11

作者 王潮岗 黄惠珠 +2 位作者 孙海珊 胡章立 雷安平 《深圳大学学报（理工版）》 CAS 北大核心 2012年第6期534-540,共7页

选用莱茵衣藻(Chlamydomonas reinhardtii)作为检测微藻启动子功能的生物系统,以pSP124质粒为基础,雨生红球藻β-胡萝卜素酮化酶基因bkt1的启动子片段(450 base pair,记作450 bp)为间隔序列,引入两个Eam 1105Ⅰ限制性内切酶位点,构建莱... 选用莱茵衣藻(Chlamydomonas reinhardtii)作为检测微藻启动子功能的生物系统,以pSP124质粒为基础,雨生红球藻β-胡萝卜素酮化酶基因bkt1的启动子片段(450 base pair,记作450 bp)为间隔序列,引入两个Eam 1105Ⅰ限制性内切酶位点,构建莱茵衣藻启动子功能检测T载体.将聚合酶链式反应(polymerase chain reaction,PCR)获得的1 986 bp的bkt1启动子片段直接克隆到T载体上,通过"珠磨法"转化到莱茵衣藻CC-849中,经Zeomycin筛选获得了TranB-0.45和TranBle转基因藻,而1 986 bp的bkt1启动子无转化子,原因可能是其含有负调控元件.PCR结果显示,ble可稳定存在于转基因藻中,bkt1启动子的450bp片段具有启动子活性,能正确表达BLE蛋白.该研究表明,莱茵衣藻和pB-0.45T载体所组成的检测系统可用于藻类启动子研究,为启动子功能的研究提供了一条新途径. 展开更多

关键词 基因工程 T载体 莱茵衣藻 启动子功能 检测系统 珠磨法 克隆

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利用植物复合床技术处理工业污水 被引量：2

12

作者 朱倩倩 何先湧 +1 位作者 胡章立 徐宏 《环境化学》 CAS CSCD 北大核心 2012年第7期1069-1075,共7页

选取风车草、蝴蝶兰、吊兰、小纸莎、菖蒲、香根草6种植物作为人工湿地植物,砾石、活性炭、河沙、砾石+河沙、活性炭+河沙、活性炭+砾石共6种填料作为人工湿地填料,进行不同植物和不同填料组合处理某胶水厂洗釜过程产生的工业废水能力... 选取风车草、蝴蝶兰、吊兰、小纸莎、菖蒲、香根草6种植物作为人工湿地植物,砾石、活性炭、河沙、砾石+河沙、活性炭+河沙、活性炭+砾石共6种填料作为人工湿地填料,进行不同植物和不同填料组合处理某胶水厂洗釜过程产生的工业废水能力的实验研究.结果表明,在相同的进水水质和水力负荷条件下,从经济成本角度考虑,蝴蝶兰与活性炭+河沙组合较好,对CODCr、氨氮的去除率分别达到95%、99%,出水水质符合DB44/26—2001广东省地方标准水污染物排放限制标准一级标准.该技术处理效果好,操作简单,易维护,适合推广. 展开更多

关键词 物化法/植物复合床技术 植物 填料 去除率

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花生过敏原Ara h1的热变性及其与还原糖相互作用的研究 被引量：1

13

作者 徐宏 沈亮亮 +8 位作者 胡章立 肖杰 肖华新 吴锦霞 李逸 魏波 倪卓 吴序栎 刘志刚 《光谱学与光谱分析》 SCIE EI CAS CSCD 北大核心 2013年第8期2128-2131,共4页

运用圆二色光谱(CD)和荧光光谱以及ELISA方法对花生蛋白Ara h1的热变性及其与还原糖的相互作用,以及过敏原性的变化进行了系统研究。实验表明,温度高于85℃时,Ara h1蛋白的二级结构才发生显著变化,表现为α螺旋结构的相对含量减少,β折... 运用圆二色光谱(CD)和荧光光谱以及ELISA方法对花生蛋白Ara h1的热变性及其与还原糖的相互作用,以及过敏原性的变化进行了系统研究。实验表明,温度高于85℃时,Ara h1蛋白的二级结构才发生显著变化,表现为α螺旋结构的相对含量减少,β折叠及无规卷曲等结构的相对含量增加,其过敏原性也相应降低;木糖、果糖能与Ara h1蛋白进行相互作用进而有效稳定其蛋白结构,并显著降低其过敏原性。研究结果对食物过敏原致敏机理的深入研究,以及花生食品的合理加工具有重要的理论指导意义。 展开更多

关键词 ARA h1蛋白 圆二色光谱 荧光 ELISA

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水螅体表鳃隐鞭虫的安全清除方法 被引量：1

14

作者 孙婷 宁婉茹 +2 位作者 汪安泰 吴程琛 江淑祺 《四川动物》 CSCD 北大核心 2013年第5期751-754,F0003,共5页

鳃隐鞭虫Cryptobia branchialis常寄生在鱼鳃上,易导致鱼类窒息死亡。中性红是一种易氧化分解的常用活体生物染色剂。本研究以普通水螅Hydra vulgaris为材料,使用中性红溶液,探索有效清除水螅体表鳃隐鞭虫的安全浓度与使用方法。结果表... 鳃隐鞭虫Cryptobia branchialis常寄生在鱼鳃上,易导致鱼类窒息死亡。中性红是一种易氧化分解的常用活体生物染色剂。本研究以普通水螅Hydra vulgaris为材料,使用中性红溶液,探索有效清除水螅体表鳃隐鞭虫的安全浓度与使用方法。结果表明：中性红浓度20~30 mg·L-1（25℃±1℃）时10 min可有效清除鳃隐鞭虫,且不影响水螅的正常生长。中性红浓度为20~50 mg·L-1时,触手出现解体的对应时间为30-10 min。研究表明,中性红溶液浓度与处理时间科学组合,能达到安全高效杀灭水螅体表寄生原虫的目的。 展开更多

关键词 水螅 鳃隐鞭虫 中性红 安全浓度

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人唾液蛋白质组的纳升液相色谱-高分辨串联质谱鉴定及高丰度蛋白质分析 被引量：1

15

作者 石锴 孔祥怡 +4 位作者 杜建时 徐金玲 李水明 王勇 赵晴 《质谱学报》 EI CAS CSCD 北大核心 2016年第5期401-407,共7页

常规的定性分析质谱数据能否以及如何应用于蛋白质组学的相对定量分析是实际工作中经常遇到的问题。本研究采用一维纳升液相色谱-高分辨串联质谱(nano-HPLC-Triple TOF 5600)法鉴定人唾液蛋白质组,并分析其基本组成,以探讨质谱数据与唾... 常规的定性分析质谱数据能否以及如何应用于蛋白质组学的相对定量分析是实际工作中经常遇到的问题。本研究采用一维纳升液相色谱-高分辨串联质谱(nano-HPLC-Triple TOF 5600)法鉴定人唾液蛋白质组,并分析其基本组成,以探讨质谱数据与唾液中高丰度蛋白质的相关性。本实验共鉴定了6 044条特异性酶切肽段,归属于α-淀粉酶1、碳酸酐酶6、血清白蛋白、粘蛋白、半胱氨酸蛋白酶抑制剂和免疫球蛋白等各种已知的高丰度蛋白质在内的521个蛋白,这为一维纳升液相色谱分离条件下的唾液蛋白质组的基本组成分析提供了参考。结果表明,仅用蛋白质排序指标Unused值表征蛋白质的相对含量具有局限性,而蛋白质排序、检出肽段数目和肽段平均强度等综合指标与蛋白质相对含量具有正相关性,即排名较后的蛋白质均只有1条肽段被检出,且肽段强度较低。这说明,当蛋白质相对含量差别较大时,肽段的化学性质和电离效率差异对质谱信号的影响已不占主要地位,即可以认为当肽段检出数目、鉴定覆盖率和肽段强度均较低时,蛋白质的相对含量也较低。该结果可为利用Triple TOF 5600质谱仪的定性鉴定数据进行初步半定量判断提供参考,也可为唾液蛋白质组生物标志物研究提供借鉴。 展开更多

关键词 唾液 蛋白质组 纳升液相色谱 高分辨质谱 信号强度 高丰度蛋白质

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亚胺及其相关离子在区分赖氨酸和谷氨酰胺残基中的应用 被引量：1

16

作者 李水明 何曼文 王勇 《质谱学报》 EI CAS CSCD 北大核心 2014年第3期256-261,共6页

完全从头测序要求区分肽段中的同量异序氨基酸谷氨酰胺和赖氨酸,而这通常需要借助高分辨质谱。谷氨酰胺和赖氨酸都可以产生m/z 101亚胺离子和m/z 84亚胺相关离子,尽管已知赖氨酸亚胺离子m/z101有时强度较弱,以及m/z84离子可预示赖氨酸... 完全从头测序要求区分肽段中的同量异序氨基酸谷氨酰胺和赖氨酸,而这通常需要借助高分辨质谱。谷氨酰胺和赖氨酸都可以产生m/z 101亚胺离子和m/z 84亚胺相关离子,尽管已知赖氨酸亚胺离子m/z101有时强度较弱,以及m/z84离子可预示赖氨酸的存在,但该特征能否用于区分赖氨酸和谷氨酰胺仍存在争议。本工作以合成肽段和蛋白质胰酶水解肽段为研究体系,利用基质辅助激光解吸电离的高能碰撞诱导解离模式产生的亚胺及其相关离子的相对强度区分这两种氨基酸。结果表明:谷氨酰胺更易产生m/z101离子,而赖氨酸更易产生m/z84和m/z129离子。对于不同时含有赖氨酸和谷氨酰胺的肽段,使用m/z84离子与亚胺离子m/z101的相对强度比值,而非它们的绝对强度,以及m/z101离子的测量值,可以直接判断序列中存在的是赖氨酸还是谷氨酰胺。对于含有谷氨酰胺,并以赖氨酸结尾或含有漏切赖氨酸的肽段,该强度比可为序列中谷氨酰胺的个数和位置提供参考。因此,低质量区提供的亚胺及其相关离子信息有助于区分赖氨酸和谷氨酰胺。 展开更多

关键词 亚胺离子 基质辅助激光解吸电离-串联飞行时间质谱 赖氨酸 谷氨酰胺 同量异序氨基酸

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人工解析提高串联质谱鉴定肽段的数据利用度

17

作者 王勇 李水明 +1 位作者 何曼文 冯里茹 《深圳大学学报（理工版）》 EI CAS 北大核心 2013年第5期538-544,共7页

为降低蛋白质鉴定的假阴性,利用标准蛋白和实际样品,探讨影响基质辅助激光解吸电离–串联飞行时间质谱数据利用度的原因.发现误差设置偏小、翻译后修饰、异常酶解和氨基酸突变等是导致蛋白质数据库检索不匹配目标肽段的主要原因.实验表... 为降低蛋白质鉴定的假阴性,利用标准蛋白和实际样品,探讨影响基质辅助激光解吸电离–串联飞行时间质谱数据利用度的原因.发现误差设置偏小、翻译后修饰、异常酶解和氨基酸突变等是导致蛋白质数据库检索不匹配目标肽段的主要原因.实验表明,典型情况下一级和二级质谱误差可设定在0.3Da.对未与数据库匹配的串联质谱进行亚胺离子辅助的人工解析发现,色氨酸双氧化、丝氨酸乙酰胺化和半胱氨酸丙酰胺化等不常见修饰,酪氨酸与苯丙氨酸、天冬氨酸与谷氨酸两两之间的突变和非特异性酶解等现象,该研究可提高质谱鉴定的数据利用度. 展开更多

关键词 蛋白质组学 数据库搜索 基质辅助激光解吸电离-串联飞行时间质谱 人工解析 亚胺离子

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莱茵衣藻基因组文库的构建

18

作者 王潮岗 陈爱娜 +1 位作者 胡章立 于珊珊 《生物技术通报》 CAS CSCD 北大核心 2013年第4期85-89,共5页

以莱茵衣藻CC-849为材料，提取基因组DNA，利用BamHⅠ和Bgl Ⅱ对基因组DNA进行酶解，获得了可用于构建基因组文库的6—12kb的基因组片段，并浓缩至200ng／pL。该片段与λDNA载体连接，经噬菌体蛋白包装、侵染大肠杆菌XL1-blue后，获得... 以莱茵衣藻CC-849为材料，提取基因组DNA，利用BamHⅠ和Bgl Ⅱ对基因组DNA进行酶解，获得了可用于构建基因组文库的6—12kb的基因组片段，并浓缩至200ng／pL。该片段与λDNA载体连接，经噬菌体蛋白包装、侵染大肠杆菌XL1-blue后，获得了莱茵衣藻基因组文库。该文库的滴度为2．12×10^5pfu／mL，共有转化子4．26×10^4个，插入片段的平均长度约为9kb，扩增后基因组文库滴度为9．5×10^6pfu／mL。 展开更多

关键词 莱茵衣藻 基因组文库 噬菌体 ZAP表达载体

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串联飞行时间质谱的碎片离子相对强度在区分亮氨酸和异亮氨酸残基中的应用

19

作者 王勇 高升 李水明 《质谱学报》 EI CAS CSCD 北大核心 2015年第4期302-309,共8页

研究肽段从头测序需要解决的问题之一是区分亮氨酸和异亮氨酸残基,利用基质辅助激光解吸电离-串联飞行时间质谱（MALDI-TOF/TOF）所产生的w型离子区分这两种氨基酸残基是目前最常用的方法。本研究以6对合成的同分异构肽段（由7～15个氨... 研究肽段从头测序需要解决的问题之一是区分亮氨酸和异亮氨酸残基,利用基质辅助激光解吸电离-串联飞行时间质谱（MALDI-TOF/TOF）所产生的w型离子区分这两种氨基酸残基是目前最常用的方法。本研究以6对合成的同分异构肽段（由7～15个氨基酸构成）为例,来说明w离子信号强度较低且有时不能产生,在区分多肽中的亮氨酸和异亮氨酸时受肽段长度和序列的限制。而亮氨酸与异亮氨酸的变化会导致亚胺相关离子、内部断裂离子、b-型和y-型离子等相对强度的微小变化。通过比较这些骨架断裂变化所产生的微小差异,可为区分肽段中的亮氨酸和异亮氨酸残基提供新的线索和判据。 展开更多

关键词 从头测序 串联飞行时间质谱(MALDI-TOF/TOF) 亮氨酸 异亮氨酸

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阿尔茨海默病转基因小鼠肝内核受体和细胞色素氧化酶基因转录谱变化 被引量：1

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作者 韩双雪 郑海洋 +3 位作者 刘洋 麦紫君 黄秀娴 何晓阳 《中国药理学与毒理学杂志》 CAS CSCD 北大核心 2015年第1期33-39,共7页

目的探讨阿尔茨海默病(AD)病变与肝Ⅰ相药酶基因表达的相关性,为早期和长期药物干预AD病程提供实验参考。方法制备B6.129-PS1M146V/APPSwe/Tau P301L三重转基因AD模型小鼠(3×Tg AD小鼠)及同系非转基因正常小鼠(NTg小鼠)肝组织总RN... 目的探讨阿尔茨海默病(AD)病变与肝Ⅰ相药酶基因表达的相关性,为早期和长期药物干预AD病程提供实验参考。方法制备B6.129-PS1M146V/APPSwe/Tau P301L三重转基因AD模型小鼠(3×Tg AD小鼠)及同系非转基因正常小鼠(NTg小鼠)肝组织总RNA和总蛋白质样品,逆转录PCR/实时荧光定量PCR技术检测肝核因子4(HNF4)等7种核受体和细胞色素氧化酶P4501a2(Cyp1a2)等7种CYP基因mRNA相对表达量,比较基因转录谱差异;Western蛋白印迹法检测技术检测差异显著的目的基因蛋白质水平。结果与NTg小鼠相比,3×Tg AD小鼠HNF4、雌激素受体(ERα)及组成型雄甾烷受体均下调近66%(P<0.01),孕烷X受体和芳香烃受体分别上调1.84和1.64倍(P<0.05),糖皮质激素受体及受氧化应激激活的核因子E2相关因子未见显著变化;主要药物代谢酶Cyp2b10及Cyp2a5 mRNA分别降低至正常小鼠水平的3%(即下降97%,P<0.01)和30%(P<0.05),Cyp2e1、Cyp2j9、Cyp3a11基因的转录水平则分别上调了2.26倍、2.42倍和3.66倍(P<0.05);Cyp1a2和Cyp2d22基因转录在两种小鼠中无明显差异。Western蛋白印迹分析证实,3×Tg AD小鼠ERα和CYP2a5明显下降(P<0.05)而Cyp3a11表达则明显上升(P<0.05),蛋白质表达变化的趋势与其相应mRNA水平改变一致。结论 3×Tg AD小鼠肝内核受体基因及CYP酶基因转录谱发生显著改变,提示AD病变可能干扰机体肝代谢功能,对机体内源性及外源性化合物生物转运产生影响。 展开更多

关键词 阿尔茨海默病 3×Tg AD模型小鼠 核受体 细胞色素氧化酶 基因转录

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