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海洋贝类基因组DNA的提取改进及ITS2扩增
被引量：
2
1
作者
张波
孟学平
《江苏农业科学》
CSCD
北大核心
2008年第1期59-61,共3页
目前已报道的常见的基因组DNA提取方法有经典酚醇法、盐析法、碘化钾法、煮沸法等,其中酚醇法根据其裂解液的不同又有CTAB、SDS、ROSE等具体方法,本试验对经典的CTAB法进行了改进,从酒精保存的西施舌组织中提取得到质量高的基因组DNA,...
目前已报道的常见的基因组DNA提取方法有经典酚醇法、盐析法、碘化钾法、煮沸法等,其中酚醇法根据其裂解液的不同又有CTAB、SDS、ROSE等具体方法,本试验对经典的CTAB法进行了改进,从酒精保存的西施舌组织中提取得到质量高的基因组DNA,以此为模板扩增ITS2效果很好。
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关键词
海洋贝类
基因组DNA
CTAB法提取
ITS2扩增
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职称材料
江苏连云港沿海蛤蜊科贝类18S-ITS1序列分析
被引量：
2
2
作者
孟学平
陈建安
+4 位作者
申欣
程汉良
董志国
阎斌伦
田美
《江苏农业科学》
CSCD
北大核心
2009年第6期55-58,共4页
利用PCR技术扩增了江苏连云港海域3种贝类(西施舌、中国蛤蜊,四角蛤蜊)核糖体RNA基因18S-ITS1区域序列。用DNAStar和MEGA3.1软件分析序列的碱基组成、进行序列比对,构建系统发育树。结果显示,西施舌、中国蛤蜊、四角蛤蜊18S-ITS1部分序...
利用PCR技术扩增了江苏连云港海域3种贝类(西施舌、中国蛤蜊,四角蛤蜊)核糖体RNA基因18S-ITS1区域序列。用DNAStar和MEGA3.1软件分析序列的碱基组成、进行序列比对,构建系统发育树。结果显示,西施舌、中国蛤蜊、四角蛤蜊18S-ITS1部分序列长度分别为1052bp、1017bp、1013bp,ITS1部分序列长度分别为910bp、875bp、871bp,G+C含量为58.90%～60.23%;18S区序列保守,种间仅存一个碱基变异位点。序列分析显示,中国蛤蜊与四角蛤蜊的ITS1同源性为70.1%～71.1%。西施舌与中国蛤蜊、四角蛤蜊的同源性为44.7%～46.3%;18S-ITS1序列适于蛤蜊科种间特别是蛤蜊属内种间的分子系统发育分析。
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关键词
18S
RRNA基因
ITS1
西施舌
中国蛤蜊
四角蛤蜊
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职称材料
蚶科三种贝类ITS2核苷酸序列分析
被引量：
5
3
作者
张波
孟学平
《石河子大学学报（自然科学版）》
CAS
2008年第2期224-227,共4页
对蚶科三种贝类ITS2进行PCR扩增、测序及分析,用Mega3.1软件进行了系统发育初步分析。结果显示：毛蚶、泥蚶和魁蚶的ITS2大小分别为284～288bp、380bp、413～417bp,三种蚶的445个序列比对位点中,共有172个保守位点,245个变异位点,166个...
对蚶科三种贝类ITS2进行PCR扩增、测序及分析,用Mega3.1软件进行了系统发育初步分析。结果显示：毛蚶、泥蚶和魁蚶的ITS2大小分别为284～288bp、380bp、413～417bp,三种蚶的445个序列比对位点中,共有172个保守位点,245个变异位点,166个简约信息位点,78个单突变位点。系统发育分析结果显示,毛蚶和泥蚶先聚为一支,而后与魁蚶聚在一起。ITS2分析结果显示毛蚶和泥蚶种间的遗传关系较近。
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关键词
蚶
ITS2
序列分析
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职称材料
题名
海洋贝类基因组DNA的提取改进及ITS2扩增
被引量：
2
1
作者
张波
孟学平
机构
淮海工学院海洋学院/江苏省海洋生物技术重点建设实验室
出处
《江苏农业科学》
CSCD
北大核心
2008年第1期59-61,共3页
基金
江苏省高校自然科学研究计划(编号:05SJD24002)
淮海工学院引进人才科研启动基金(编号:KK01050)
+1 种基金
江苏省高等学校大学生实践创新训练项目
淮海工学院大学生实验室创新项目
文摘
目前已报道的常见的基因组DNA提取方法有经典酚醇法、盐析法、碘化钾法、煮沸法等,其中酚醇法根据其裂解液的不同又有CTAB、SDS、ROSE等具体方法,本试验对经典的CTAB法进行了改进,从酒精保存的西施舌组织中提取得到质量高的基因组DNA,以此为模板扩增ITS2效果很好。
关键词
海洋贝类
基因组DNA
CTAB法提取
ITS2扩增
分类号
Q7 [生物学—分子生物学]
S961.6 [农业科学—水产养殖]
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职称材料
题名
江苏连云港沿海蛤蜊科贝类18S-ITS1序列分析
被引量：
2
2
作者
孟学平
陈建安
申欣
程汉良
董志国
阎斌伦
田美
机构
淮海工学院海洋学院/江苏省海洋生物技术重点建设实验室
出处
《江苏农业科学》
CSCD
北大核心
2009年第6期55-58,共4页
基金
江苏省自然科学基金项目(编号:BK2007066)
江苏省海洋生物技术重点建设实验室开放课题项目(编号:2005HS009)
+1 种基金
淮海工学院引进人才科研启动基金资助项目(编号:KK01050)
江苏省教育厅自然科学基金项目(编号:05SJD240028)
文摘
利用PCR技术扩增了江苏连云港海域3种贝类(西施舌、中国蛤蜊,四角蛤蜊)核糖体RNA基因18S-ITS1区域序列。用DNAStar和MEGA3.1软件分析序列的碱基组成、进行序列比对,构建系统发育树。结果显示,西施舌、中国蛤蜊、四角蛤蜊18S-ITS1部分序列长度分别为1052bp、1017bp、1013bp,ITS1部分序列长度分别为910bp、875bp、871bp,G+C含量为58.90%～60.23%;18S区序列保守,种间仅存一个碱基变异位点。序列分析显示,中国蛤蜊与四角蛤蜊的ITS1同源性为70.1%～71.1%。西施舌与中国蛤蜊、四角蛤蜊的同源性为44.7%～46.3%;18S-ITS1序列适于蛤蜊科种间特别是蛤蜊属内种间的分子系统发育分析。
关键词
18S
RRNA基因
ITS1
西施舌
中国蛤蜊
四角蛤蜊
分类号
Q959.215.4 [生物学—动物学]
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职称材料
题名
蚶科三种贝类ITS2核苷酸序列分析
被引量：
5
3
作者
张波
孟学平
机构
淮海工学院海洋学院/江苏省海洋生物技术重点建设实验室
出处
《石河子大学学报（自然科学版）》
CAS
2008年第2期224-227,共4页
基金
江苏省高校自然科学研究计划项目(05SJD24002)
江苏省高等学校大学生实践创新训练计划项目
文摘
对蚶科三种贝类ITS2进行PCR扩增、测序及分析,用Mega3.1软件进行了系统发育初步分析。结果显示：毛蚶、泥蚶和魁蚶的ITS2大小分别为284～288bp、380bp、413～417bp,三种蚶的445个序列比对位点中,共有172个保守位点,245个变异位点,166个简约信息位点,78个单突变位点。系统发育分析结果显示,毛蚶和泥蚶先聚为一支,而后与魁蚶聚在一起。ITS2分析结果显示毛蚶和泥蚶种间的遗传关系较近。
关键词
蚶
ITS2
序列分析
Keywords
arcidae
ITS2
sequence analysis
分类号
S961.6 [农业科学—水产养殖]
Q178.53 [生物学—水生生物学]
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职称材料
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
海洋贝类基因组DNA的提取改进及ITS2扩增
张波
孟学平
《江苏农业科学》
CSCD
北大核心
2008
2
在线阅读
下载PDF
职称材料
2
江苏连云港沿海蛤蜊科贝类18S-ITS1序列分析
孟学平
陈建安
申欣
程汉良
董志国
阎斌伦
田美
《江苏农业科学》
CSCD
北大核心
2009
2
在线阅读
下载PDF
职称材料
3
蚶科三种贝类ITS2核苷酸序列分析
张波
孟学平
《石河子大学学报（自然科学版）》
CAS
2008
5
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