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基于MAXENT模型评估北部湾潮间带中国鲎和圆尾鲎稚鲎的潜在地理分布及种群保育对策被引量：26: 1; 作者颜明艳李琼珍 +3 位作者宋洁王振华王有基胡梦红《生态学报》 CAS CSCD 北大核心 2019年第9期3100-3109,共10页; 鲎具有极高的经济价值和科研意义。近年来由于过度捕捞和栖息地受损等原因,亚洲鲎种群数量正急剧下降。鲎漫长的生命周期使得鲎资源的保护和增殖迫在眉睫。生态位模型已经广泛应用于物种的潜在地理分布预测。基于实地调研数据和公开发... 展开更多; 关键词中国鲎圆尾鲎最大熵模型生境适宜性保护; 在线阅读下载PDF 职称材料

CRISPR/Cas9技术敲除hbae1.1基因对斑马鱼血红蛋白生成的影响被引量：5: 2; 作者孟琳陈良标《生物学杂志》 CAS CSCD 北大核心 2021年第5期12-16,共5页; 利用CRISPR/Cas9技术敲除hbae1.1基因,获得缺失hbae1.1基因的纯合突变体,并研究缺失hbae1.1基因对斑马鱼血红蛋白生成的影响。根据斑马鱼hbae1.1基因设计敲除靶点,并制备相应gRNA,将gRNA与Cas9蛋白以一定比例混合后通过显微注射注入斑... 展开更多; 关键词斑马鱼血红蛋白 hbae1.1基因 CRISPR/Cas9 固蓝染色; 在线阅读下载PDF 职称材料

斑马鱼早期胚胎发育囊胚sphere时期的蛋白组学研究被引量：4: 3; 作者陈漪胡瑞芹 +1 位作者冉皓宇陈良标《海洋渔业》 CSCD 北大核心 2019年第1期53-64,共12页; 斑马鱼(Danio rerio)早期胚胎发育囊胚时期是胚胎发育过程的关键时期,利用i TRAQ蛋白质质谱分析技术,检测斑马鱼早期胚胎发育过程中囊胚sphere时期的蛋白质表达情况,并分析该时期表达的蛋白质的相应功能和参与调控的生物过程。以野生型... 展开更多; 关键词斑马鱼早期胚胎发育蛋白质组 ITRAQ; 在线阅读下载PDF 职称材料

TGF-β/Smad信号通路响应光周期变化参与调控斑马鱼卵巢发育被引量：8: 4; 作者刘春晓吕为群 +1 位作者杨志刚陈阿琴《南方水产科学》 CAS CSCD 北大核心 2019年第3期68-75,共8页; 为研究不同光周期条件下转化生长因子-β超家族/Samd (TGF-β/Smad)信号通路在斑马鱼(Danio rerio)卵巢中的作用,利用荧光定量PCR技术检测连续黑暗(0 L∶24 D, DD)、自然光照(14 L∶10 D, LD)和连续光照(24 L∶0 D, LL)条件下斑马鱼卵巢... 展开更多; 关键词斑马鱼光周期转化生长因子-Β SMAD蛋白卵巢发育; 在线阅读下载PDF 职称材料

低温驯化对斑马鱼胚胎发育和mtDNA拷贝数的影响被引量：3: 5; 作者冉皓宇陈良标《生物学杂志》 CAS CSCD 北大核心 2019年第5期16-20,共5页; 旨在探索低温驯化对斑马鱼胚胎线粒体DNA(mtDNA)拷贝数及胚胎低温发育能力的影响。27℃发育至性成熟的斑马鱼,在22℃驯化6个月,构建低温驯化模型。驯化组与未驯化组分别交配产卵后,收集0hpf胚胎,在22℃和20℃下发育并观察胚胎的低温发... 展开更多; 关键词低温驯化斑马鱼 MTDNA 胚胎发育; 在线阅读下载PDF 职称材料

CRISPR/Cas9系统介导的斑马鱼kctd1纯合突变体的构建: 6; 作者刘姣黄姣 +2 位作者胡金萌李伟明任建峰《生物学杂志》 CAS CSCD 北大核心 2019年第5期7-10,56,共5页; KCTD1 (potassium channel tetramerization domain containing 1)属于钾离子通道四聚化结构域蛋白基因家族的成员,该家族成员的N端具有保守的BTB(Bric-a-brack, Tram-track, Broad complex)结构域和一个钾离子四聚体通道结构域(K-ketr... 展开更多; 关键词斑马鱼 KCTD1 突变体 CRISPR/Cas9; 在线阅读下载PDF 职称材料

题名基于MAXENT模型评估北部湾潮间带中国鲎和圆尾鲎稚鲎的潜在地理分布及种群保育对策被引量：26: 1; 作者颜明艳李琼珍宋洁王振华王有基胡梦红; 机构水产科学国家级实验教学示范中心(上海海洋大学) 海洋生物科学国际联合研究中心(上海海洋大学) 上海水产养殖工程技术研究中心(上海海洋大学) 广西壮族自治区水产科学研究院天津市一瑞生物工程有限公司上海海洋大学信息学院水产种质资源发掘与利用教育部重点实验室(上海洋大学); 出处《生态学报》 CAS CSCD 北大核心 2019年第9期3100-3109,共10页; 基金香港海洋公园保育基金(OT03.1617) 2017北海市“十三五”海洋经济创新发展示范项目(Bhsfs006); 文摘鲎具有极高的经济价值和科研意义。近年来由于过度捕捞和栖息地受损等原因,亚洲鲎种群数量正急剧下降。鲎漫长的生命周期使得鲎资源的保护和增殖迫在眉睫。生态位模型已经广泛应用于物种的潜在地理分布预测。基于实地调研数据和公开发表的北部湾中国海域中国鲎和圆尾鲎地理分布数据,运用MAXENT模型得到中国鲎和圆尾鲎在广西北部湾(中国部分)的栖息地适宜度指数(Habitat suitability index, HSI),确定了这两种稚鲎在北部湾中国海域潜在适生区。模型分析结果表明,潮间带坡度和地形指数是影响中国鲎分布的主要环境因子,而潮间带底质的有机物含量和植被指数是影响圆尾鲎分布的主要环境因子,根据研究结果建议在两种稚鲎适生区建立保护区,进行人工放流稚鲎,加强对海草和红树林的生态建设,进而促进鲎资源种群恢复和发展。; 关键词中国鲎圆尾鲎最大熵模型生境适宜性保护; Keywords chinese horseshoe crab mangrove horseshoe crab MAXENT habitat suitability conservation; 分类号 Q958.8 [生物学—动物学]; 在线阅读下载PDF 职称材料

题名CRISPR/Cas9技术敲除hbae1.1基因对斑马鱼血红蛋白生成的影响被引量：5: 2; 作者孟琳陈良标; 机构海洋生物科学国际联合研究中心(上海海洋大学)中国科学技术部水产种质资源发掘与利用教育部重点实验室(上海海洋大学) 水产科学国家级实验教学示范中心(上海海洋大学); 出处《生物学杂志》 CAS CSCD 北大核心 2021年第5期12-16,共5页; 基金国家重点研发计划项目(2018YFD0900600) 上海市科委“一带一路”国际联合实验室项目(19590750500) 上海市教委研创新计划项目(2017-01-07-00-10-E00060)。; 文摘利用CRISPR/Cas9技术敲除hbae1.1基因,获得缺失hbae1.1基因的纯合突变体,并研究缺失hbae1.1基因对斑马鱼血红蛋白生成的影响。根据斑马鱼hbae1.1基因设计敲除靶点,并制备相应gRNA,将gRNA与Cas9蛋白以一定比例混合后通过显微注射注入斑马鱼受精卵一细胞期的动物极。通过T7E1核酸内切酶酶切、测序和序列比对后检测到成功敲除了hbae1.1基因,并通过与WT交配和内交,成功获得F 2代纯合突变体。将hbae1.1基因缺失的纯合突变体与野生型斑马鱼WT所产受精卵一起进行固蓝(o-Diansidine)染色,结果显示,与对照组WT相比,突变体的血红蛋白含量明显减少。研究表明,hbae1.1基因的缺失会对斑马鱼血红蛋白的生成造成一定影响。同时hbae1.1基因的研究为了解鱼类血红蛋白的发生发育提供一定基础。; 关键词斑马鱼血红蛋白 hbae1.1基因 CRISPR/Cas9 固蓝染色; Keywords zebrafish hemoglobin hbae1.1 gene CRISPR/Cas9 o-dianisidine; 分类号 Q78 [生物学—分子生物学]; 在线阅读下载PDF 职称材料

题名斑马鱼早期胚胎发育囊胚sphere时期的蛋白组学研究被引量：4: 3; 作者陈漪胡瑞芹冉皓宇陈良标; 机构海洋生物科学国际联合研究中心(上海海洋大学中国科学技术部) 水产种质资源发掘与利用教育部重点实验室(上海海洋大学) 水产科学国家级实验教学示范中心(上海海洋大学); 出处《海洋渔业》 CSCD 北大核心 2019年第1期53-64,共12页; 基金国家自然科学基金面上项目(31572611); 文摘斑马鱼(Danio rerio)早期胚胎发育囊胚时期是胚胎发育过程的关键时期,利用i TRAQ蛋白质质谱分析技术,检测斑马鱼早期胚胎发育过程中囊胚sphere时期的蛋白质表达情况,并分析该时期表达的蛋白质的相应功能和参与调控的生物过程。以野生型斑马鱼发育至sphere时期即4 hpf的胚胎为样本,利用i TRAQ标记与LC-MS/MS串联质谱技术,结合数据库比对,对该时期表达的蛋白质进行定性和定量的鉴定分析。检测结果共鉴定到的总蛋白数为1 178个,利用生物信息学进行功能分析,发现这些蛋白广泛参与了细胞信号传递、细胞运动和细胞骨架构建、细胞增殖、细胞分化、物质合成与代谢等各项重要的生命活动过程。研究表明,利用i TRAQ标记的方法可以对4hpf时期的斑马鱼胚胎中的蛋白质进行有效的分离和鉴定,并初步建立了斑马鱼早期发育关键阶段sphere时期的蛋白质组表达图谱,以期为斑马鱼胚胎发育过程中蛋白质组学和调控机制的研究提供参考。; 关键词斑马鱼早期胚胎发育蛋白质组 ITRAQ; Keywords Danio rerio early embryogenesis proteome iTRAQ; 分类号 Q954.4 [生物学—动物学]; 在线阅读下载PDF 职称材料

题名TGF-β/Smad信号通路响应光周期变化参与调控斑马鱼卵巢发育被引量：8: 4; 作者刘春晓吕为群杨志刚陈阿琴; 机构海洋生物科学国际联合研究中心(上海海洋大学) 水产科学国家级实验教学示范中心(上海海洋大学) 水产种质资源发掘与利用教育部重点实验室(上海海洋大学); 出处《南方水产科学》 CAS CSCD 北大核心 2019年第3期68-75,共8页; 基金国家自然科学基金项目(31572599,31402272); 文摘为研究不同光周期条件下转化生长因子-β超家族/Samd (TGF-β/Smad)信号通路在斑马鱼(Danio rerio)卵巢中的作用,利用荧光定量PCR技术检测连续黑暗(0 L∶24 D, DD)、自然光照(14 L∶10 D, LD)和连续光照(24 L∶0 D, LL)条件下斑马鱼卵巢中TGF-β/Smad信号通路中相关基因的相对表达量,并利用免疫组化技术检测不同光周期条件下p-Smad2在斑马鱼卵巢中的定位情况。结果显示,在不同光周期条件下,TGF-β/Smad信号通路中信号分子在斑马鱼卵巢中的表达模式不尽相同,其中配体(tgfb3)、受体(tgfbr2a,tgfbr2b,tgfbr1b)和下游蛋白激酶(smad2和smad3a)的表达趋势一致,即在不同光周期处理3 d后,上述6个基因的相对表达量DD组最高,LL组最低,但处理7 d后则呈相反趋势。在斑马鱼卵黄发生前期至充分生长未成熟期的卵母细胞中均检测到p-Smad2蛋白信号,但光周期处理后未影响p-Samd2在斑马鱼卵巢中的定位。结果表明,光周期变化可能通过改变tgfb3/受体/蛋白激酶基因的表达模式影响斑马鱼的卵巢发育。; 关键词斑马鱼光周期转化生长因子-Β SMAD蛋白卵巢发育; Keywords Danio rerio photoperiod transforming growth factor-β Smad protein ovarian development; 分类号 S917.4 [农业科学—水产科学]; 在线阅读下载PDF 职称材料

题名低温驯化对斑马鱼胚胎发育和mtDNA拷贝数的影响被引量：3: 5; 作者冉皓宇陈良标; 机构海洋生物科学国际联合研究中心(上海海洋大学)中国科学技术部水产种质资源发掘与利用教育部重点实验室(上海海洋大学) 水产科学国家级实验教学示范中心(上海海洋大学); 出处《生物学杂志》 CAS CSCD 北大核心 2019年第5期16-20,共5页; 基金国家自然科学基金面上项目(31572611) 上海市教委水产高峰学科项目; 文摘旨在探索低温驯化对斑马鱼胚胎线粒体DNA(mtDNA)拷贝数及胚胎低温发育能力的影响。27℃发育至性成熟的斑马鱼,在22℃驯化6个月,构建低温驯化模型。驯化组与未驯化组分别交配产卵后,收集0hpf胚胎,在22℃和20℃下发育并观察胚胎的低温发育能力。提取0hpf以及8hpf、12hpf、24hpf4个时期的胚胎DNA,通过绝对荧光定量PCR比较分析胚胎中mtDNA拷贝数的变化情况。结果显示,低温驯化后斑马鱼0hpf胚胎mtDNA拷贝数显著低于未驯化组胚胎mtDNA拷贝数,且mtDNA拷贝数在胚胎发育后期的3个不同时期仍低于未驯化组胚胎,但差异逐渐缩小。同时,相比于未驯化胚胎,低温驯化后的斑马鱼胚胎在22℃低温具有更高的成活率,且可以在20℃低温胁迫下成活。研究表明,低温驯化致使斑马鱼胚胎mtDNA拷贝数降低,同时提高了斑马鱼胚胎的低温发育能力。; 关键词低温驯化斑马鱼 MTDNA 胚胎发育; Keywords cold acclimation zebrafish mtDNA embryogenesis; 分类号 Q953 [生物学—动物学] S917.4 [农业科学—水产科学]; 在线阅读下载PDF 职称材料

题名CRISPR/Cas9系统介导的斑马鱼kctd1纯合突变体的构建: 6; 作者刘姣黄姣胡金萌李伟明任建峰; 机构海洋生物科学国际联合研究中心(上海海洋大学)中国科学技术部水产种质资源发掘与利用教育部重点实验室(上海海洋大学) 水产科学国家级实验教学示范中心(上海海洋大学); 出处《生物学杂志》 CAS CSCD 北大核心 2019年第5期7-10,56,共5页; 基金上海市科委国际科技合作项目(15410723300) 上海海洋大学博士启动基金(A2-0203-00-100318); 文摘 KCTD1 (potassium channel tetramerization domain containing 1)属于钾离子通道四聚化结构域蛋白基因家族的成员,该家族成员的N端具有保守的BTB(Bric-a-brack, Tram-track, Broad complex)结构域和一个钾离子四聚体通道结构域(K-ketra),但C端是多变的。人类 KCTD 基因家族成员的突变和表达异常与多种疾病相关。研究选取人类皮肤-耳朵-乳头综合征(Scalp-Ear-Nipple Syndrome,SEN)致病基因 KCTD1 在斑马鱼( Danio rerio )中的直系同源基因 kctd1 ,利用CRISPR/Cas9技术进行基因敲除,通过F 1 剪尾检测和F 1 内交,成功获得 kctd1 F 2 纯合突变体。获得的突变体类型为+7 bp和-8 bp。研究结果对于人类 KCTD1 基因功能以及KCTD1致病机理的研究具有参考价值。; 关键词斑马鱼 KCTD1 突变体 CRISPR/Cas9; Keywords zebrafish KCTD1 mutants CRISPR/Cas9; 分类号 Q78 [生物学—分子生物学]; 在线阅读下载PDF 职称材料

	题名	作者	出处	发文年	被引量	操作
1	基于MAXENT模型评估北部湾潮间带中国鲎和圆尾鲎稚鲎的潜在地理分布及种群保育对策	颜明艳李琼珍宋洁王振华王有基胡梦红	《生态学报》 CAS CSCD 北大核心	2019	26	在线阅读下载PDF 职称材料
2	CRISPR/Cas9技术敲除hbae1.1基因对斑马鱼血红蛋白生成的影响	孟琳陈良标	《生物学杂志》 CAS CSCD 北大核心	2021	5	在线阅读下载PDF 职称材料
3	斑马鱼早期胚胎发育囊胚sphere时期的蛋白组学研究	陈漪胡瑞芹冉皓宇陈良标	《海洋渔业》 CSCD 北大核心	2019	4	在线阅读下载PDF 职称材料
4	TGF-β/Smad信号通路响应光周期变化参与调控斑马鱼卵巢发育	刘春晓吕为群杨志刚陈阿琴	《南方水产科学》 CAS CSCD 北大核心	2019	8	在线阅读下载PDF 职称材料
5	低温驯化对斑马鱼胚胎发育和mtDNA拷贝数的影响	冉皓宇陈良标	《生物学杂志》 CAS CSCD 北大核心	2019	3	在线阅读下载PDF 职称材料
6	CRISPR/Cas9系统介导的斑马鱼kctd1纯合突变体的构建	刘姣黄姣胡金萌李伟明任建峰	《生物学杂志》 CAS CSCD 北大核心	2019	0	在线阅读下载PDF 职称材料