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对虾养殖池塘沉积物中IHHNV DNA检测方法的评估与应用
1
作者
吕若萱
王秀华
+6 位作者
王美凤
连新宇
李晨
许华
尹伟力
贾鹏
杨冰
《渔业科学进展》
北大核心
2025年第3期160-169,共10页
对虾传染性皮下和造血组织坏死病毒(IHHNV)是虾类疫病重要病原之一,对对虾养殖业造成危害,其主要检测方法通常通过捕获个体进行分子生物学检测。环境DNA(eDNA)技术可直接从环境样本中快速、经济地监测到目标病原,在水生动物病原检测方...
对虾传染性皮下和造血组织坏死病毒(IHHNV)是虾类疫病重要病原之一,对对虾养殖业造成危害,其主要检测方法通常通过捕获个体进行分子生物学检测。环境DNA(eDNA)技术可直接从环境样本中快速、经济地监测到目标病原,在水生动物病原检测方面的应用得到快速发展。为了评估eDNA技术检测虾类疾病病原IHHNV的有效性和可行性,本研究以不同粒径底质池塘沉积物作为研究对象,结合3种试剂盒进行提取条件优化,评估不同底质下eDNA的提取效果,利用荧光定量PCR检测方法检测IHHNV最低核酸检出量。结果显示,优化的方法对于沙底沉积物中IHHNV的检测灵敏度可达1.52×10^(2)copies/μL,泥底沉积物中IHHNV的检测灵敏度为1.32×10^(2)copies/μL,该方法灵敏度较高,方便可行,不同的池塘沉积物成分最低检测限浓度相差不到一个数量级,对提取效果差异不明显,可用于沉积物中IHHNV的检测。应用优化的eDNA技术和养殖对虾组织样品qPCR方法对养殖环境中IHHNV的存在情况进行调查。结果显示,调查点养殖池塘沉积物和养殖对虾样品中均有IHHNV检出,且存在一定对应关系。该研究对对虾养殖池塘沉积物中IHHNV DNA检测方法的评估与应用提供了可靠的技术手段,为监测养殖动物健康状态提供了科学依据,同时丰富并完善了eDNA方法在虾类病原监测中的应用。
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关键词
IHHNV
环境DNA
沉积物
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职称材料
题名
对虾养殖池塘沉积物中IHHNV DNA检测方法的评估与应用
1
作者
吕若萱
王秀华
王美凤
连新宇
李晨
许华
尹伟力
贾鹏
杨冰
机构
上海
海洋
大
学
水产
与生命
学
院
海水
养殖
生物
育种与可
持续
产出
全国
重点
实验室
(
中国
水产
科学研究院
黄
海水
产
研究所
)
青岛
海洋
科技中心
海洋渔业
科学与
食物
产出
过程
功能
实验室
青岛市
海水
养殖
流行病
学
与生物
安保
重点
实验室
烟台海关技术
中心
深圳技术大
学
出处
《渔业科学进展》
北大核心
2025年第3期160-169,共10页
基金
中国水产科学研究院中央级公益性科研院所基本科研业务费专项资金(2024GH02)
现代农业产业技术体系专项资金(CARS48)
+3 种基金
国家重点研发计划(2023YFD2400705)
中国水产科学研究院黄海水产研究所基本科研业务费(20603022023025)
海关总署揭榜挂帅项目(2021KH001)
深圳市农业发展专项资金项目:基于eDNA技术的高通量无创渔业病害监测关键技术研发及示范应用(1302)共同资助。
文摘
对虾传染性皮下和造血组织坏死病毒(IHHNV)是虾类疫病重要病原之一,对对虾养殖业造成危害,其主要检测方法通常通过捕获个体进行分子生物学检测。环境DNA(eDNA)技术可直接从环境样本中快速、经济地监测到目标病原,在水生动物病原检测方面的应用得到快速发展。为了评估eDNA技术检测虾类疾病病原IHHNV的有效性和可行性,本研究以不同粒径底质池塘沉积物作为研究对象,结合3种试剂盒进行提取条件优化,评估不同底质下eDNA的提取效果,利用荧光定量PCR检测方法检测IHHNV最低核酸检出量。结果显示,优化的方法对于沙底沉积物中IHHNV的检测灵敏度可达1.52×10^(2)copies/μL,泥底沉积物中IHHNV的检测灵敏度为1.32×10^(2)copies/μL,该方法灵敏度较高,方便可行,不同的池塘沉积物成分最低检测限浓度相差不到一个数量级,对提取效果差异不明显,可用于沉积物中IHHNV的检测。应用优化的eDNA技术和养殖对虾组织样品qPCR方法对养殖环境中IHHNV的存在情况进行调查。结果显示,调查点养殖池塘沉积物和养殖对虾样品中均有IHHNV检出,且存在一定对应关系。该研究对对虾养殖池塘沉积物中IHHNV DNA检测方法的评估与应用提供了可靠的技术手段,为监测养殖动物健康状态提供了科学依据,同时丰富并完善了eDNA方法在虾类病原监测中的应用。
关键词
IHHNV
环境DNA
沉积物
Keywords
Infectious hypodermal and hematopoietic necrosis virus(IHHNV)
Environmental DNA(eDNA)
Sediment
分类号
S949 [农业科学—水产养殖]
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题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
对虾养殖池塘沉积物中IHHNV DNA检测方法的评估与应用
吕若萱
王秀华
王美凤
连新宇
李晨
许华
尹伟力
贾鹏
杨冰
《渔业科学进展》
北大核心
2025
0
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