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海南本地抗病小米辣响应象耳豆根结线虫侵染的miRNA鉴定及其靶基因预测
1
作者
高畅
张志远
+3 位作者
刘子记
陈梅红
朱婕
曹振木
《热带作物学报》
北大核心
2025年第7期1571-1583,共13页
象耳豆根结线虫(Meloidogyneenterolobii)是一种对辣椒生产危害较大的病原物,使用抗病品种是防治该病害最为经济、环保的手段。深入理解根结线虫抗性调控机理将有利于加速抗病育种进程。本课题组前期研究中对海南本地抗病小米辣种质CF2...
象耳豆根结线虫(Meloidogyneenterolobii)是一种对辣椒生产危害较大的病原物,使用抗病品种是防治该病害最为经济、环保的手段。深入理解根结线虫抗性调控机理将有利于加速抗病育种进程。本课题组前期研究中对海南本地抗病小米辣种质CF25进行了接种前后的转录组数据分析,挖掘了与根结线虫抗性相关的代谢通路。为进一步探索抗性表达调控机理,本研究对CF25接种前后sRNA文库进行了高通量测序,共检测到133个差异表达miRNAs。以P≤0.05和|log2(FC)|≥3为筛选标准,鉴定出33个显著差异表达的miRNAs,其中包括19个已知miRNAs和14个新发现miRNAs。对33个显著差异表达的miRNAs进行靶基因预测,共得到373个靶基因,其中miR5658-z预测靶基因数量最多。GO功能和KEGG代谢通路富集分析显示靶基因主要富集于植物-病原菌互作、信号转导等通路,推测miRNA介导的信号转导及植物防御反应可能是CF25抗象耳豆根结线虫的重要原因。为初步验证差异表达miRNA和靶基因间的调控关系,选取6个差异表达miRNAs及其靶基因进行qRT-PCR表达验证,得出miRNA与靶基因的表达差异趋势与高通量测序结果一致,基本符合miRNA负向调控靶基因表达的规律。以上研究结果表明miRNA可能在辣椒对根结线虫的防御反应中起到了重要作用,为后续深入解析miRNA介导的根结线虫抗性机理奠定基础。
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关键词
灌木辣椒
抗象耳豆根结线虫
sRNA测序
miRNA
靶基因
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题名
海南本地抗病小米辣响应象耳豆根结线虫侵染的miRNA鉴定及其靶基因预测
1
作者
高畅
张志远
刘子记
陈梅红
朱婕
曹振木
机构
海南
大学热带农林学院(农业农村学院
浙江大学
海南
研究院
中国热带农业科学院热带作物品种资源研究所
海南缤纷园艺有限公司
出处
《热带作物学报》
北大核心
2025年第7期1571-1583,共13页
基金
海南省自然科学基金项目(No.323RC412)。
文摘
象耳豆根结线虫(Meloidogyneenterolobii)是一种对辣椒生产危害较大的病原物,使用抗病品种是防治该病害最为经济、环保的手段。深入理解根结线虫抗性调控机理将有利于加速抗病育种进程。本课题组前期研究中对海南本地抗病小米辣种质CF25进行了接种前后的转录组数据分析,挖掘了与根结线虫抗性相关的代谢通路。为进一步探索抗性表达调控机理,本研究对CF25接种前后sRNA文库进行了高通量测序,共检测到133个差异表达miRNAs。以P≤0.05和|log2(FC)|≥3为筛选标准,鉴定出33个显著差异表达的miRNAs,其中包括19个已知miRNAs和14个新发现miRNAs。对33个显著差异表达的miRNAs进行靶基因预测,共得到373个靶基因,其中miR5658-z预测靶基因数量最多。GO功能和KEGG代谢通路富集分析显示靶基因主要富集于植物-病原菌互作、信号转导等通路,推测miRNA介导的信号转导及植物防御反应可能是CF25抗象耳豆根结线虫的重要原因。为初步验证差异表达miRNA和靶基因间的调控关系,选取6个差异表达miRNAs及其靶基因进行qRT-PCR表达验证,得出miRNA与靶基因的表达差异趋势与高通量测序结果一致,基本符合miRNA负向调控靶基因表达的规律。以上研究结果表明miRNA可能在辣椒对根结线虫的防御反应中起到了重要作用,为后续深入解析miRNA介导的根结线虫抗性机理奠定基础。
关键词
灌木辣椒
抗象耳豆根结线虫
sRNA测序
miRNA
靶基因
Keywords
Capsicum frutescens
Meloidogyne enterolobii resistance
sRNA sequencing
miRNA
target gene
分类号
S436.418 [农业科学—农业昆虫与害虫防治]
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题名
作者
出处
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被引量
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1
海南本地抗病小米辣响应象耳豆根结线虫侵染的miRNA鉴定及其靶基因预测
高畅
张志远
刘子记
陈梅红
朱婕
曹振木
《热带作物学报》
北大核心
2025
0
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参考文献
引证文献
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