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海南省奶源和养殖环境主要肠杆菌科细菌的分布及基因分型
被引量：
2
1
作者
郝若晨
唐敏嘉
+5 位作者
刘光亮
张艳
Muhammad Shoaib
尚若锋
曹宗喜
蒲万霞
《畜牧兽医学报》
CAS
CSCD
北大核心
2023年第12期5184-5197,共14页
本研究从2021年海南省两个奶牛场采集的52份样本中分离肠杆菌科细菌,并对分离菌株进行了毒力基因、质粒型和生物被膜形成能力检测及肠杆菌科细菌基因间重复序列分子分型(ERIC-PCR)研究,以期明确牛奶及奶牛场环境中肠杆菌科细菌分布流行...
本研究从2021年海南省两个奶牛场采集的52份样本中分离肠杆菌科细菌,并对分离菌株进行了毒力基因、质粒型和生物被膜形成能力检测及肠杆菌科细菌基因间重复序列分子分型(ERIC-PCR)研究,以期明确牛奶及奶牛场环境中肠杆菌科细菌分布流行状况及其生物学特性。首先,采用16S rDNA PCR和ERIC-PCR对分离的肠杆菌科细菌进行鉴定和去重,结果显示52份样本中分离到肠杆菌科细菌49株,其中大肠埃希菌(Escherichia coli)32株,肺炎克雷伯菌(Klebsiella pneumoniae)13株,阴沟肠杆菌(Enterobacter cloacae)3株,产气肠杆菌(Enterobacter aerogenes)1株;其次,采用PCR方法进行了分离菌株的毒力基因检测,结果显示,ompA的检出率最高;之后,采用CARATTOLI创建的基于PCR的质粒复制子分型,结果显示K质粒的检出率最高;采用刚果红琼脂法对分离菌株进行了生物被膜形成能力定性检测,发现49株肠杆菌科细菌中有37株指示有生物被膜形成能力;最后,通过ERIC-PCR分型进行了肠杆菌科细菌的亲缘关系和遗传多样性分析,发现49株肠杆菌科菌株可划分为17型(Ⅰ~ⅩⅦ),Ⅵ型为优势型(均为Escherichia coli),共20株。整体研究表明肠杆菌科细菌在奶源环境中广泛存在、生物特性多样,推测具有一定的致病力和耐药性,引起人类和动物疾病风险较高,提示养殖、运输中的卫生和规范操作至关重要。
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关键词
肠杆菌科细菌
分子分型
质粒型
生物被膜
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职称材料
基于ORF7基因的猪繁殖与呼吸综合征病毒RT-RAA检测方法的建立
2
作者
于娜
马佳镁
+6 位作者
张紫薇
黄春媛
范悦轩
郑佳馨
张艳
刘光亮
曹宗喜
《动物医学进展》
北大核心
2024年第8期117-119,共3页
根据GenBank公布的ORF7基因保守序列设计了特异性引物,建立了PRRSVORF7基因反转录-重组酶介导等温扩增(RT-RAA)荧光法快速检测方法。结果表明,RT-RAA荧光法在42℃、20min内即可检测到PRRSV特异性扩增曲线,最低检测浓度为9.9×10^(6)...
根据GenBank公布的ORF7基因保守序列设计了特异性引物,建立了PRRSVORF7基因反转录-重组酶介导等温扩增(RT-RAA)荧光法快速检测方法。结果表明,RT-RAA荧光法在42℃、20min内即可检测到PRRSV特异性扩增曲线,最低检测浓度为9.9×10^(6)copies/μL;与PRVBartha-K61、PCV、CSFV、PRRSVGD、PRRSVXH-GD、PRRSVGM2、PRRSVCH-1a病毒均无交叉反应。分别对157份样品进行荧光RT-RAA法与PCR方法的检测进行比对,结果显示,荧光RT-RAA法敏感性为94.0%,特异性为100%。建立的PRRSV荧光RT-RAA法操作简便,特异性强,灵敏度高。
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关键词
猪繁殖与呼吸综合征病毒
ORF7基因
反转录-重组酶介导等温扩增
特异性
灵敏度
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职称材料
题名
海南省奶源和养殖环境主要肠杆菌科细菌的分布及基因分型
被引量：
2
1
作者
郝若晨
唐敏嘉
刘光亮
张艳
Muhammad Shoaib
尚若锋
曹宗喜
蒲万霞
机构
海南省农业科学院畜牧兽医研究所、海南省热带动物繁育与疫病研究重点实验室
中国
农业
科学院
兰州
畜牧
与兽药
研究所
/
农业
农村部兽用药物创制
重点
实验室
/甘肃省新兽药工程
重点
实验室
中国
农业
科学院
兰州
兽医
研究所
出处
《畜牧兽医学报》
CAS
CSCD
北大核心
2023年第12期5184-5197,共14页
基金
海南省热带动物繁育与疫病研究重点实验室开放课题计划任务书(HKL20200302)
海南省重点研发项目(ZDYF2023XDNY038)。
文摘
本研究从2021年海南省两个奶牛场采集的52份样本中分离肠杆菌科细菌,并对分离菌株进行了毒力基因、质粒型和生物被膜形成能力检测及肠杆菌科细菌基因间重复序列分子分型(ERIC-PCR)研究,以期明确牛奶及奶牛场环境中肠杆菌科细菌分布流行状况及其生物学特性。首先,采用16S rDNA PCR和ERIC-PCR对分离的肠杆菌科细菌进行鉴定和去重,结果显示52份样本中分离到肠杆菌科细菌49株,其中大肠埃希菌(Escherichia coli)32株,肺炎克雷伯菌(Klebsiella pneumoniae)13株,阴沟肠杆菌(Enterobacter cloacae)3株,产气肠杆菌(Enterobacter aerogenes)1株;其次,采用PCR方法进行了分离菌株的毒力基因检测,结果显示,ompA的检出率最高;之后,采用CARATTOLI创建的基于PCR的质粒复制子分型,结果显示K质粒的检出率最高;采用刚果红琼脂法对分离菌株进行了生物被膜形成能力定性检测,发现49株肠杆菌科细菌中有37株指示有生物被膜形成能力;最后,通过ERIC-PCR分型进行了肠杆菌科细菌的亲缘关系和遗传多样性分析,发现49株肠杆菌科菌株可划分为17型(Ⅰ~ⅩⅦ),Ⅵ型为优势型(均为Escherichia coli),共20株。整体研究表明肠杆菌科细菌在奶源环境中广泛存在、生物特性多样,推测具有一定的致病力和耐药性,引起人类和动物疾病风险较高,提示养殖、运输中的卫生和规范操作至关重要。
关键词
肠杆菌科细菌
分子分型
质粒型
生物被膜
Keywords
Enterobacteriaceae
molecular typing
plasmid type
biofilm
分类号
S852.6 [农业科学—基础兽医学]
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职称材料
题名
基于ORF7基因的猪繁殖与呼吸综合征病毒RT-RAA检测方法的建立
2
作者
于娜
马佳镁
张紫薇
黄春媛
范悦轩
郑佳馨
张艳
刘光亮
曹宗喜
机构
海南省农业科学院畜牧兽医研究所、海南省热带动物繁育与疫病研究重点实验室
塔里木大学
动物
科学
与技术
学院
、新疆生产建设兵团塔里木
动物
疫病
诊断与防控工程
实验室
新疆
农业
大学
动物
医学
学院
苏州天隆生物科技有限公司
出处
《动物医学进展》
北大核心
2024年第8期117-119,共3页
基金
国家自然科学基金项目(32060796)
海南省重点研发项目(ZDYF2023XDNY038)
+1 种基金
海南省重大科技计划项目(ZDKJ2021030)
国家重点研发计划(2021YFA0805905)。
文摘
根据GenBank公布的ORF7基因保守序列设计了特异性引物,建立了PRRSVORF7基因反转录-重组酶介导等温扩增(RT-RAA)荧光法快速检测方法。结果表明,RT-RAA荧光法在42℃、20min内即可检测到PRRSV特异性扩增曲线,最低检测浓度为9.9×10^(6)copies/μL;与PRVBartha-K61、PCV、CSFV、PRRSVGD、PRRSVXH-GD、PRRSVGM2、PRRSVCH-1a病毒均无交叉反应。分别对157份样品进行荧光RT-RAA法与PCR方法的检测进行比对,结果显示,荧光RT-RAA法敏感性为94.0%,特异性为100%。建立的PRRSV荧光RT-RAA法操作简便,特异性强,灵敏度高。
关键词
猪繁殖与呼吸综合征病毒
ORF7基因
反转录-重组酶介导等温扩增
特异性
灵敏度
Keywords
PRRSV
ORF7 gene
RT-RAA
specificity
sensitivity
分类号
S852.659.6 [农业科学—基础兽医学]
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职称材料
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
海南省奶源和养殖环境主要肠杆菌科细菌的分布及基因分型
郝若晨
唐敏嘉
刘光亮
张艳
Muhammad Shoaib
尚若锋
曹宗喜
蒲万霞
《畜牧兽医学报》
CAS
CSCD
北大核心
2023
2
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职称材料
2
基于ORF7基因的猪繁殖与呼吸综合征病毒RT-RAA检测方法的建立
于娜
马佳镁
张紫薇
黄春媛
范悦轩
郑佳馨
张艳
刘光亮
曹宗喜
《动物医学进展》
北大核心
2024
0
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