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M6A甲基化调控因子对结直肠癌预后及细胞生物学行为的影响
被引量:
4
1
作者
刘宁
江帆
+2 位作者
陈之巨
王葆春
吕云福
《陆军军医大学学报》
CAS
CSCD
北大核心
2022年第11期1126-1135,共10页
目的探讨N6-甲基腺苷(N6-methyladenosine,m6A)相关基因对结直肠癌预后及细胞生物学行为的影响。方法从肿瘤基因组图谱(the cancer genome atlas,TCGA)下载长链非编码RNA(long noncoding RNA,lncRNA)和21个M6A相关基因的表达谱数据,R软...
目的探讨N6-甲基腺苷(N6-methyladenosine,m6A)相关基因对结直肠癌预后及细胞生物学行为的影响。方法从肿瘤基因组图谱(the cancer genome atlas,TCGA)下载长链非编码RNA(long noncoding RNA,lncRNA)和21个M6A相关基因的表达谱数据,R软件分析差异基因;聚类分析和主成分分析(principal component analysis,PCA)分析M6A相关基因;单因素Cox回归分析筛选预后相关M6A基因,LASSO算法建立风险预测模型;筛选结直肠癌相关差异lncRNA(differentially expressed lncRNA,DElncRNA),与M6A相关基因建立共表达网络。使用实时荧光定量PCR(real time fluorescence quantitative PCR,RT-qPCR)检测M6A reader脆性X智力低下1(fragile X mental retardation 1,FMR1)在结直肠癌组织中的表达,在结直肠癌细胞中敲除FMR1基因,通过CCK-8、划痕实验、Transwell和细胞凋亡实验检测细胞的增殖、迁移、侵袭和凋亡情况。结果21个M6A相关基因中有15个基因在结直肠癌中差异表达。聚类分析显示,结直肠癌肿瘤分成2种亚型;从建立的风险模型得出烷基化修复同源蛋白5(a-ketoglutarate-dependent dioxygenase alk B homolog 5,ALKBH5)、YTH结构域蛋白2(YTH domaincontaining protein 2,YTHDC2)和FMR1可能是独立的预后因子。随后,筛选出1784个DElncRNA,构建包含3个预后因子和18个DElncRNAs的共表达网络。网络图中发现FMR1基因占主导地位,RT-qPCR实验发现FMR1在结直肠癌组织中上调;FMR1基因的敲除能抑制结直肠癌HT-29细胞的增殖,迁移和侵袭能力,促进结直肠癌细胞的凋亡。结论M6A甲基化调控因子ALKBH5、YTHDC2和FMR1可能是结直肠癌中的独立预后因子,FMR1基因的敲除能抑制结直肠癌细胞的增殖、迁移、侵袭,促进结直肠癌细胞的凋亡。
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关键词
M6A甲基化
预后
LASSO风险模型
FMR1
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职称材料
溃疡病急性穿孔两种单纯修补术疗效评价
被引量:
1
2
作者
林友刚
王葆春
黄坤
《实用医学杂志》
CAS
北大核心
2015年第4期690-691,共2页
单纯修补术是外科治疗溃疡病穿孔一种比较简单和常用的术式。但其效果究竟如何?临床上却不大被重视,尤其20世纪70年代以来几乎见不到专门论著,因此有必要予以总结。2001年1月至2012年12月我院对54例溃疡病急性穿孔患者施行了单纯修补...
单纯修补术是外科治疗溃疡病穿孔一种比较简单和常用的术式。但其效果究竟如何?临床上却不大被重视,尤其20世纪70年代以来几乎见不到专门论著,因此有必要予以总结。2001年1月至2012年12月我院对54例溃疡病急性穿孔患者施行了单纯修补术。最近我们对这些患者进行了随访,现报告如下。1资料与方法1.1一般资料本组54例中,男52例,女2例。年龄17~75岁,多数在40岁以下。
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关键词
溃疡病急性穿孔
单纯修补术
疗效评价
溃疡病穿孔
外科治疗
患者
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职称材料
题名
M6A甲基化调控因子对结直肠癌预后及细胞生物学行为的影响
被引量:
4
1
作者
刘宁
江帆
陈之巨
王葆春
吕云福
机构
海南省人民医院胃肠外一科
出处
《陆军军医大学学报》
CAS
CSCD
北大核心
2022年第11期1126-1135,共10页
基金
海南省自然科学基金青年基金(819QN353)
海南省重点研发项目(ZDYF2022SHFZ116)
海南省人民医院院级项目(2021MSXM07)
文摘
目的探讨N6-甲基腺苷(N6-methyladenosine,m6A)相关基因对结直肠癌预后及细胞生物学行为的影响。方法从肿瘤基因组图谱(the cancer genome atlas,TCGA)下载长链非编码RNA(long noncoding RNA,lncRNA)和21个M6A相关基因的表达谱数据,R软件分析差异基因;聚类分析和主成分分析(principal component analysis,PCA)分析M6A相关基因;单因素Cox回归分析筛选预后相关M6A基因,LASSO算法建立风险预测模型;筛选结直肠癌相关差异lncRNA(differentially expressed lncRNA,DElncRNA),与M6A相关基因建立共表达网络。使用实时荧光定量PCR(real time fluorescence quantitative PCR,RT-qPCR)检测M6A reader脆性X智力低下1(fragile X mental retardation 1,FMR1)在结直肠癌组织中的表达,在结直肠癌细胞中敲除FMR1基因,通过CCK-8、划痕实验、Transwell和细胞凋亡实验检测细胞的增殖、迁移、侵袭和凋亡情况。结果21个M6A相关基因中有15个基因在结直肠癌中差异表达。聚类分析显示,结直肠癌肿瘤分成2种亚型;从建立的风险模型得出烷基化修复同源蛋白5(a-ketoglutarate-dependent dioxygenase alk B homolog 5,ALKBH5)、YTH结构域蛋白2(YTH domaincontaining protein 2,YTHDC2)和FMR1可能是独立的预后因子。随后,筛选出1784个DElncRNA,构建包含3个预后因子和18个DElncRNAs的共表达网络。网络图中发现FMR1基因占主导地位,RT-qPCR实验发现FMR1在结直肠癌组织中上调;FMR1基因的敲除能抑制结直肠癌HT-29细胞的增殖,迁移和侵袭能力,促进结直肠癌细胞的凋亡。结论M6A甲基化调控因子ALKBH5、YTHDC2和FMR1可能是结直肠癌中的独立预后因子,FMR1基因的敲除能抑制结直肠癌细胞的增殖、迁移、侵袭,促进结直肠癌细胞的凋亡。
关键词
M6A甲基化
预后
LASSO风险模型
FMR1
Keywords
M6A methylation
prognosis
LASSO risk model
fragile X mental retardation 1
分类号
R735.3 [医药卫生—肿瘤]
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职称材料
题名
溃疡病急性穿孔两种单纯修补术疗效评价
被引量:
1
2
作者
林友刚
王葆春
黄坤
机构
海南省人民医院胃肠外一科
出处
《实用医学杂志》
CAS
北大核心
2015年第4期690-691,共2页
文摘
单纯修补术是外科治疗溃疡病穿孔一种比较简单和常用的术式。但其效果究竟如何?临床上却不大被重视,尤其20世纪70年代以来几乎见不到专门论著,因此有必要予以总结。2001年1月至2012年12月我院对54例溃疡病急性穿孔患者施行了单纯修补术。最近我们对这些患者进行了随访,现报告如下。1资料与方法1.1一般资料本组54例中,男52例,女2例。年龄17~75岁,多数在40岁以下。
关键词
溃疡病急性穿孔
单纯修补术
疗效评价
溃疡病穿孔
外科治疗
患者
分类号
R656.6 [医药卫生—外科学]
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职称材料
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
M6A甲基化调控因子对结直肠癌预后及细胞生物学行为的影响
刘宁
江帆
陈之巨
王葆春
吕云福
《陆军军医大学学报》
CAS
CSCD
北大核心
2022
4
在线阅读
下载PDF
职称材料
2
溃疡病急性穿孔两种单纯修补术疗效评价
林友刚
王葆春
黄坤
《实用医学杂志》
CAS
北大核心
2015
1
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