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基于iTRAQ技术筛选红榄李种子响应败育差异表达蛋白
被引量:
2
1
作者
李卫锦
张静文
+1 位作者
袁长春
张颖
《广东农业科学》
CAS
2020年第7期68-78,共11页
【目的】探索濒危红树植物红榄李败育种子的分子机制。【方法】借助iTRAQ定量蛋白质组学技术分析红榄李不同育性种子蛋白质组的表达差异。对质检合格的两个蛋白质组进行酶解,iTRAQ标记后进行高效液相色谱、质谱检测。利用Mascot软件进...
【目的】探索濒危红树植物红榄李败育种子的分子机制。【方法】借助iTRAQ定量蛋白质组学技术分析红榄李不同育性种子蛋白质组的表达差异。对质检合格的两个蛋白质组进行酶解,iTRAQ标记后进行高效液相色谱、质谱检测。利用Mascot软件进行蛋白质鉴定,通过iTRAQ定量寻找差异表达蛋白,并进行GO功能注释、KEGG代谢通路和蛋白互作分析,并通过实时荧光定量PCR对8个差异候选表达基因进行验证。【结果】红榄李种子蛋白质组共鉴定出2380个蛋白,其中差异表达蛋白448个,包括上调表达蛋白238个和下调表达蛋白210个。差异蛋白中的1.86%与生殖发育的生物学过程密切相关。GO分析表明,败育种子的上调蛋白主要参与到内质网蛋白的加工、RNA转运、RNA降解、囊泡运输中SNARE相互作用及mRNA调控等生物学过程。差异蛋白中的UGGT蛋白、HSP蛋白和囊泡相关膜蛋白可能在败育种子的发育过程中发挥重要调控作用。【结论】参与种子萌发和植物生长发育的转录因子出现不同程度的差异表达,可能是导致红榄李种子败育的直接或间接原因,研究结果为红榄李濒危机制和种质资源保护研究提供了科学支撑。
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关键词
红榄李
濒危红树植物
败育机制
蛋白质组
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题名
基于iTRAQ技术筛选红榄李种子响应败育差异表达蛋白
被引量:
2
1
作者
李卫锦
张静文
袁长春
张颖
机构
岭南
师范
学院
生命科学
与技术
学院
海南师范大学生命科学学院/热带岛屿生态学教育部重点实验室
出处
《广东农业科学》
CAS
2020年第7期68-78,共11页
基金
海南省自然科学基金(418QN240)
国家自然科学基金(41776148,31760119)
+1 种基金
岭南师范学院理科重点项目(LZ1906)
湛江市科技计划项目(2018A03024)。
文摘
【目的】探索濒危红树植物红榄李败育种子的分子机制。【方法】借助iTRAQ定量蛋白质组学技术分析红榄李不同育性种子蛋白质组的表达差异。对质检合格的两个蛋白质组进行酶解,iTRAQ标记后进行高效液相色谱、质谱检测。利用Mascot软件进行蛋白质鉴定,通过iTRAQ定量寻找差异表达蛋白,并进行GO功能注释、KEGG代谢通路和蛋白互作分析,并通过实时荧光定量PCR对8个差异候选表达基因进行验证。【结果】红榄李种子蛋白质组共鉴定出2380个蛋白,其中差异表达蛋白448个,包括上调表达蛋白238个和下调表达蛋白210个。差异蛋白中的1.86%与生殖发育的生物学过程密切相关。GO分析表明,败育种子的上调蛋白主要参与到内质网蛋白的加工、RNA转运、RNA降解、囊泡运输中SNARE相互作用及mRNA调控等生物学过程。差异蛋白中的UGGT蛋白、HSP蛋白和囊泡相关膜蛋白可能在败育种子的发育过程中发挥重要调控作用。【结论】参与种子萌发和植物生长发育的转录因子出现不同程度的差异表达,可能是导致红榄李种子败育的直接或间接原因,研究结果为红榄李濒危机制和种质资源保护研究提供了科学支撑。
关键词
红榄李
濒危红树植物
败育机制
蛋白质组
Keywords
Lumnitzera littorea
endangered mangrove
abortion mechanism
proteome
分类号
Q341 [生物学—遗传学]
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作者
出处
发文年
被引量
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1
基于iTRAQ技术筛选红榄李种子响应败育差异表达蛋白
李卫锦
张静文
袁长春
张颖
《广东农业科学》
CAS
2020
2
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