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香蕉AP2/ERFs超家族的重新鉴定及在果实采后成熟过程中的差异表达特性
被引量：
1
1
作者
张海波
郑云柯
+4 位作者
付毛妮
张建斌
贾彩红
李新国
刘菊华
《果树学报》
CAS
CSCD
北大核心
2024年第5期861-874,共14页
【目的】在全基因组水平上重新鉴定香蕉A基因组中的AP2/ERF家族成员,研究其在香蕉果实采后成熟过程中的差异表达特性,明确可能参与香蕉果实成熟调控的关键基因。【方法】对香蕉A基因组中AP2/ERF家族成员进行系统进化、结构特征、蛋白质...
【目的】在全基因组水平上重新鉴定香蕉A基因组中的AP2/ERF家族成员,研究其在香蕉果实采后成熟过程中的差异表达特性,明确可能参与香蕉果实成熟调控的关键基因。【方法】对香蕉A基因组中AP2/ERF家族成员进行系统进化、结构特征、蛋白质特性、保守结构域分析和两大类主栽品种巴西蕉(AAA)和粉蕉(ABB)果实采后成熟不同阶段的转录组分析。【结果】发现AP2/ERFs家族共有317个家族成员,分为AP2(49个)、ERF(253)和RAV(15)三个亚家族,他们不均匀地分布在染色体上。根据保守结构域和基因结构特征,ERF又分为a、b、c、d、e、f、h、i、j和k共10个亚类。转录组分析结果表明,在巴西蕉果实采后成熟过程中差异表达的AP2/ERFs家族成员有77个,其中高水平表达的有MaERF15、36、42和AP2-28。在粉蕉果实采后成熟过程中差异表达的AP2/ERFs家族成员有74个,其中高水平表达的有MaERF42和AP2-28。同时在巴西蕉和粉蕉果实成熟过程中差异表达的基因有57个,其中高水平表达的基因有MaERF15、42和AP2-28,只在巴西蕉果实中特异表达的有20个,只在粉蕉中特异表达的有17个。【结论】重新鉴定了香蕉AP2/ERFs超家族成员及其在果实后熟过程中的差异表达特性,为系统深入解析香蕉AP2/ERF基因功能奠定了基础,对为调控香蕉果实成熟提供靶标基因具有一定的理论意义。
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关键词
香蕉
AP2/ERFs
全基因组分析
果实成熟
差异表达分析
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题名
香蕉AP2/ERFs超家族的重新鉴定及在果实采后成熟过程中的差异表达特性
被引量：
1
1
作者
张海波
郑云柯
付毛妮
张建斌
贾彩红
李新国
刘菊华
机构
海南大学热带农林学院·热带作物生物育种全国重点实验室
中国
热带
农业科
学院
三亚研究院
中国
热带
农业科
学院
热带
生物
技术研究所·农业农村部
热带
生物
技术
重点
实验室
出处
《果树学报》
CAS
CSCD
北大核心
2024年第5期861-874,共14页
基金
国家自然科学基金项目(32172269)
国家香蕉产业技术体系(CARS-31)
热带作物生物育种全国重点实验室科研项目(NKLTCB202301)。
文摘
【目的】在全基因组水平上重新鉴定香蕉A基因组中的AP2/ERF家族成员,研究其在香蕉果实采后成熟过程中的差异表达特性,明确可能参与香蕉果实成熟调控的关键基因。【方法】对香蕉A基因组中AP2/ERF家族成员进行系统进化、结构特征、蛋白质特性、保守结构域分析和两大类主栽品种巴西蕉(AAA)和粉蕉(ABB)果实采后成熟不同阶段的转录组分析。【结果】发现AP2/ERFs家族共有317个家族成员,分为AP2(49个)、ERF(253)和RAV(15)三个亚家族,他们不均匀地分布在染色体上。根据保守结构域和基因结构特征,ERF又分为a、b、c、d、e、f、h、i、j和k共10个亚类。转录组分析结果表明,在巴西蕉果实采后成熟过程中差异表达的AP2/ERFs家族成员有77个,其中高水平表达的有MaERF15、36、42和AP2-28。在粉蕉果实采后成熟过程中差异表达的AP2/ERFs家族成员有74个,其中高水平表达的有MaERF42和AP2-28。同时在巴西蕉和粉蕉果实成熟过程中差异表达的基因有57个,其中高水平表达的基因有MaERF15、42和AP2-28,只在巴西蕉果实中特异表达的有20个,只在粉蕉中特异表达的有17个。【结论】重新鉴定了香蕉AP2/ERFs超家族成员及其在果实后熟过程中的差异表达特性,为系统深入解析香蕉AP2/ERF基因功能奠定了基础,对为调控香蕉果实成熟提供靶标基因具有一定的理论意义。
关键词
香蕉
AP2/ERFs
全基因组分析
果实成熟
差异表达分析
Keywords
Banana(Musa spp.)
AP2/ERFs
Genome wide analysis
Fruit ripening
Differential gene expression
分类号
S668.1 [农业科学—果树学]
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作者
出处
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1
香蕉AP2/ERFs超家族的重新鉴定及在果实采后成熟过程中的差异表达特性
张海波
郑云柯
付毛妮
张建斌
贾彩红
李新国
刘菊华
《果树学报》
CAS
CSCD
北大核心
2024
1
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