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基于InDel标记分析305份中国甘薯登记品种遗传多样性
被引量：
4
1
作者
唐芬
赵路宽
+7 位作者
苏一钧
肖世卓
袁蕊
翁宗宽
戴习彬
周志林
陈艳丽
曹清河
《植物遗传资源学报》
CAS
CSCD
北大核心
2024年第4期576-585,共10页
对甘薯育成品种进行亲缘关系评价,是了解其遗传背景并有效利用种质资源的重要前提。利用本课题组前期开发的23对InDel引物对305份中国甘薯登记品种进行基因型分析,共扩增出56个条带,其中53个条带具有多态性,多态率达94.6%。多态信息量(P...
对甘薯育成品种进行亲缘关系评价,是了解其遗传背景并有效利用种质资源的重要前提。利用本课题组前期开发的23对InDel引物对305份中国甘薯登记品种进行基因型分析,共扩增出56个条带,其中53个条带具有多态性,多态率达94.6%。多态信息量(PIC)、Nei′s遗传多样性指数(H)、观测杂合度(Ho)和期望杂合度(He)的平均值分别为0.4098、0.4451、0.6003、0.4460。群体结构分析表明,群体数在K=2时ΔK达到最大值,K=4时有个小高峰;北方薯区和长江流域薯区在2个组群内均匀分布,南方薯区大部分(72.97%)汇聚在组群2。主坐标分析(PCoA)中南方薯区有部分汇聚,整体没有划分出明显的簇群。聚类结果将群体划分为4个主要类群,北方薯区和长江流域薯区的品种在类群Ⅰ、Ⅱ、Ⅲ和Ⅳ中均匀分布,南方薯区主要(77.03%)集中于类群IV,这一聚类结果与群体结构研究、主坐标分析基本一致。通过系谱分析筛选出登记品种的13个主要亲本材料,各育种单位存在重复利用亲本进行正反交培育的情况。本研究将分子标记结果与系谱信息相结合,初步表明中国甘薯登记品种的亲缘关系较近,遗传背景狭窄,为甘薯的种质创新、新品种选育提供参考。
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关键词
甘薯
登记品种
INDEL
遗传多样性
群体结构
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职称材料
意大利蜜蜂α1亚型烟碱型乙酰胆碱受体功能表达和分析
2
作者
耿俊杰
王昱权
+1 位作者
张坤
吴少英
《热带生物学报》
2024年第5期623-631,共9页
尽管作用于昆虫烟碱型乙酰胆碱受体(nicotinic acetylcholine receptors,nAChRs)的新烟碱类杀虫剂是农作物害虫防治的常用工具,但它们对意大利蜜蜂等传粉昆虫产生严重的负面影响。本研究克隆意大利蜜蜂nAChRα1亚基基因,对其进行系统发...
尽管作用于昆虫烟碱型乙酰胆碱受体(nicotinic acetylcholine receptors,nAChRs)的新烟碱类杀虫剂是农作物害虫防治的常用工具,但它们对意大利蜜蜂等传粉昆虫产生严重的负面影响。本研究克隆意大利蜜蜂nAChRα1亚基基因,对其进行系统发育分析,并利用双电极电压钳技术研究α1亚型nAChR与新烟碱类杀虫剂(吡虫啉、噻虫胺和呋虫胺)的相互作用机制。序列比对和系统进化树分析显示,意大利蜜蜂nAChRα1亚基具有典型的nAChRs亚基家族基因结构域特征,与半翅目昆虫的α1亚基关系最远,与同属膜翅目蜜蜂的α1亚基关系最近。将意大利蜜蜂nAChRα1亚基与大鼠nAChRβ2亚基在非洲爪蟾卵母细胞中共表达,电生理结果显示吡虫啉对Amα1/rβ2 nAChR的激动效率最高,噻虫胺最低,而Amα1/rβ2 nAChR对呋虫胺的激动亲和力最高,对吡虫啉最低。这表明意大利蜜蜂nAChRα1亚基是新烟碱类杀虫剂的作用靶标之一,并且Amα1/rβ2 nAChR对不同新烟碱类杀虫剂敏感性存在差异。本研究结果对于开发作用于害虫的新型高选择性杀虫剂具有重要理论指导意义。
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关键词
意大利蜜蜂
烟碱型乙酰胆碱受体
α1亚基
功能表达
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职称材料
题名
基于InDel标记分析305份中国甘薯登记品种遗传多样性
被引量：
4
1
作者
唐芬
赵路宽
苏一钧
肖世卓
袁蕊
翁宗宽
戴习彬
周志林
陈艳丽
曹清河
机构
海南大学
南繁
研究院
(
三亚
南繁
研究院
)
江苏徐淮地区徐州农业科学
研究
所/江苏徐州甘薯
研究
中心
海南大学
热带农林学院/
海南
省热带园艺作物品质调控重点实验室
出处
《植物遗传资源学报》
CAS
CSCD
北大核心
2024年第4期576-585,共10页
基金
国家甘薯产业技术体系(CARS-10-GW)
江苏省种业振兴“揭榜挂帅”项目(JBGS(2021)010)。
文摘
对甘薯育成品种进行亲缘关系评价,是了解其遗传背景并有效利用种质资源的重要前提。利用本课题组前期开发的23对InDel引物对305份中国甘薯登记品种进行基因型分析,共扩增出56个条带,其中53个条带具有多态性,多态率达94.6%。多态信息量(PIC)、Nei′s遗传多样性指数(H)、观测杂合度(Ho)和期望杂合度(He)的平均值分别为0.4098、0.4451、0.6003、0.4460。群体结构分析表明,群体数在K=2时ΔK达到最大值,K=4时有个小高峰;北方薯区和长江流域薯区在2个组群内均匀分布,南方薯区大部分(72.97%)汇聚在组群2。主坐标分析(PCoA)中南方薯区有部分汇聚,整体没有划分出明显的簇群。聚类结果将群体划分为4个主要类群,北方薯区和长江流域薯区的品种在类群Ⅰ、Ⅱ、Ⅲ和Ⅳ中均匀分布,南方薯区主要(77.03%)集中于类群IV,这一聚类结果与群体结构研究、主坐标分析基本一致。通过系谱分析筛选出登记品种的13个主要亲本材料,各育种单位存在重复利用亲本进行正反交培育的情况。本研究将分子标记结果与系谱信息相结合,初步表明中国甘薯登记品种的亲缘关系较近,遗传背景狭窄,为甘薯的种质创新、新品种选育提供参考。
关键词
甘薯
登记品种
INDEL
遗传多样性
群体结构
Keywords
sweetpotato
registered variety
InDel
genetic diversity
population structure
分类号
S531 [农业科学—作物学]
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职称材料
题名
意大利蜜蜂α1亚型烟碱型乙酰胆碱受体功能表达和分析
2
作者
耿俊杰
王昱权
张坤
吴少英
机构
海南大学
南繁
研究院
(
三亚
南繁
研究院
)
海南大学
热带农林学院
出处
《热带生物学报》
2024年第5期623-631,共9页
基金
海南省重大科技计划项目(ZDKJ2021007)
国家自然科学基金地区科学基金项目(32360663,32260666)。
文摘
尽管作用于昆虫烟碱型乙酰胆碱受体(nicotinic acetylcholine receptors,nAChRs)的新烟碱类杀虫剂是农作物害虫防治的常用工具,但它们对意大利蜜蜂等传粉昆虫产生严重的负面影响。本研究克隆意大利蜜蜂nAChRα1亚基基因,对其进行系统发育分析,并利用双电极电压钳技术研究α1亚型nAChR与新烟碱类杀虫剂(吡虫啉、噻虫胺和呋虫胺)的相互作用机制。序列比对和系统进化树分析显示,意大利蜜蜂nAChRα1亚基具有典型的nAChRs亚基家族基因结构域特征,与半翅目昆虫的α1亚基关系最远,与同属膜翅目蜜蜂的α1亚基关系最近。将意大利蜜蜂nAChRα1亚基与大鼠nAChRβ2亚基在非洲爪蟾卵母细胞中共表达,电生理结果显示吡虫啉对Amα1/rβ2 nAChR的激动效率最高,噻虫胺最低,而Amα1/rβ2 nAChR对呋虫胺的激动亲和力最高,对吡虫啉最低。这表明意大利蜜蜂nAChRα1亚基是新烟碱类杀虫剂的作用靶标之一,并且Amα1/rβ2 nAChR对不同新烟碱类杀虫剂敏感性存在差异。本研究结果对于开发作用于害虫的新型高选择性杀虫剂具有重要理论指导意义。
关键词
意大利蜜蜂
烟碱型乙酰胆碱受体
α1亚基
功能表达
Keywords
Apis mellifera
nicotinic acetylcholine receptor
α1 subunit
functional expression
分类号
Q966 [生物学—昆虫学]
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职称材料
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
基于InDel标记分析305份中国甘薯登记品种遗传多样性
唐芬
赵路宽
苏一钧
肖世卓
袁蕊
翁宗宽
戴习彬
周志林
陈艳丽
曹清河
《植物遗传资源学报》
CAS
CSCD
北大核心
2024
4
在线阅读
下载PDF
职称材料
2
意大利蜜蜂α1亚型烟碱型乙酰胆碱受体功能表达和分析
耿俊杰
王昱权
张坤
吴少英
《热带生物学报》
2024
0
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职称材料
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