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海南坡鹿MD2 cDNA的克隆及其生物信息学分析
1
作者
杜丽
谢少林
+8 位作者
成鹰
张晓茹
匡文华
焦寒伟
张冬琳
郝永昌
雷明
刘涛
王凤阳
《热带生物学报》
2011年第1期1-5,共5页
以海南坡鹿外周血白细胞总RNA为模板,利用RT-PCR技术,获得海南坡鹿MD2全长cDNA,并对其进行较系统的生物信息学分析,内容包括序列特征分析、同源性分析、编码蛋白质理化性质及结构预测。结果表明:海南坡鹿MD2的CDS序列长度为486 bp,编码...
以海南坡鹿外周血白细胞总RNA为模板,利用RT-PCR技术,获得海南坡鹿MD2全长cDNA,并对其进行较系统的生物信息学分析,内容包括序列特征分析、同源性分析、编码蛋白质理化性质及结构预测。结果表明:海南坡鹿MD2的CDS序列长度为486 bp,编码160个氨基酸,与黄牛、人、欧洲兔、褐家鼠的核苷酸序列同源性分别为98.55%,77.43%,78.47%和74.74%。该基因编码的蛋白质相对分子质量约为19×103,理论等电点为8.18。对编码蛋白的分子结构预测发现,该蛋白为非跨膜蛋白,其二级结构中,α-螺旋占16.25%,β-折叠片占38.13%,无规则卷曲占45.63%。
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关键词
海南坡鹿
MD2
克隆
生物信息学分析
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职称材料
转基因表达的时空调控
2
作者
杜丽
孟庆文
+1 位作者
满处日嘎
王凤阳
《动物医学进展》
CSCD
北大核心
2010年第10期102-105,共4页
建立转基因表达的时空调控系统,对于分析基因在组织或发育阶段的特异表达,以及建立研究外源基因表达、调控的动物模型等方面,具有极其重要的应用价值。论文综述了近年来基于四环素(tetracy-cline,Tet)的调控系统,基于酵母转录激活蛋白,...
建立转基因表达的时空调控系统,对于分析基因在组织或发育阶段的特异表达,以及建立研究外源基因表达、调控的动物模型等方面,具有极其重要的应用价值。论文综述了近年来基于四环素(tetracy-cline,Tet)的调控系统,基于酵母转录激活蛋白,小鼠胚胎干细胞(embryonic stem cells,ESCs)和RNA干扰(RNA interference,RNAi)等转基因表达的时空调控技术研究进展。
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关键词
转基因
表达
时空调控
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职称材料
水牛TLR2cDNA的克隆与生物信息学分析
被引量：
4
3
作者
张晓茹
匡文华
+8 位作者
成鹰
杜丽
张冬琳
郝永昌
雷明
刘涛
焦寒伟
王凤阳
祁超
《动物医学进展》
CSCD
北大核心
2011年第11期35-41,共7页
本研究通过RT-PCR分段扩增得到水牛Toll样受体2(TLR2)cDNA序列,并利用亚克隆重叠区进行全长序列拼接。将拼接产物与pMD20-T载体连接,重组质粒经PCR酶切鉴定后测序,并进行生物信息学分析。结果表明,克隆得到的序列全长2 455bp,含有一个...
本研究通过RT-PCR分段扩增得到水牛Toll样受体2(TLR2)cDNA序列,并利用亚克隆重叠区进行全长序列拼接。将拼接产物与pMD20-T载体连接,重组质粒经PCR酶切鉴定后测序,并进行生物信息学分析。结果表明,克隆得到的序列全长2 455bp,含有一个大小为2 355bp的开放阅读框,共编码784个氨基酸,分子质量为90.2ku,理论等电点为6.92;TLR2ORF序列与GenBank上登载的水牛核苷酸序列同源性为99.53%,与黄牛、马、人、黑猩猩和狗的核苷酸序列同源性分别为97.88%、84.94%、83.12%、82.95%和82.74%,具有很高的相似性;该蛋白是一个跨膜蛋白,存在LRR、LRR-TYP、LRRCT及TIR结构域,与Toll样受体家族成员的共同结构相一致。水牛TLR2基因的成功克隆及序列分析和结构预测为进一步研究其生物学功能奠定了基础。
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关键词
TOLL样受体2
水牛
分子克隆
生物信息学分析
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职称材料
题名
海南坡鹿MD2 cDNA的克隆及其生物信息学分析
1
作者
杜丽
谢少林
成鹰
张晓茹
匡文华
焦寒伟
张冬琳
郝永昌
雷明
刘涛
王凤阳
机构
海南大学农学院
海南省
热带
动物
繁育与
疫病
研究
重点
实验室
(
筹
)
海口市
动物
基因
工程
重点
实验室
出处
《热带生物学报》
2011年第1期1-5,共5页
基金
国家自然科学基金资助项目(30560021)
文摘
以海南坡鹿外周血白细胞总RNA为模板,利用RT-PCR技术,获得海南坡鹿MD2全长cDNA,并对其进行较系统的生物信息学分析,内容包括序列特征分析、同源性分析、编码蛋白质理化性质及结构预测。结果表明:海南坡鹿MD2的CDS序列长度为486 bp,编码160个氨基酸,与黄牛、人、欧洲兔、褐家鼠的核苷酸序列同源性分别为98.55%,77.43%,78.47%和74.74%。该基因编码的蛋白质相对分子质量约为19×103,理论等电点为8.18。对编码蛋白的分子结构预测发现,该蛋白为非跨膜蛋白,其二级结构中,α-螺旋占16.25%,β-折叠片占38.13%,无规则卷曲占45.63%。
关键词
海南坡鹿
MD2
克隆
生物信息学分析
Keywords
Cervus eldi hainanus
MD2
cloning
bioinformatics analysis
分类号
Q786 [生物学—分子生物学]
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职称材料
题名
转基因表达的时空调控
2
作者
杜丽
孟庆文
满处日嘎
王凤阳
机构
海南大学农学院
海南省
热带
动物
繁育与
疫病
研究
重点
实验室
(
筹
)
海口市
动物
基因
工程
重点
实验室
中国农业科
学院
哈尔滨兽医
研究
所兽医生物技术国家
重点
实验室
出处
《动物医学进展》
CSCD
北大核心
2010年第10期102-105,共4页
基金
国家转基因生物新品种培育重大科技项目(2009ZX08007-009B)
文摘
建立转基因表达的时空调控系统,对于分析基因在组织或发育阶段的特异表达,以及建立研究外源基因表达、调控的动物模型等方面,具有极其重要的应用价值。论文综述了近年来基于四环素(tetracy-cline,Tet)的调控系统,基于酵母转录激活蛋白,小鼠胚胎干细胞(embryonic stem cells,ESCs)和RNA干扰(RNA interference,RNAi)等转基因表达的时空调控技术研究进展。
关键词
转基因
表达
时空调控
Keywords
transgene
expression
regulation in a temporal and spatial manner
分类号
S814.8 [农业科学—畜牧学]
S857.2 [农业科学—临床兽医学]
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职称材料
题名
水牛TLR2cDNA的克隆与生物信息学分析
被引量：
4
3
作者
张晓茹
匡文华
成鹰
杜丽
张冬琳
郝永昌
雷明
刘涛
焦寒伟
王凤阳
祁超
机构
海南大学农学院
海南省
热带
动物
繁育与
疫病
研究
重点
实验室
(
筹
)
海口市
动物
基因
工程
重点
实验室
华中师范
大学
生命科学
学院
出处
《动物医学进展》
CSCD
北大核心
2011年第11期35-41,共7页
基金
国家转基因生物新品种培育重大专项基金(2009ZX08007-009B)
文摘
本研究通过RT-PCR分段扩增得到水牛Toll样受体2(TLR2)cDNA序列,并利用亚克隆重叠区进行全长序列拼接。将拼接产物与pMD20-T载体连接,重组质粒经PCR酶切鉴定后测序,并进行生物信息学分析。结果表明,克隆得到的序列全长2 455bp,含有一个大小为2 355bp的开放阅读框,共编码784个氨基酸,分子质量为90.2ku,理论等电点为6.92;TLR2ORF序列与GenBank上登载的水牛核苷酸序列同源性为99.53%,与黄牛、马、人、黑猩猩和狗的核苷酸序列同源性分别为97.88%、84.94%、83.12%、82.95%和82.74%,具有很高的相似性;该蛋白是一个跨膜蛋白,存在LRR、LRR-TYP、LRRCT及TIR结构域,与Toll样受体家族成员的共同结构相一致。水牛TLR2基因的成功克隆及序列分析和结构预测为进一步研究其生物学功能奠定了基础。
关键词
TOLL样受体2
水牛
分子克隆
生物信息学分析
Keywords
TLR2
buffalo
molecular cloning
bioinformatics analysis
分类号
S852.4 [农业科学—基础兽医学]
S858.23 [农业科学—临床兽医学]
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职称材料
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
海南坡鹿MD2 cDNA的克隆及其生物信息学分析
杜丽
谢少林
成鹰
张晓茹
匡文华
焦寒伟
张冬琳
郝永昌
雷明
刘涛
王凤阳
《热带生物学报》
2011
0
在线阅读
下载PDF
职称材料
2
转基因表达的时空调控
杜丽
孟庆文
满处日嘎
王凤阳
《动物医学进展》
CSCD
北大核心
2010
0
在线阅读
下载PDF
职称材料
3
水牛TLR2cDNA的克隆与生物信息学分析
张晓茹
匡文华
成鹰
杜丽
张冬琳
郝永昌
雷明
刘涛
焦寒伟
王凤阳
祁超
《动物医学进展》
CSCD
北大核心
2011
4
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职称材料
已选择
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