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细菌特征分析的革兰氏阴阳性判别算法 被引量:3
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作者 袁健 赵桦 +1 位作者 张明 张劲松 《小型微型计算机系统》 CSCD 北大核心 2021年第4期678-684,共7页
自然界中细菌无处不在,细菌的革兰氏阳性和阴性的有效分类对于临床治疗具有重要意义.现有的细菌的革兰氏阴阳性分类主要依赖于革兰氏染色法.这种方法借助细菌细胞壁结构的不同引起的染色性的差异来进行分类,然而涂片的厚薄和脱色时间的... 自然界中细菌无处不在,细菌的革兰氏阳性和阴性的有效分类对于临床治疗具有重要意义.现有的细菌的革兰氏阴阳性分类主要依赖于革兰氏染色法.这种方法借助细菌细胞壁结构的不同引起的染色性的差异来进行分类,然而涂片的厚薄和脱色时间的掌握制约着革兰氏染色法的准确性,并且实验需要花费一定时间.本文提出一种用计算机智能分析的细菌革兰氏阴阳性判别方法—基于蛋白质序列特征分析的细菌革兰氏阴阳性判别算法GCBPS.该算法首先挖掘出闭合邻接序列模式(FCloConSP)集合并对大量已知阴阳性的细菌蛋白质序列特征进行提取,然后先利用赋参的余弦相似度距离计算方法来衡量待测细菌蛋白质序列与阳性细菌特征集之间的距离来初步判别是否为阳性,再通过去假阴性等处理后得到最终的细菌革兰氏阴阳性判别结果.该算法已在标注的1591条革兰氏阴性菌以及576条革兰阳性菌的标准数据集上进行评估,实验结果表明,判别的平均正确率F1值可达到95.4%. 展开更多
关键词 革兰氏阴阳性判别 蛋白质序列分析 闭合序列模式
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食物防治抑郁症的研究现状及趋势分析 被引量:6
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作者 高标 蔡梦宇 +5 位作者 屈易萃 张银银 卢宏涛 李红霞 汤雨潇 沈慧 《食品与生物技术学报》 CAS CSCD 北大核心 2022年第8期53-64,共12页
为了了解食物与抑郁症关系的研究现况,作者确定检索词优化后用于Web of Science数据库Topic检索。在线分析文献一般特征,CiteSpace软件分析网络聚类共现特征,描述性分析关键文献。2020年文献大幅增长;发表最多的期刊为食品类,国家为美... 为了了解食物与抑郁症关系的研究现况,作者确定检索词优化后用于Web of Science数据库Topic检索。在线分析文献一般特征,CiteSpace软件分析网络聚类共现特征,描述性分析关键文献。2020年文献大幅增长;发表最多的期刊为食品类,国家为美国、英国、澳大利亚、加拿大和中国,学科以精神病学、营养与食品学为主。前沿关键词包括food addiction、gut microbiota、food insecurity等,不同引文聚类之间有此消彼长现象。抑郁症风险因素包括炎症饮食、进食障碍、超重、代谢综合征和COVID-19等,压倒性结论为健康饮食对抑郁症有正面影响。发达国家在本领域领先,创伤性大事件推动了研究进展。研究前沿为食物成瘾、食物不安全和肠菌。研究范式从狭窄视角向宏观转移,饮食有望成为重要的抑郁症干预措施。 展开更多
关键词 食物 抑郁 现况 文本分析 计量分析 系统分析
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肠道微生物与心血管疾病研究进展 被引量:1
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作者 高标 王施(综述) +1 位作者 李红霞 沈慧(审校) 《医学研究生学报》 北大核心 2021年第9期979-984,共6页
对肠道微生物和心血管疾病相关的文献进行计量聚类共现分析和系统性分析,概述研究现况。相关研究10多年前涌现,近年激增且趋势不减。TMO和SFCAs对心血管疾病的重要性远超以往的认识,益生菌和微生物生态治疗也呼之欲出。代谢综合征(肥胖... 对肠道微生物和心血管疾病相关的文献进行计量聚类共现分析和系统性分析,概述研究现况。相关研究10多年前涌现,近年激增且趋势不减。TMO和SFCAs对心血管疾病的重要性远超以往的认识,益生菌和微生物生态治疗也呼之欲出。代谢综合征(肥胖、糖尿病)和高血压、动脉粥样硬化等心血管疾病的发生与肠菌关系密切,机制和影响途径日渐清晰。深入且多方面理解肠道微生物和心血管疾病的关系,对防治和康复均有重要意义,但目前厘清两者之间确切的因果关系尚需更多、更细致的研究。 展开更多
关键词 肠道微生物 心血管疾病 现况
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