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M2型巨噬细胞标志物CD163与结直肠癌预后的关系 被引量:4
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作者 马俊 黄晓培 +1 位作者 常文军 张卫 《第二军医大学学报》 CAS CSCD 北大核心 2018年第3期252-257,共6页
目的以CD163为标志物探讨人结直肠癌组织中M2型巨噬细胞与结直肠癌预后的关系。方法收集海军军医大学(第二军医大学)长海医院肛肠外科于2010年1月至2011年12月初次接受外科手术治疗的648例结直肠癌患者的临床资料及其术后肿瘤组织石蜡标... 目的以CD163为标志物探讨人结直肠癌组织中M2型巨噬细胞与结直肠癌预后的关系。方法收集海军军医大学(第二军医大学)长海医院肛肠外科于2010年1月至2011年12月初次接受外科手术治疗的648例结直肠癌患者的临床资料及其术后肿瘤组织石蜡标本,患者诊断均经术后病理证实。对照组分别为上述病例中38例患者的癌旁组织,以及37例痔上黏膜环切钉合术(PPH)术后正常直肠黏膜组织和33例内镜治疗后的结直肠腺瘤组织。所有标本制作成组织芯片,用免疫组化法检测CD163表达水平,分析不同CD163表达水平与结直肠癌临床病理参数和预后的关系。结果 CD163的表达水平与肿瘤分化程度、血清糖类抗原19-9(CA19-9)、肿瘤复发转移相关(P均<0.05)。生存分析发现CD163高表达组较低表达组无病生存率和总生存率低,且预后差(P<0.001)。Cox多因素分析结果显示,血清癌胚抗原(CEA)、CD163表达水平是结直肠癌预后的独立影响因素(P均<0.05)。结论 M2型巨噬细胞标志物CD163对结直肠癌预后有较好参考价值。 展开更多
关键词 结直肠癌 CD163 肿瘤相关巨噬细胞 M2型巨噬细胞
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染色质开放状态对结肠癌相关功能通路影响的生物信息学分析 被引量:1
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作者 康争春 闫飞虎 +3 位作者 王振 赵子夜 于恩达 邢俊杰 《第二军医大学学报》 CAS CSCD 北大核心 2021年第7期762-769,共8页
目的利用癌症基因组图谱(TCGA)数据库的染色质开放性高通量测序(ATAC-seq)数据和转录组测序(RNA-seq)数据,探索染色质开放状态对结肠癌相关功能通路的影响。方法从TCGA数据库下载结肠癌ATAC-seq数据和RNA-seq数据,使用R 3.5.3软件对ATAC... 目的利用癌症基因组图谱(TCGA)数据库的染色质开放性高通量测序(ATAC-seq)数据和转录组测序(RNA-seq)数据,探索染色质开放状态对结肠癌相关功能通路的影响。方法从TCGA数据库下载结肠癌ATAC-seq数据和RNA-seq数据,使用R 3.5.3软件对ATAC-seq数据进行质量控制。对全部样本ATAC-seq数据峰值(peaks)进行基因注释,对所注释基因进行基因本体(GO)功能富集分析和京都基因与基因组百科全书(KEGG)通路富集分析。选择结肠癌关键基因肿瘤抑制基因APC(APC)、Kirsten大鼠肉瘤病毒癌基因(KRAS)、v-raf小鼠肉瘤病毒癌基因同源物B1(BRAF),对3个基因的启动子区ATAC-seq数据peaks与RNA-seq的每千个碱基的转录每百万映射读取的片段数(FPKM)进行Pearson相关性分析。对TNM分期Ⅲ+Ⅳ期和Ⅰ+Ⅱ期的组织样本进行差异ATAC-seq数据peaks分析,并对上调和下调peaks注释基因进行KEGG通路富集分析。结果结肠癌ATAC-seq数据peaks在染色体分布均匀,大多数分布于启动子区(距离转录起始位点≤1 kb、>1~2 kb、>2~3 kb者分别占30.17%、5.42%、3.88%)和远端基因间区(26.17%),符合染色质开放区2种主要类型的分布。GO功能和KEGG通路富集分析结果显示,结肠癌ATAC-seq数据peaks注释基因显著富集于癌症相关功能和通路,如Wnt信号通路的细胞间信号转导、表皮生长因子受体(ErbB)信号通路等。结肠癌关键基因APC、KRAS、BRAF启动子区ATAC-seq数据peaks与其RNA-seq的FPKM呈正相关。TNM分期Ⅲ+Ⅳ期相对Ⅰ+Ⅱ期患者上调peaks注释基因显著富集于ErbB信号通路、Wnt信号通路、PI3K-Akt信号通路、P53信号通路等增殖、侵袭和转移相关信号通路,下调peaks注释基因显著富集于T细胞受体信号通路、B细胞受体信号通路、细胞黏附分子信号通路等免疫识别相关信号通路。结论染色质开放状态对结肠癌相关功能通路调控起着重要作用。 展开更多
关键词 结肠肿瘤 癌症基因组图谱 高通量测序 染色质开放性
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卵巢癌转移体细胞突变及其相关功能通路分析 被引量:2
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作者 贺海威 康争春 徐明娟 《第二军医大学学报》 CAS CSCD 北大核心 2019年第11期1176-1182,共7页
目的借助癌症体细胞突变目录(COSMIC)数据库中原发性卵巢癌和转移性卵巢癌两类癌组织的全外显子测序数据,筛选转移性癌相对于原发性癌突变率差异具有统计学意义的体细胞基因群,并对其影响的功能和信号通路进行分析。方法从COSMIC数据库... 目的借助癌症体细胞突变目录(COSMIC)数据库中原发性卵巢癌和转移性卵巢癌两类癌组织的全外显子测序数据,筛选转移性癌相对于原发性癌突变率差异具有统计学意义的体细胞基因群,并对其影响的功能和信号通路进行分析。方法从COSMIC数据库下载全部肿瘤的全外显子测序数据,从中提取全部卵巢癌全外显子测序数据,在R 3.5.3环境下,对每个基因突变在原发性卵巢癌和转移性卵巢癌两类样本中的突变率行χ2检验或Fisher确切概率法分析,寻找突变率差异具有统计学意义的基因群,并进一步将差异突变基因群进行基因本体(GO)功能及京都基因与基因组百科全书(KEGG)通路富集分析,探寻其显著富集的GO功能和KEGG通路。结果对比原发性卵巢癌与转移性卵巢癌两类组织样本共发现520个突变率差异具有统计学意义的体细胞突变基因,包括跨膜丝氨酸蛋白酶13(TMPRSS13)、高尔基蛋白转运抑制剂A抗性因子1(GBF1)、Fos样抗体2(FOSL2)、主导控制样蛋白3(MAML3)等。突变基因群GO功能富集分析发现显著富集的GO功能包括突触前组织、树突发育、通过质膜黏附分子的细胞黏附、肌动蛋白结合等,突变基因群KEGG通路富集分析发现显著富集通路包括肌动蛋白细胞骨架的调节、三磷酸腺苷结合盒运载体等。结论探寻原发性卵巢癌与转移性卵巢癌之间差异体细胞突变基因群及其相关功能通路可为深入揭示卵巢癌的转移调控机制提供线索,显著突变基因群可能成为卵巢癌转移诊治的生物标志物。 展开更多
关键词 卵巢肿瘤 体细胞突变基因 卵巢转移 基因调控网络
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硫酸羟氯喹联合阿奇霉素治疗难治性普通型新型冠状病毒肺炎的临床疗效及安全性
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作者 吴梅红 王斌 +4 位作者 刘鹏 盛华 张锚 李强 蔡晨 《第二军医大学学报》 CAS CSCD 北大核心 2020年第6期612-615,共4页
目的初步评价硫酸羟氯喹联合阿奇霉素治疗难治性普通型新型冠状病毒肺炎(COVID-19)患者的临床疗效及安全性。方法回顾性收集2020年3月22日至25日湖北省妇幼保健院光谷院区治疗的11例难治性普通型COVID-19患者资料。联合治疗方案:硫酸羟... 目的初步评价硫酸羟氯喹联合阿奇霉素治疗难治性普通型新型冠状病毒肺炎(COVID-19)患者的临床疗效及安全性。方法回顾性收集2020年3月22日至25日湖北省妇幼保健院光谷院区治疗的11例难治性普通型COVID-19患者资料。联合治疗方案:硫酸羟氯喹200 mg每天3次口服(第1~7天);阿奇霉素500 mg每天1次口服(第1天),250 mg每天1次口服(第2~4天)。在给药后第4~10天连续复查咽拭子严重急性呼吸综合征冠状病毒2(SARS-CoV-2)核酸,给药前3 d内及给药后第8天进行血常规等实验室检查。结果11例COVID-19患者均为普通型,其中7例为SARS-CoV-2核酸检测持续阳性患者,4例为核酸检测复阳患者。联合给药前11例患者的平均病程为50.2 d。治疗过程顺利,给药后第4天咽拭子SARS-CoV-2核酸转阴0例,第5天转阴2例,第6天转阴2例,第7天转阴2例,第8天转阴1例,第9天转阴1例。11例患者均未进展为重型或危重型,未观察到明显不良反应。结论硫酸羟氯喹联合阿奇霉素方案对于接受多种治疗失败、SARS-CoV-2核酸检测持续阳性的难治性普通型COVID-19患者安全有效。 展开更多
关键词 新型冠状病毒肺炎 普通型 难治性 羟氯喹 阿奇霉素 转阴率
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粒状头样蛋白2下调诱导上皮间质转化促进肿瘤细胞对吉非替尼耐药
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作者 洪永刚 郝立强 +1 位作者 毕峰瑞 颜宏利 《第二军医大学学报》 CAS CSCD 北大核心 2018年第10期1102-1108,共7页
目的探讨粒状头样蛋白2(GRHL2)在肿瘤靶向治疗药物表皮生长因子受体酪氨酸激酶抑制剂(EGFR-TKI)吉非替尼获得性耐药中的作用和可能机制。方法利用吉非替尼浓度逐步递增的体外诱导方法培养人结直肠癌细胞DiFi和人肺腺癌细胞HCC4006,获得... 目的探讨粒状头样蛋白2(GRHL2)在肿瘤靶向治疗药物表皮生长因子受体酪氨酸激酶抑制剂(EGFR-TKI)吉非替尼获得性耐药中的作用和可能机制。方法利用吉非替尼浓度逐步递增的体外诱导方法培养人结直肠癌细胞DiFi和人肺腺癌细胞HCC4006,获得吉非替尼耐药细胞株。通过RNA测序方法筛选在耐药细胞株与其亲代细胞中差异表达的基因并进行实时荧光定量PCR验证。使用pcDNA3.1-GRHL2质粒转染耐药细胞株使GRHL2过表达,用CCK-8法检测细胞对吉非替尼的敏感性。采用蛋白质印迹法检测耐药细胞株中上皮标志物E-cadherin和间质标志物Vimentin的表达变化,并通过CellMinerTM数据库分析60株人肿瘤细胞系中GRHL2表达与E-cadherin和Vimentin表达的关系。结果成功获得DiFi和HCC4006的耐药细胞株。通过RNA测序和实时荧光定量PCR验证发现GRHL2在耐药细胞株中表达下调,而在耐药细胞株中过表达GRHL2后细胞恢复了对吉非替尼的敏感性。蛋白质印迹分析表明耐药细胞株中上皮标志物E-cadherin表达下调,而间质标志物Vimentin表达上调;CellMinerTM数据库分析表明GRHL2的表达与E-cadherin/Vimentin比值高度一致。结论 GRHL2表达下调通过诱导上皮间质转化介导肿瘤细胞对吉非替尼的耐药。 展开更多
关键词 靶向治疗 继发性耐药 吉非替尼 粒状头样蛋白2 上皮间质转化
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