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基于癌症基因组图谱肺鳞状细胞癌免疫细胞浸润图景及预后分析
被引量：
3
1
作者
周超
施晓倩
+3 位作者
洪涵涵
尹基忠
王昱升
李兵
《第二军医大学学报》
CAS
CSCD
北大核心
2021年第4期391-398,共8页
目的探讨肺鳞状细胞癌组织免疫细胞浸润全景,构建预后风险评估模型,分析并评估患者的预后。方法利用癌症基因组图谱(TCGA)数据库肺鳞状细胞癌全转录组数据,通过R 4.0.3软件利用CIBERSORT反卷积算法计算不同免疫细胞浸润相对含量,用单因...
目的探讨肺鳞状细胞癌组织免疫细胞浸润全景,构建预后风险评估模型,分析并评估患者的预后。方法利用癌症基因组图谱(TCGA)数据库肺鳞状细胞癌全转录组数据,通过R 4.0.3软件利用CIBERSORT反卷积算法计算不同免疫细胞浸润相对含量,用单因素和多因素Cox回归分析建立预后风险评估模型,并用ROC曲线评估模型效能,结合临床变量绘制预测患者3、5、10年生存率列线图。结果共涉及22种免疫细胞类型。正常组织中的8种免疫细胞亚群(初始B细胞、浆细胞、激活记忆CD4 T细胞、滤泡辅助性T细胞、调节性T细胞、M0型巨噬细胞、M1型巨噬细胞、休眠树突状细胞)浸润相对含量均低于肺鳞状细胞癌组织(P<0.05或P<0.01),正常组织中的另外8种免疫细胞亚群[休眠记忆CD4 T细胞、休眠自然杀伤(NK)细胞、单核细胞、M2型巨噬细胞、激活树突状细胞、休眠肥大细胞、嗜酸性粒细胞、中性粒细胞]浸润相对含量均高于肺鳞状细胞癌组织(P<0.01或P<0.05),其余免疫细胞亚群(记忆性B细胞、CD8 T细胞、初始CD4 T细胞、γ/δT细胞,激活NK细胞、激活肥大细胞)在两组间差异均无统计学意义(P均>0.05)。初始CD4 T细胞、休眠记忆CD4 T细胞对肺鳞状细胞癌患者是危险因素(HR>1),而激活记忆CD4 T细胞、滤泡辅助性T细胞、休眠树突状细胞则是保护因素(HR<1)。激活记忆CD4 T细胞、休眠树突状细胞浸润相对含量高的肺鳞状细胞癌患者预后较相对含量低的患者好(P<0.05)。用激活记忆CD4 T细胞、滤泡辅助性T细胞、休眠树突状细胞构建的肺鳞状细胞癌患者预后风险评估模型的效能良好,ROC曲线的AUC为0.678。结论休眠树突状细胞、激活记忆CD4 T细胞与肺鳞状细胞癌的发生、预后有关,并且可以作为独立的预后因子。预后相关免疫细胞亚群构建的预后风险评估模型效能良好。
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关键词
肺肿瘤
鳞状细胞癌
免疫细胞
预后
癌症基因组图谱
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职称材料
题名
基于癌症基因组图谱肺鳞状细胞癌免疫细胞浸润图景及预后分析
被引量：
3
1
作者
周超
施晓倩
洪涵涵
尹基忠
王昱升
李兵
机构
海军
军医大学
(
第二军医大学
)
长征医院
呼吸
与危重症
医学科
同济
大学
附属上海市第四人民
医院
呼吸
与危重症
医学科
出处
《第二军医大学学报》
CAS
CSCD
北大核心
2021年第4期391-398,共8页
文摘
目的探讨肺鳞状细胞癌组织免疫细胞浸润全景,构建预后风险评估模型,分析并评估患者的预后。方法利用癌症基因组图谱(TCGA)数据库肺鳞状细胞癌全转录组数据,通过R 4.0.3软件利用CIBERSORT反卷积算法计算不同免疫细胞浸润相对含量,用单因素和多因素Cox回归分析建立预后风险评估模型,并用ROC曲线评估模型效能,结合临床变量绘制预测患者3、5、10年生存率列线图。结果共涉及22种免疫细胞类型。正常组织中的8种免疫细胞亚群(初始B细胞、浆细胞、激活记忆CD4 T细胞、滤泡辅助性T细胞、调节性T细胞、M0型巨噬细胞、M1型巨噬细胞、休眠树突状细胞)浸润相对含量均低于肺鳞状细胞癌组织(P<0.05或P<0.01),正常组织中的另外8种免疫细胞亚群[休眠记忆CD4 T细胞、休眠自然杀伤(NK)细胞、单核细胞、M2型巨噬细胞、激活树突状细胞、休眠肥大细胞、嗜酸性粒细胞、中性粒细胞]浸润相对含量均高于肺鳞状细胞癌组织(P<0.01或P<0.05),其余免疫细胞亚群(记忆性B细胞、CD8 T细胞、初始CD4 T细胞、γ/δT细胞,激活NK细胞、激活肥大细胞)在两组间差异均无统计学意义(P均>0.05)。初始CD4 T细胞、休眠记忆CD4 T细胞对肺鳞状细胞癌患者是危险因素(HR>1),而激活记忆CD4 T细胞、滤泡辅助性T细胞、休眠树突状细胞则是保护因素(HR<1)。激活记忆CD4 T细胞、休眠树突状细胞浸润相对含量高的肺鳞状细胞癌患者预后较相对含量低的患者好(P<0.05)。用激活记忆CD4 T细胞、滤泡辅助性T细胞、休眠树突状细胞构建的肺鳞状细胞癌患者预后风险评估模型的效能良好,ROC曲线的AUC为0.678。结论休眠树突状细胞、激活记忆CD4 T细胞与肺鳞状细胞癌的发生、预后有关,并且可以作为独立的预后因子。预后相关免疫细胞亚群构建的预后风险评估模型效能良好。
关键词
肺肿瘤
鳞状细胞癌
免疫细胞
预后
癌症基因组图谱
Keywords
lung neoplasms
squamous cell carcinoma
immune cells
prognosis
The Cancer Genome Atlas
分类号
R734.2 [医药卫生—肿瘤]
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题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
基于癌症基因组图谱肺鳞状细胞癌免疫细胞浸润图景及预后分析
周超
施晓倩
洪涵涵
尹基忠
王昱升
李兵
《第二军医大学学报》
CAS
CSCD
北大核心
2021
3
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