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应用三代测序技术鉴定NGS方法检出的新等位基因HLA-B*54:01:11
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作者 陈男英 何亿镇 +3 位作者 皮雯雯 李奇 董丽娜 章伟 《中国实验血液学杂志》 北大核心 2025年第2期565-568,共4页
目的:区分人类白细胞抗原(HLA)模棱两可的基因分型结果,鉴定HLA-B新等位基因,并分析其核苷酸序列。方法:利用基于Ion Torrent S5平台的二代测序技术(NGS)对2022年2076例浙江省脐带血库样本进行HLA入库分型检测,发现1例含碱基突变的模棱... 目的:区分人类白细胞抗原(HLA)模棱两可的基因分型结果,鉴定HLA-B新等位基因,并分析其核苷酸序列。方法:利用基于Ion Torrent S5平台的二代测序技术(NGS)对2022年2076例浙江省脐带血库样本进行HLA入库分型检测,发现1例含碱基突变的模棱两可组合样本,选择基于纳米孔技术平台的三代测序技术(TGS)对其进行鉴定。结果:HLA-B位点经NGS检测分型结果显示为HLA-B*46:18,54:06/46:01,54:XX(含碱基突变)组合,经纳米孔测序鉴定结果为HLA-B*46:01,54:XX(含碱基突变)。HLA-B*54:XX与同源性最高的HLA-B*54:01:01:01相比,第6外显子1014位碱基T>C,并未引起任何氨基酸的改变。新等位基因序列已递交给GenBank数据库(OP853532)。结论:应用纳米孔测序技术区分了1例NGS方法产生的模棱两可结果,并成功鉴定了HLA-B新等位基因。该新等位基因被世界卫生组织HLA因子命名委员会正式命名为HLA-B*54:01:11。 展开更多
关键词 HLA-B 新等位基因 二代测序 纳米孔测序 碱基突变
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建立基于qPCR技术的红细胞Diego、MNS、Kell血型基因分型方法及初步应用
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作者 张兵 徐罡 +2 位作者 胡文健 洪小珍 许先国 《中国实验血液学杂志》 北大核心 2025年第5期1429-1434,共6页
目的:建立基于实时荧光定量PCR(qPCR)技术的Diego、MNS、Kell血型基因分型方法,并初步应用于献血者稀有血型筛查。方法:利用血型血清学方法和基于测序分型的PCR-SBT法,制备包含各等位基因杂合子和纯合子的血型基因标准品。设计血型基因... 目的:建立基于实时荧光定量PCR(qPCR)技术的Diego、MNS、Kell血型基因分型方法,并初步应用于献血者稀有血型筛查。方法:利用血型血清学方法和基于测序分型的PCR-SBT法,制备包含各等位基因杂合子和纯合子的血型基因标准品。设计血型基因特异性扩增引物和杂交探针,摸索建立qPCR检测Diego、MNS、Kell血型基因型的方法。利用建立的qPCR法对186例献血者进行血型鉴定。结果:建立了基于qPCR技术鉴定Dia/Dib、S/s、K/k血型抗原的方法,基因标准品检测分型结果与血清型及PCR-SBT检测的基因型完全一致。采用qPCR法检测186份献血者样本,发现11例DI A/B杂合型,19例GYPB S/s杂合型,其余均为DI B/B、GYPB s/s、KEL 02/02纯合型,未发现DI A/A、GYPB S/S、KEL 01.01/01.01稀有血型。结论:建立的qPCR方法适用于Diego、MNS、Kell血型基因分型,可用于献血者批量筛查和稀有血型建库。 展开更多
关键词 实时荧光定量PCR Diego血型 MNS血型 Kell血型 基因分型
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人血小板表面CD36糖蛋白检测方法的建立及初步应用 被引量：6
3
作者 刘瑛 许先国 +6 位作者 蓝小飞 马开荣 陈舒 洪小珍 何吉 朱发明 吕杭军 《中国实验血液学杂志》 CAS CSCD 北大核心 2013年第4期1042-1045,共4页
个体血小板表面CD36抗原缺乏在随机输注时有产生抗-CD36免疫反应的风险,是血小板输注无效的原因之一。本研究应用流式细胞术检测杭州地区单采血小板供者的血小板表面CD36抗原表达情况,并分析个体血小板上CD36缺失表型的频率。留取献血... 个体血小板表面CD36抗原缺乏在随机输注时有产生抗-CD36免疫反应的风险,是血小板输注无效的原因之一。本研究应用流式细胞术检测杭州地区单采血小板供者的血小板表面CD36抗原表达情况,并分析个体血小板上CD36缺失表型的频率。留取献血者新鲜抗凝血样,经离心获取富血小板血浆,洗涤并调整血小板计数至1×106。采用CD36-FITC、CD41-PE单克隆抗体和血小板孵育反应,然后用流式细胞仪检测和分析血小板表面糖蛋白CD36抗原表达情况。对于血小板表面CD36抗原阴性的标本,进一步筛查其单核细胞表面CD36的表达情况。结果表明:192例无偿献血者筛查出7例血小板表面CD36抗原阴性,CD36缺失型频率为3.6%,均为Ⅱ型缺失。人群中个体CD36抗原表达强度存在差异,参照CD36几何平均荧光强度数值大小,59例为低表达,126例为高表达。结论:人群中存在CD36Ⅱ型缺失表型,这些数据将为研究CD36抗原分布提供参考,有助于解决血小板输注无效问题。 展开更多
关键词 血小板糖蛋白IV CD36缺失 血小板
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