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翘嘴鲌生长激素(GH)基因与侧翼区的克隆及分析
被引量：
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作者
刘士力
贾永义
+5 位作者
蒋文枰
迟美丽
程顺
赵金良
顾志敏
傅建军
《浙江农业学报》
CSCD
北大核心
2017年第8期1281-1289,共9页
采用保守引物进行PCR成功扩增了编码翘嘴鲌生长激素的基因,该基因全长5 966 bp,其中转录单元长1 648 bp,由5个外显子和4个内含子组成。5'端和3'端侧翼序列长度分别为2 282 bp和2 036 bp,分别包含(AAT)8和(TTC)5T(TAA)8的微卫星...
采用保守引物进行PCR成功扩增了编码翘嘴鲌生长激素的基因,该基因全长5 966 bp,其中转录单元长1 648 bp,由5个外显子和4个内含子组成。5'端和3'端侧翼序列长度分别为2 282 bp和2 036 bp,分别包含(AAT)8和(TTC)5T(TAA)8的微卫星序列。上游区域包含TATA框,还有一些重要的转录因子结合位点,如Pit-1、Pit-1a、CREB、AP1、GR、HNF-3、HNF-3B等转录因子。翘嘴鲌的5个外显子长度分别为64、140、117、162和255 bp。推测的阅读框为603 bp,编码由22个氨基酸的信号肽和178个氨基酸成熟肽组成的多肽。在这个多肽中发现了5个保守的半胱氨酸残基(Cys^(71)、Cys^(135)、Cys^(173)、Cys^(190)和Cys^(198))和2个可能的N-糖基化位点(145th和197th)。翘嘴鲌GH氨基酸序列与团头鲂完全相同,与草鱼只有一个氨基酸残基的差异,构建的鱼类进化树符合基本分类地位。翘嘴鲌生长激素基因4个内含子长度分别为229、103、565和103 bp。相对外显子来说,种间内含子变异较大,其中第三内含子变异最大。该结果为进一步研究翘嘴鲌GH基因的表达、功能及其转录调控特征奠定了分子基础。
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关键词
翘嘴鲌
生长激素基因
克隆
序列分析
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题名
翘嘴鲌生长激素(GH)基因与侧翼区的克隆及分析
被引量：
8
1
作者
刘士力
贾永义
蒋文枰
迟美丽
程顺
赵金良
顾志敏
傅建军
机构
浙江省淡水水产研究所农业部淡水渔业健康养殖重点实验室/浙江省淡水水产遗传育种重点实验室
上海海洋大学
水产
与生命学院
中国
水产
科学
研究
院
淡水
渔业
研究
中心
出处
《浙江农业学报》
CSCD
北大核心
2017年第8期1281-1289,共9页
基金
浙江省农业新品种选育重大科技专项(2012C12907-7,2016C02055-1)
文摘
采用保守引物进行PCR成功扩增了编码翘嘴鲌生长激素的基因,该基因全长5 966 bp,其中转录单元长1 648 bp,由5个外显子和4个内含子组成。5'端和3'端侧翼序列长度分别为2 282 bp和2 036 bp,分别包含(AAT)8和(TTC)5T(TAA)8的微卫星序列。上游区域包含TATA框,还有一些重要的转录因子结合位点,如Pit-1、Pit-1a、CREB、AP1、GR、HNF-3、HNF-3B等转录因子。翘嘴鲌的5个外显子长度分别为64、140、117、162和255 bp。推测的阅读框为603 bp,编码由22个氨基酸的信号肽和178个氨基酸成熟肽组成的多肽。在这个多肽中发现了5个保守的半胱氨酸残基(Cys^(71)、Cys^(135)、Cys^(173)、Cys^(190)和Cys^(198))和2个可能的N-糖基化位点(145th和197th)。翘嘴鲌GH氨基酸序列与团头鲂完全相同,与草鱼只有一个氨基酸残基的差异,构建的鱼类进化树符合基本分类地位。翘嘴鲌生长激素基因4个内含子长度分别为229、103、565和103 bp。相对外显子来说,种间内含子变异较大,其中第三内含子变异最大。该结果为进一步研究翘嘴鲌GH基因的表达、功能及其转录调控特征奠定了分子基础。
关键词
翘嘴鲌
生长激素基因
克隆
序列分析
Keywords
Culter alburnus
growth hormone gene
clone
sequence analysis
分类号
S96 [农业科学—水产养殖]
Q349.55 [生物学—遗传学]
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翘嘴鲌生长激素(GH)基因与侧翼区的克隆及分析
刘士力
贾永义
蒋文枰
迟美丽
程顺
赵金良
顾志敏
傅建军
《浙江农业学报》
CSCD
北大核心
2017
8
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