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水温和余氯耦合条件下泥蚶内脏团微生物群落组成动态
被引量：
1
1
作者
陈琳
胡高宇
+3 位作者
蔡逸龙
肖国强
蔡景波
张翔
《浙江农业科学》
2023年第6期1323-1331,共9页
为研究核电站温排水污染对泥蚶内脏团微生物群落组成的影响,通过室内模拟核电站温排水的余氯残留和温升效应进行了为期20 d的胁迫实验,比较分析了29℃下,游离和化合余氯胁迫组对泥蚶内脏团微生物组成的影响。结果显示,泥蚶内脏团中优势...
为研究核电站温排水污染对泥蚶内脏团微生物群落组成的影响,通过室内模拟核电站温排水的余氯残留和温升效应进行了为期20 d的胁迫实验,比较分析了29℃下,游离和化合余氯胁迫组对泥蚶内脏团微生物组成的影响。结果显示,泥蚶内脏团中优势微生物主要为变形菌门(Proteobacteria)、软壁菌门(Tenericutes)、拟杆菌门(Bacteroidetes)、放线菌门(Actinobacteria),占运算分类单元(operational taxonomic unit,OTU)总数64.71%以上。相较于对照组,游离余氯组和化合余氯组中黄杆菌科替代弧菌科成为优势菌。化合余氯组的平均OTU数显著低于对照组和游离余氯组(P<0.05),而对照组与游离余氯组无显著差异(P>0.05),同时化合余氯组特有OTU数量比对照组少43.3%。与对照组相比,化合余氯组的Ace和Chao指数分别显著降低了33.77%和29.67%,而Shannon指数和Simpson指数无显著性差异(P>0.05)。主坐标分析(principal co-ordinates analysis,PCoA)结果显示,短期的温排水胁迫未显著改变泥蚶内脏团微生物群落结构,仅扩大了群落间遗传差异。共现性网络分析显示,相较于对照组,游离余氯组关键种群增加了黄杆菌科(flavobacteriaceae)和微球菌科(Micrococcaceae),而化合余氯组微生物互作网络被明显削弱。研究结果表明,游离余氯和化合余氯与温升耦合胁迫均会对泥蚶内脏团菌群造成不利影响,其中游离余氯改变了优势种群组成,降低了原有优势种群丰度,而化合余氯大幅降低了菌群特有种多样性,并削弱了微生物种群之间的相互作用。长期来看,化合余氯较游离余氯对泥蚶内脏团菌群影响更大。本研究可为核电站温排水所造成的余氯污染对海洋生物体内微生物群落的影响研究提供参考,并且为生态风险评估提供科学依据。
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关键词
泥蚶
水温
余氯
内脏团微生物群落
高通量测序
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职称材料
泥蚶转录因子c-Myc与下游ATP结合盒转运蛋白基因ABCA3启动子的结合鉴定
2
作者
赵德风
陈然
+1 位作者
肖国强
滕爽爽
《浙江农业科学》
2023年第6期1317-1322,共6页
为了确定泥蚶转录因子c-Myc(Tgc-Myc)与下游ATP结合盒转运蛋白ABCA3(TgABCA3)基因启动子的结合关系。利用在线生物信息学网站预测以及凝胶电泳迁移(electrophoretic mobility shift assay,EMSA)和染色质免疫共沉淀(chromatin immunoprec...
为了确定泥蚶转录因子c-Myc(Tgc-Myc)与下游ATP结合盒转运蛋白ABCA3(TgABCA3)基因启动子的结合关系。利用在线生物信息学网站预测以及凝胶电泳迁移(electrophoretic mobility shift assay,EMSA)和染色质免疫共沉淀(chromatin immunoprecipitation assay,ChIP)技术,对Tgc-Myc与TgABCA3启动子的结合位点进行分析。结果显示,TgABCA3启动子上的E-box顺式作用元件位于-40~-35 bp,Tgc-Myc能够与该序列特异性结合。转录因子Tgc-Myc通过调控TgABCA3基因转录,从而参与泥蚶应对重金属Cd胁迫的响应机制。
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关键词
泥蚶
转录因子c-Myc
ATP结合盒转运蛋白
E-BOX
凝胶电泳迁移
染色质免疫共沉淀
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职称材料
题名
水温和余氯耦合条件下泥蚶内脏团微生物群落组成动态
被引量：
1
1
作者
陈琳
胡高宇
蔡逸龙
肖国强
蔡景波
张翔
机构
浙江省海洋水产养殖研究所、浙江省近岸水域生物资源开发与保护重点实验室、温州市海洋生物遗传育种重点实验室
浙江
海洋
大学
出处
《浙江农业科学》
2023年第6期1323-1331,共9页
基金
浙江省重点研发计划项目(2019C02045,2018C02039)
国家重点研发计划(2020YFD0900802)
国家现代农业产业技术体系(CARS-49)。
文摘
为研究核电站温排水污染对泥蚶内脏团微生物群落组成的影响,通过室内模拟核电站温排水的余氯残留和温升效应进行了为期20 d的胁迫实验,比较分析了29℃下,游离和化合余氯胁迫组对泥蚶内脏团微生物组成的影响。结果显示,泥蚶内脏团中优势微生物主要为变形菌门(Proteobacteria)、软壁菌门(Tenericutes)、拟杆菌门(Bacteroidetes)、放线菌门(Actinobacteria),占运算分类单元(operational taxonomic unit,OTU)总数64.71%以上。相较于对照组,游离余氯组和化合余氯组中黄杆菌科替代弧菌科成为优势菌。化合余氯组的平均OTU数显著低于对照组和游离余氯组(P<0.05),而对照组与游离余氯组无显著差异(P>0.05),同时化合余氯组特有OTU数量比对照组少43.3%。与对照组相比,化合余氯组的Ace和Chao指数分别显著降低了33.77%和29.67%,而Shannon指数和Simpson指数无显著性差异(P>0.05)。主坐标分析(principal co-ordinates analysis,PCoA)结果显示,短期的温排水胁迫未显著改变泥蚶内脏团微生物群落结构,仅扩大了群落间遗传差异。共现性网络分析显示,相较于对照组,游离余氯组关键种群增加了黄杆菌科(flavobacteriaceae)和微球菌科(Micrococcaceae),而化合余氯组微生物互作网络被明显削弱。研究结果表明,游离余氯和化合余氯与温升耦合胁迫均会对泥蚶内脏团菌群造成不利影响,其中游离余氯改变了优势种群组成,降低了原有优势种群丰度,而化合余氯大幅降低了菌群特有种多样性,并削弱了微生物种群之间的相互作用。长期来看,化合余氯较游离余氯对泥蚶内脏团菌群影响更大。本研究可为核电站温排水所造成的余氯污染对海洋生物体内微生物群落的影响研究提供参考,并且为生态风险评估提供科学依据。
关键词
泥蚶
水温
余氯
内脏团微生物群落
高通量测序
分类号
X171.5 [环境科学与工程—环境科学]
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职称材料
题名
泥蚶转录因子c-Myc与下游ATP结合盒转运蛋白基因ABCA3启动子的结合鉴定
2
作者
赵德风
陈然
肖国强
滕爽爽
机构
浙江省海洋水产养殖研究所、浙江省近岸水域生物资源开发与保护重点实验室、温州市海洋生物遗传育种重点实验室
浙江
海洋
大学
出处
《浙江农业科学》
2023年第6期1317-1322,共6页
基金
国家自然科学基金项目(31902358)
国家重点研发计划项目(2020YFD0900802,2018YFD0901405-2)
+1 种基金
财政部和农业农村部:国家现代农业产业技术体系(CARS-49)
温州市农业新品种选育协作组项目(2019ZX001-1)。
文摘
为了确定泥蚶转录因子c-Myc(Tgc-Myc)与下游ATP结合盒转运蛋白ABCA3(TgABCA3)基因启动子的结合关系。利用在线生物信息学网站预测以及凝胶电泳迁移(electrophoretic mobility shift assay,EMSA)和染色质免疫共沉淀(chromatin immunoprecipitation assay,ChIP)技术,对Tgc-Myc与TgABCA3启动子的结合位点进行分析。结果显示,TgABCA3启动子上的E-box顺式作用元件位于-40~-35 bp,Tgc-Myc能够与该序列特异性结合。转录因子Tgc-Myc通过调控TgABCA3基因转录,从而参与泥蚶应对重金属Cd胁迫的响应机制。
关键词
泥蚶
转录因子c-Myc
ATP结合盒转运蛋白
E-BOX
凝胶电泳迁移
染色质免疫共沉淀
分类号
S-03 [农业科学]
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职称材料
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
水温和余氯耦合条件下泥蚶内脏团微生物群落组成动态
陈琳
胡高宇
蔡逸龙
肖国强
蔡景波
张翔
《浙江农业科学》
2023
1
在线阅读
下载PDF
职称材料
2
泥蚶转录因子c-Myc与下游ATP结合盒转运蛋白基因ABCA3启动子的结合鉴定
赵德风
陈然
肖国强
滕爽爽
《浙江农业科学》
2023
0
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职称材料
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