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红掌2个SOC1基因的克隆、序列与表达分析
被引量:
6
1
作者
马广莹
朱开元
+4 位作者
史小华
邹清成
刘慧春
詹菁
田丹青
《浙江大学学报(农业与生命科学版)》
CAS
CSCD
北大核心
2017年第3期289-297,共9页
为了明确SOC1转录因子在红掌中的成员及作用机制,采用5'/3'末端快速扩增技术获得这2个SOC1基因的完整编码区,通过生物信息学软件分析这2个基因的相关信息,并结合荧光定量反转录-聚合酶链式反应验证这2个基因的表达模式。结果显...
为了明确SOC1转录因子在红掌中的成员及作用机制,采用5'/3'末端快速扩增技术获得这2个SOC1基因的完整编码区,通过生物信息学软件分析这2个基因的相关信息,并结合荧光定量反转录-聚合酶链式反应验证这2个基因的表达模式。结果显示:获得的2个基因核苷酸长度分别为651 bp和642 bp,命名为Aa SOC1-1和Aa SOC1-2;2个转录因子在二级结构上均有螺旋、折叠和转角,未发现其他结构。系统进化分析显示,二者与单子叶植物同类蛋白距离较近,与红掌的植物学分类地位一致。表达分析结果显示,2个基因均在营养器官和生殖器官中表达,但表达水平略有差异。研究认为,从红掌中克隆的2个SOC1转录因子可能定位于线粒体而非细胞核中,二者在序列组成和表达模式上既有保守性也存在一定的差异性,预示它们在功能上可能也存在一定的区别。
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关键词
红掌
SOC1基因
生物信息学
表达分析
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职称材料
题名
红掌2个SOC1基因的克隆、序列与表达分析
被引量:
6
1
作者
马广莹
朱开元
史小华
邹清成
刘慧春
詹菁
田丹青
机构
浙江省
农业科
学院
花卉研究开发中心
浙江省杭州萧山技师学院
出处
《浙江大学学报(农业与生命科学版)》
CAS
CSCD
北大核心
2017年第3期289-297,共9页
基金
国家自然科学基金(31200527)
浙江省农业新品种选育重大专项(2016C02056-13)
文摘
为了明确SOC1转录因子在红掌中的成员及作用机制,采用5'/3'末端快速扩增技术获得这2个SOC1基因的完整编码区,通过生物信息学软件分析这2个基因的相关信息,并结合荧光定量反转录-聚合酶链式反应验证这2个基因的表达模式。结果显示:获得的2个基因核苷酸长度分别为651 bp和642 bp,命名为Aa SOC1-1和Aa SOC1-2;2个转录因子在二级结构上均有螺旋、折叠和转角,未发现其他结构。系统进化分析显示,二者与单子叶植物同类蛋白距离较近,与红掌的植物学分类地位一致。表达分析结果显示,2个基因均在营养器官和生殖器官中表达,但表达水平略有差异。研究认为,从红掌中克隆的2个SOC1转录因子可能定位于线粒体而非细胞核中,二者在序列组成和表达模式上既有保守性也存在一定的差异性,预示它们在功能上可能也存在一定的区别。
关键词
红掌
SOC1基因
生物信息学
表达分析
Keywords
Anthurium
SOC1 gene
bioinformatics
expression analysis
分类号
S682.14 [农业科学—观赏园艺]
Q943.2 [生物学—植物学]
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题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
红掌2个SOC1基因的克隆、序列与表达分析
马广莹
朱开元
史小华
邹清成
刘慧春
詹菁
田丹青
《浙江大学学报(农业与生命科学版)》
CAS
CSCD
北大核心
2017
6
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