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华东部分农村地区结核分枝杆菌的VNTR-MIRU分子特征
1
作者
刘美伶
王学高
+5 位作者
周碧波
陆怀初
杨尚波
蒋伟利
刘媛
王伟炳
《复旦学报（医学版）》
CAS
CSCD
北大核心
2013年第4期400-406,共7页
目的评价VNTR-MIRU分型方法在结核病流行病学中的应用,并描述华东部分农村地区结核分枝杆菌的基因型分布及成簇特征。方法对浙江省宁波市鄞州区及江苏省盐城市阜宁县从2009年6月1日至2010年11月31日登记的结核病患者的结核分离菌株采用V...
目的评价VNTR-MIRU分型方法在结核病流行病学中的应用,并描述华东部分农村地区结核分枝杆菌的基因型分布及成簇特征。方法对浙江省宁波市鄞州区及江苏省盐城市阜宁县从2009年6月1日至2010年11月31日登记的结核病患者的结核分离菌株采用VNTR-MIRU方法进行分型,通过Hunter-Gaston指数(HGI)及遗传差异值(h)对MIRU位点进行分辨力及遗传差异性评价,同时进行问卷调查以收集患者的社会人口学及临床治疗信息。结果在297株结核杆菌分离株中发现了281种基因型,近期传播比例为5.4%,MIRU位点组合的分辨力(HGI)为0.9995,7个位点的分辨力大小依次为:VNTR3820>Qub18>Qub11a>MIRU26>Qub11b>Mtub21>Qub26,位点的h大小排序与分辨力的大小排序相同,遗传差异性最大的位点为VNTR3820(h=0.8794),最小的为Qub26(h=0.6613)。比较两个研究地区的结核枝杆菌成簇特征,阜宁县菌株成簇率为19%,而鄞州区无菌株成簇,均呈现"唯一"基因型,这种差异的产生很可能与当地的人口迁徙有关。结论 7位点VNTR-MIRU分型法对结核枝杆菌进行分型简便快速,而且具有较高的分辨力,适合于结核的大规模快速检测。我国华东农村地区结核的流行以既往感染复燃为主,并存在一定比例的近期传播。
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关键词
结核分枝杆菌
VNTR-MIRU
基因分型
成簇
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题名
华东部分农村地区结核分枝杆菌的VNTR-MIRU分子特征
1
作者
刘美伶
王学高
周碧波
陆怀初
杨尚波
蒋伟利
刘媛
王伟炳
机构
复旦大学公共卫生学院流行病学教研室-公共卫生安全教育部重点实验室
江苏省盐城市阜宁县
疾病预防控制中心
浙江省宁波市鄞州区疾病预防控制中心
出处
《复旦学报（医学版）》
CAS
CSCD
北大核心
2013年第4期400-406,共7页
基金
国家自然科学基金项目(30800937)
教育部留学回国人员科研启动基金项目
上海市公共卫生重点学科建设计划(12GWZX0101)~~
文摘
目的评价VNTR-MIRU分型方法在结核病流行病学中的应用,并描述华东部分农村地区结核分枝杆菌的基因型分布及成簇特征。方法对浙江省宁波市鄞州区及江苏省盐城市阜宁县从2009年6月1日至2010年11月31日登记的结核病患者的结核分离菌株采用VNTR-MIRU方法进行分型,通过Hunter-Gaston指数(HGI)及遗传差异值(h)对MIRU位点进行分辨力及遗传差异性评价,同时进行问卷调查以收集患者的社会人口学及临床治疗信息。结果在297株结核杆菌分离株中发现了281种基因型,近期传播比例为5.4%,MIRU位点组合的分辨力(HGI)为0.9995,7个位点的分辨力大小依次为:VNTR3820>Qub18>Qub11a>MIRU26>Qub11b>Mtub21>Qub26,位点的h大小排序与分辨力的大小排序相同,遗传差异性最大的位点为VNTR3820(h=0.8794),最小的为Qub26(h=0.6613)。比较两个研究地区的结核枝杆菌成簇特征,阜宁县菌株成簇率为19%,而鄞州区无菌株成簇,均呈现"唯一"基因型,这种差异的产生很可能与当地的人口迁徙有关。结论 7位点VNTR-MIRU分型法对结核枝杆菌进行分型简便快速,而且具有较高的分辨力,适合于结核的大规模快速检测。我国华东农村地区结核的流行以既往感染复燃为主,并存在一定比例的近期传播。
关键词
结核分枝杆菌
VNTR-MIRU
基因分型
成簇
Keywords
Mycobacterium tuberculosis
VNTR-MIRU
genotyping
clustering
分类号
R378.911 [医药卫生—病原生物学]
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作者
出处
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1
华东部分农村地区结核分枝杆菌的VNTR-MIRU分子特征
刘美伶
王学高
周碧波
陆怀初
杨尚波
蒋伟利
刘媛
王伟炳
《复旦学报（医学版）》
CAS
CSCD
北大核心
2013
0
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